目的:成釉細(xì)胞瘤(ameloblastoma)是一種口腔頜面部常見的良性牙源性腫瘤。不同于一般的良性腫瘤,成釉細(xì)胞具有侵襲性,這導(dǎo)致其術(shù)后具有較高的復(fù)發(fā)率。lncRNA(long non-coding RNA,長(zhǎng)鏈非編碼RNA)是指長(zhǎng)度大于200個(gè)堿基對(duì)的非編碼RNA,廣泛參與了腫瘤發(fā)生、增殖、侵襲、轉(zhuǎn)移過程的調(diào)控。而目前尚未有關(guān)于lncRNA在成釉細(xì)胞瘤侵襲過程中研究。第二代高通量全轉(zhuǎn)錄測(cè)序是一種可以對(duì)編碼RNA及非編碼RNA進(jìn)行檢測(cè)的技術(shù)手段。運(yùn)用高通量測(cè)序手段對(duì)腫瘤lncRNA及其靶基因進(jìn)行篩選與預(yù)測(cè)是目前腫瘤學(xué)研究中的常用研究手段。方法:1.收集新鮮成釉細(xì)胞瘤及其瘤旁組織14對(duì),冷凍保存。使用全轉(zhuǎn)錄測(cè)序技術(shù)測(cè)序8對(duì)樣本。通過生物信息學(xué)分析,對(duì)于成釉細(xì)胞瘤侵襲相關(guān)的lncRNA及基因進(jìn)行篩選與預(yù)測(cè)。2.對(duì)篩選出的lncRNA及其靶基因進(jìn)行實(shí)時(shí)定量PCR(Real-timePCR)檢測(cè)。驗(yàn)證分析其表達(dá)量的變化。結(jié)果:1.通過基因測(cè)序,我們共篩選出出110對(duì)lncRNA-靶基因調(diào)控組合。再進(jìn)一步通過基因功能分析,我們篩選出LINC01007-COL26A1 、 LOC284080-IT...

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【學(xué)位級(jí)別】：碩士

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圖1T-1質(zhì)量分?jǐn)?shù)Fig.1QualitysaoreofT-1

上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文15第三章結(jié)果3.1全轉(zhuǎn)錄測(cè)序及生物信息學(xué)分析結(jié)果3.1.1使用Fast-QC軟件對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行質(zhì)量檢查圖1為T-1標(biāo)本的質(zhì)量分?jǐn)?shù)分布。橫軸表示序列堿基數(shù)的范圍，縱軸表示質(zhì)量分?jǐn)?shù)�？梢奣-1標(biāo)本測(cè)序結(jié)果與人類基因組匹配程度較高。GC含量分布分析是指通....

圖2T-1GC含量分布

上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文16表3質(zhì)量分析結(jié)果Tabe3TheresultofQualityanalysis標(biāo)本名稱最小質(zhì)量分?jǐn)?shù)GC含量分布分析過濾片段留存率T-136.2PASS0.962618701N-135.8PASS0.963499108T-235.7PASS0.96....

圖4差異表達(dá)的lncRNAFig.4DifferentexpressionlncRNA

上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文達(dá)601個(gè)。在上調(diào)表達(dá)的lncRNA中，表達(dá)差異最為明顯的是GLIS3-AS1，其Log2FC達(dá)到22.8。在下調(diào)表達(dá)的lncRNA中，表達(dá)差異最為明顯的是NPY6R，其Log2FC達(dá)到-25.0。圖4反應(yīng)了lncRN....

圖3差異表達(dá)的mRNAFig.3DifferentexpressionmRNA

上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文達(dá)601個(gè)。在上調(diào)表達(dá)的lncRNA中，表達(dá)差異最為明顯的是GLIS3-AS1，其Log2FC達(dá)到22.8。在下調(diào)表達(dá)的lncRNA中，表達(dá)差異最為明顯的是NPY6R，其Log2FC達(dá)到-25.0。圖4反應(yīng)了lncRN....

本文編號(hào)：4033053