植物DOF (DNA-binding with one zinc finger)鋅指蛋白是植物特有的一類轉(zhuǎn)錄因子,在植物生長(zhǎng)發(fā)育及代謝途徑中發(fā)揮著重要作用。該研究采用qRT-PCR方法分析了玉米應(yīng)答逆境(鹽、干旱、硝態(tài)氮缺乏和銨態(tài)氮缺乏)脅迫條件下9個(gè)ZmDOFs基因的表達(dá)模式。結(jié)果表明:(1)生物信息學(xué)分析顯示,9個(gè)ZmDOF基因散布于5個(gè)染色體上,聚類為一個(gè)基因亞家族,且9個(gè)基因還可以細(xì)分為4個(gè)小亞家族。(2)9個(gè)ZmDOFs基因的表達(dá)具有組織特異性,且主要在玉米的穗和雄花中表達(dá),其中ZmDOF1、ZmDOF4、ZmDOF11和ZmDOF12在穗部的表達(dá)量分別是根部的18倍、60倍、11倍和75倍以上,ZmDOF19、ZmDOF26、ZmDOF27和ZmDOF42在雄花中的表達(dá)量分別是根部的360倍、28倍、13倍和44倍以上,推測(cè)這些基因在玉米的雄花和穗的生長(zhǎng)發(fā)育進(jìn)程中具有重要的作用。(3)實(shí)時(shí)定量qRT-PCR方法顯示,在硝態(tài)氮脅迫下有7個(gè)ZmDOFs基因強(qiáng)烈誘導(dǎo)表達(dá)(>5倍),其中ZmDOF12、ZmDOF27和ZmDOF42基因的表達(dá)超過10倍,表明這些基因參與調(diào)控硝...

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圖2 玉米9個(gè)ZmDOFs的進(jìn)化樹分析

表2玉米9個(gè)ZmDOFs的生物信息Table2Bioinformationof9ZmDOFs基因名稱Genename基因位點(diǎn)Genelocus大小Size/aa分子量MW/kDa等電點(diǎn)pI染色體位置Chromosomeposition可變剪切Spl....

圖1 玉米9個(gè)ZmDOF基因的基本信息

圖2玉米9個(gè)ZmDOFs的進(jìn)化樹分析利用在線軟件MEME來預(yù)測(cè)這9個(gè)蛋白主要的功能基序,檢測(cè)到6個(gè)功能基序(圖3,A),其中Motif1和Motif3分布于所有的9個(gè)蛋白中。Motif1主要包含有鋅指結(jié)構(gòu)CX2CX21CX2C,是植物DOF蛋白典型的功能基序,可能參與基因順式....

圖3 玉米9個(gè)ZmDOF保守蛋白基序分布示意圖

相比之下,在銨態(tài)氮脅迫下,這些基因的表達(dá)量變化幅度要小很多。圖8結(jié)果顯示,有7個(gè)基因(ZmDOF1、ZmDOF4、ZmDOF11、ZmDOF12、ZmDOF19、ZmDOF27和ZmDOF42)受銨態(tài)氮脅迫的強(qiáng)烈誘導(dǎo)(>2倍)。ZmDOF4受銨態(tài)氮脅迫誘導(dǎo)的幅度最大,其表達(dá)量....

圖4 玉米9個(gè)ZmDOF基因在玉米不同器官中的表達(dá)分析

圖3玉米9個(gè)ZmDOF保守蛋白基序分布示意圖圖5NaCl溶液脅迫處理下9個(gè)ZmDOFs的表達(dá)模式分析

本文編號(hào)：4013663