9個玉米DOF基因?qū)δ婢趁{迫的響應(yīng)模式分析
發(fā)布時間:2024-12-01 06:13
植物DOF (DNA-binding with one zinc finger)鋅指蛋白是植物特有的一類轉(zhuǎn)錄因子,在植物生長發(fā)育及代謝途徑中發(fā)揮著重要作用。該研究采用qRT-PCR方法分析了玉米應(yīng)答逆境(鹽、干旱、硝態(tài)氮缺乏和銨態(tài)氮缺乏)脅迫條件下9個ZmDOFs基因的表達模式。結(jié)果表明:(1)生物信息學(xué)分析顯示,9個ZmDOF基因散布于5個染色體上,聚類為一個基因亞家族,且9個基因還可以細(xì)分為4個小亞家族。(2)9個ZmDOFs基因的表達具有組織特異性,且主要在玉米的穗和雄花中表達,其中ZmDOF1、ZmDOF4、ZmDOF11和ZmDOF12在穗部的表達量分別是根部的18倍、60倍、11倍和75倍以上,ZmDOF19、ZmDOF26、ZmDOF27和ZmDOF42在雄花中的表達量分別是根部的360倍、28倍、13倍和44倍以上,推測這些基因在玉米的雄花和穗的生長發(fā)育進程中具有重要的作用。(3)實時定量qRT-PCR方法顯示,在硝態(tài)氮脅迫下有7個ZmDOFs基因強烈誘導(dǎo)表達(>5倍),其中ZmDOF12、ZmDOF27和ZmDOF42基因的表達超過10倍,表明這些基因參與調(diào)控硝...
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本文編號:4013663
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圖2 玉米9個ZmDOFs的進化樹分析
表2玉米9個ZmDOFs的生物信息Table2Bioinformationof9ZmDOFs基因名稱Genename基因位點Genelocus大小Size/aa分子量MW/kDa等電點pI染色體位置Chromosomeposition可變剪切Spl....
圖1 玉米9個ZmDOF基因的基本信息
圖2玉米9個ZmDOFs的進化樹分析利用在線軟件MEME來預(yù)測這9個蛋白主要的功能基序,檢測到6個功能基序(圖3,A),其中Motif1和Motif3分布于所有的9個蛋白中。Motif1主要包含有鋅指結(jié)構(gòu)CX2CX21CX2C,是植物DOF蛋白典型的功能基序,可能參與基因順式....
圖3 玉米9個ZmDOF保守蛋白基序分布示意圖
相比之下,在銨態(tài)氮脅迫下,這些基因的表達量變化幅度要小很多。圖8結(jié)果顯示,有7個基因(ZmDOF1、ZmDOF4、ZmDOF11、ZmDOF12、ZmDOF19、ZmDOF27和ZmDOF42)受銨態(tài)氮脅迫的強烈誘導(dǎo)(>2倍)。ZmDOF4受銨態(tài)氮脅迫誘導(dǎo)的幅度最大,其表達量....
圖4 玉米9個ZmDOF基因在玉米不同器官中的表達分析
圖3玉米9個ZmDOF保守蛋白基序分布示意圖圖5NaCl溶液脅迫處理下9個ZmDOFs的表達模式分析
本文編號:4013663
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