基于基因芯片技術(shù)對椎間盤退變關(guān)鍵基因鑒定分析
發(fā)布時間:2024-04-24 19:43
目的本研究旨在鑒定分析椎間盤退變患者纖維環(huán)(annulus fibrosus,AF)、髓核(nucleus pulposus,NP)和全血(whole blood,WB)的差異表達基因(differentially expressed genes,DEGs)。方法從GEO數(shù)據(jù)庫中檢索到包含24個AF和24個NP樣本的基因表達譜的芯片數(shù)據(jù)集GSE70362,并將AF和NP樣本中的DEGs與非退行性樣本進行了比較。檢測了椎間盤退變(Intervertebral disc degeneration,IDD)和健康志愿者WB中的基因表達譜,以確定WB中的DEGs。采用實時熒光定量PCR(Real time quantitative PCR,QRT-PCR)驗證了WB中部分DEGs的表達水平。結(jié)果最后共鑒定出846個AF-DEGs、902個NPDEGs和862個WB-DEGs,3組共22個相同的DEGs。蛋白二硫鍵異構(gòu)酶A4 (protein disulfide isomerase family A member 4,PDIA4)、肽基脯氨酰順反異構(gòu)酶11(FK506 BINDING PROTE...
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本文編號:3963429
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圖1PDIA4、FKBP11、ENPP4、SOD2、ABLIM1在椎間盤退變(IDD)患者與健康志愿者WB中表達水平比較
用WB進行蛋白二硫鍵異構(gòu)酶A4(proteindisulfideisomerasefamilyAmember4,PDIA4)、肽基脯氨酰順反異構(gòu)酶11(FK506BINDINGPROTEIN11,FKBP11)、外核苷酸焦磷酸酶/磷酸二酯酶4(ectonu....
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