建立一種實(shí)時(shí)熒光PCR對(duì)維生素D受體基因單核苷酸多態(tài)性快速分型
發(fā)布時(shí)間:2024-04-21 19:09
目的:建立實(shí)時(shí)熒光PCR快速檢測維生素D受體(VDR)基因rs2228570、rs1544410、rs7975232位點(diǎn)多態(tài)性。方法:以VDR基因的rs2228570、rs1544410、rs7975232三個(gè)SNP位點(diǎn)的變異堿基分別設(shè)計(jì)并合成特異性引物。11例體檢健康兒童血液標(biāo)本作為檢測樣本,采用實(shí)時(shí)熒光PCR方法檢測樣本中VDR基因型,采用Sanger法對(duì)檢測結(jié)果測序驗(yàn)證。結(jié)果:利用所設(shè)計(jì)的特異性引物對(duì)人全血基因組中VDR進(jìn)行SNP位點(diǎn)特異性擴(kuò)增,根據(jù)7500 FAST實(shí)時(shí)熒光PCR儀的分析結(jié)果得到基因型,與測序結(jié)果比對(duì)后發(fā)現(xiàn),11個(gè)樣本采用實(shí)時(shí)熒光PCR方法基因分型結(jié)果與測序結(jié)果均一致。結(jié)論:實(shí)時(shí)熒光PCR快速檢測VDR基因rs2228570、rs1544410、rs7975232位點(diǎn)多態(tài)性的方法或可用于臨床VDR基因SNP快速分型。
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本文編號(hào):3961330
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圖1ARMS-PCR對(duì)VDR基因的rs7975232位點(diǎn)分型
VDR基因的rs7975232位點(diǎn)分型結(jié)果如圖1,該位點(diǎn)有三種基因型,即CA型、AA型和CC型,CA型雜合子模板可以同時(shí)被野生型-VDR-rs7975232-R引物和突變型-VDR-rs7975232-R引物擴(kuò)增出產(chǎn)物,且擴(kuò)增效率一致,ARMS-PCR分型結(jié)果與測序分型結(jié)果一致(....
圖2ARMS-PCR對(duì)VDR基因的rs1544410位點(diǎn)分型
VDR基因的rs2228570位點(diǎn)分型結(jié)果如圖3所示,該位點(diǎn)有三種基因型,即GG型、AA型和GA型,GG型純合子模板被野生型-VDR-rs2228570-R引物和突變型-VDR-rs2228570-R引物均擴(kuò)增出產(chǎn)物,但突變型-VDR-rs2228570-R引物擴(kuò)增效率更高,結(jié)果....
圖3ARMS-PCR對(duì)VDR基因的rs2228570位點(diǎn)分型
圖2ARMS-PCR對(duì)VDR基因的rs1544410位點(diǎn)分型3討論
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