目的:成釉細胞瘤(ameloblastoma)是一種口腔頜面部常見的良性牙源性腫瘤。不同于一般的良性腫瘤,成釉細胞具有侵襲性,這導致其術后具有較高的復發(fā)率。lncRNA(long non-coding RNA,長鏈非編碼RNA)是指長度大于200個堿基對的非編碼RNA,廣泛參與了腫瘤發(fā)生、增殖、侵襲、轉移過程的調控。而目前尚未有關于lncRNA在成釉細胞瘤侵襲過程中研究。第二代高通量全轉錄測序是一種可以對編碼RNA及非編碼RNA進行檢測的技術手段。運用高通量測序手段對腫瘤lncRNA及其靶基因進行篩選與預測是目前腫瘤學研究中的常用研究手段。方法:1.收集新鮮成釉細胞瘤及其瘤旁組織14對,冷凍保存。使用全轉錄測序技術測序8對樣本。通過生物信息學分析,對于成釉細胞瘤侵襲相關的lncRNA及基因進行篩選與預測。2.對篩選出的lncRNA及其靶基因進行實時定量PCR(Real-timePCR)檢測。驗證分析其表達量的變化。結果:1.通過基因測序,我們共篩選出出110對lncRNA-靶基因調控組合。再進一步通過基因功能分析,我們篩選出LINC01007-COL26A1 、 LOC284080-IT...

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圖1T-1質量分數(shù)Fig.1QualitysaoreofT-1

上海交通大學醫(yī)學院碩士學位論文15第三章結果3.1全轉錄測序及生物信息學分析結果3.1.1使用Fast-QC軟件對測序結果進行質量檢查圖1為T-1標本的質量分數(shù)分布。橫軸表示序列堿基數(shù)的范圍，縱軸表示質量分數(shù)�？梢奣-1標本測序結果與人類基因組匹配程度較高。GC含量分布分析是指通....

圖2T-1GC含量分布

上海交通大學醫(yī)學院碩士學位論文16表3質量分析結果Tabe3TheresultofQualityanalysis標本名稱最小質量分數(shù)GC含量分布分析過濾片段留存率T-136.2PASS0.962618701N-135.8PASS0.963499108T-235.7PASS0.96....

圖4差異表達的lncRNAFig.4DifferentexpressionlncRNA

上海交通大學醫(yī)學院碩士學位論文達601個。在上調表達的lncRNA中，表達差異最為明顯的是GLIS3-AS1，其Log2FC達到22.8。在下調表達的lncRNA中，表達差異最為明顯的是NPY6R，其Log2FC達到-25.0。圖4反應了lncRN....

圖3差異表達的mRNAFig.3DifferentexpressionmRNA

上海交通大學醫(yī)學院碩士學位論文達601個。在上調表達的lncRNA中，表達差異最為明顯的是GLIS3-AS1，其Log2FC達到22.8。在下調表達的lncRNA中，表達差異最為明顯的是NPY6R，其Log2FC達到-25.0。圖4反應了lncRN....

本文編號：4033053