建立一種實時熒光PCR對維生素D受體基因單核苷酸多態(tài)性快速分型
發(fā)布時間:2024-04-21 19:09
目的:建立實時熒光PCR快速檢測維生素D受體(VDR)基因rs2228570、rs1544410、rs7975232位點多態(tài)性。方法:以VDR基因的rs2228570、rs1544410、rs7975232三個SNP位點的變異堿基分別設計并合成特異性引物。11例體檢健康兒童血液標本作為檢測樣本,采用實時熒光PCR方法檢測樣本中VDR基因型,采用Sanger法對檢測結果測序驗證。結果:利用所設計的特異性引物對人全血基因組中VDR進行SNP位點特異性擴增,根據(jù)7500 FAST實時熒光PCR儀的分析結果得到基因型,與測序結果比對后發(fā)現(xiàn),11個樣本采用實時熒光PCR方法基因分型結果與測序結果均一致。結論:實時熒光PCR快速檢測VDR基因rs2228570、rs1544410、rs7975232位點多態(tài)性的方法或可用于臨床VDR基因SNP快速分型。
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本文編號:3961330
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圖1ARMS-PCR對VDR基因的rs7975232位點分型
VDR基因的rs7975232位點分型結果如圖1,該位點有三種基因型,即CA型、AA型和CC型,CA型雜合子模板可以同時被野生型-VDR-rs7975232-R引物和突變型-VDR-rs7975232-R引物擴增出產物,且擴增效率一致,ARMS-PCR分型結果與測序分型結果一致(....
圖2ARMS-PCR對VDR基因的rs1544410位點分型
VDR基因的rs2228570位點分型結果如圖3所示,該位點有三種基因型,即GG型、AA型和GA型,GG型純合子模板被野生型-VDR-rs2228570-R引物和突變型-VDR-rs2228570-R引物均擴增出產物,但突變型-VDR-rs2228570-R引物擴增效率更高,結果....
圖3ARMS-PCR對VDR基因的rs2228570位點分型
圖2ARMS-PCR對VDR基因的rs1544410位點分型3討論
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