馬鈴薯晚疫病抗性基因Rpi-blb2基因家族進(jìn)化分析
發(fā)布時(shí)間:2017-05-29 23:10
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【摘要】:馬鈴薯晚疫病是馬鈴薯最主要最嚴(yán)重的病害之一。馬鈴薯抗晚疫病基因Rpi-blb2是已鑒定的一個(gè)具有廣譜抗性的NBS-LRR類型的基因。該基因與其余兩個(gè)NBS-LRR類型的抗病基因Mi-1.2和Cami構(gòu)成了一個(gè)非常特殊的植物抗性基因家族,這3個(gè)基因在3種不同的茄科植物寄主中能夠抵抗4個(gè)親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的病原菌和害蟲。為了解釋這種現(xiàn)象,我們對(duì)這一基因家族展開了一系列的研究。首先我們從辣椒,番茄和馬鈴薯的基因組中得到這一基因家族的同源基因。這個(gè)基因家族在不同物種中拷貝數(shù)目差異較大,同時(shí)物種之間和物種內(nèi)核苷酸差異度也很大。為了獲得這個(gè)家族中更多的關(guān)于抗性基因的信息,我們從16個(gè)野生品種和栽培馬鈴薯品種中克隆了121個(gè)Rpi-blb2基因的LRR區(qū)域并從分子水平上對(duì)其進(jìn)行了遺傳進(jìn)化分析。研究發(fā)現(xiàn),LRR同源序列之間存在頻繁的拷貝數(shù)目變異和高差異度的現(xiàn)象。此外,種內(nèi)之間的差異度能夠達(dá)到種間差異度的水平,同時(shí),在這些LRR區(qū)域我們還檢測(cè)到頻繁的移碼突變和大量的基因轉(zhuǎn)換事件。我們的研究發(fā)現(xiàn)Rpi-blb2這個(gè)基因家族含有非常豐富的遺傳變異,尤其是在LRR區(qū)域。與其他已報(bào)道的例子相結(jié)合,我們推測(cè)同一基因家族中抗性基因?qū)Χ喾N不同病原菌產(chǎn)生抗性有可能是一個(gè)普遍現(xiàn)象。本研究為對(duì)多重抗性的抗病基因家族的研究提供了一個(gè)示例,同時(shí)為探索和鑒定更多新的抗病基因提供了有力的線索。
【關(guān)鍵詞】:植物抗性基因 Rpi-blb2 LRR區(qū)域
【學(xué)位授予單位】:南京大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:S435.32
【目錄】:
- 摘要3-4
- Abstract4-8
- 第一章:緒論-馬鈴薯晚疫病抗病基因研究綜述8-20
- 1.1 前言8-9
- 1.2 馬鈴薯晚疫病的概述9-10
- 1.3 馬鈴薯晚疫病抗性基因的特點(diǎn)10-14
- 1.3.1 植物抗病基因的分類10-12
- 1.3.2 已鑒定馬鈴薯抗晚疫病基因12-14
- 1.4 馬鈴薯晚疫病抗性基因的免疫反應(yīng)14-17
- 1.4.1 分子模式誘導(dǎo)的免疫反應(yīng)14-16
- 1.4.2 效應(yīng)因子誘導(dǎo)的免疫反應(yīng)16-17
- 1.5 馬鈴薯晚疫病抗性基因的遺傳進(jìn)化分析17-18
- 1.6 本研究的背景、目的和意義18-20
- 第二章:馬鈴薯晚疫病抗性基因Rpi-blb2基因家族進(jìn)化分析20-35
- 2.1 引言20-21
- 2.2 材料與方法21-24
- 2.2.1 數(shù)據(jù)收集和Rpi-blb2同源基因的鑒定21-22
- 2.2.2 植物材料22
- 2.2.3 PCR擴(kuò)增和DNA序列鑒定22-23
- 2.2.4 序列比對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化樹分析23-24
- 2.3 結(jié)果24-32
- 2.3.1 茄科中Rpi-blb2同源基因的特征24-25
- 2.3.2 馬鈴薯、番茄和辣椒中Rpi-blb2同源基因的系統(tǒng)進(jìn)化分析25-26
- 2.3.3 馬鈴薯中LRR區(qū)域的核苷酸多態(tài)性分析26-29
- 2.3.4. LRR區(qū)域受到多樣性選擇的作用29-32
- 2.4. 討論32-34
- 2.4.1. 種內(nèi)和種間拷貝數(shù)目的差異32
- 2.4.2 LRR區(qū)域的多樣性選擇32-33
- 2.4.3 新抗病基因的預(yù)測(cè)33-34
- 2.5. 結(jié)論34-35
- 參考文獻(xiàn)35-49
- 致謝49-50
- 附錄50-55
【相似文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 安新民,張上隆,徐昌杰;柑桔轉(zhuǎn)化酶基因家族新成員的克隆和序列分析[J];上海交通大學(xué)學(xué)報(bào)(農(nóng)業(yè)科學(xué)版);2003年01期
2 牛艷梅;沈文濤;周鵬;;Expansin超級(jí)家族的進(jìn)化與命名[J];廣東農(nóng)業(yè)科學(xué);2007年08期
3 魏云虎;張煜s
本文編號(hào):405900
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