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小麥中兩種通道蛋白AQP和MTP基因家族生物信息學(xué)分析及候選基因功能驗(yàn)證

發(fā)布時(shí)間:2024-04-21 16:54
  小麥?zhǔn)侨蜃钪匾募Z食作物,干旱、鹽以及重金屬脅迫是使其生長和產(chǎn)量受到嚴(yán)重影響的制約因素。水通道蛋白(AQP)選擇性控制水和其他小分子通過細(xì)胞膜的流動,對于植物的一些生理過程(包括非生物脅迫反應(yīng))至關(guān)重要。金屬耐性蛋白(MTP)通過吸收和流出胞質(zhì)溶膠中的金屬來維持植物體內(nèi)的金屬穩(wěn)態(tài)。在這項(xiàng)試驗(yàn)中,通過多種生物信息學(xué)方法鑒定并分析了127個(gè)非冗余的小麥水通道蛋白基因(TaAQP)及其4個(gè)可變剪接變體,和小麥基因組中的47個(gè)TaMTP基因。TaAQP主要分為PIP、TIP、NIP和SIP四個(gè)亞家族,TaAQPs均屬于主要內(nèi)在蛋白(MIP),TaAQP基因RNA-seq數(shù)據(jù)揭示了小麥AQP基因的特異性表達(dá)模式。具體而言,Ta TIP和Ta PIP比Ta NIP和Ta SIP表達(dá)水平更高。q RT-PCR分析表明,當(dāng)小麥遭受干旱和鹽脅迫時(shí),Ta NIP4;033D,Ta TIP2;02b7B,Ta SIP2;024A,Ta NIP3;036D和Ta NIP2;04a7D的幾種AQPs基...

【文章頁數(shù)】:112 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖2-1AQPs氨基酸序列的系統(tǒng)發(fā)育分析

圖2-1AQPs氨基酸序列的系統(tǒng)發(fā)育分析

43圖2-1AQPs氨基酸序列的系統(tǒng)發(fā)育分析A:小麥水通道蛋白家族與擬南芥、玉米和水稻的系統(tǒng)發(fā)育分析;B:六倍體小麥及其亞基因組供體水通道蛋白的系統(tǒng)發(fā)育分析;C:小麥及其近緣種大麥和二穗短柄草水通道蛋白的系統(tǒng)發(fā)育分析;D:小麥水通道蛋白家族的系統(tǒng)發(fā)育分析Fig.2-1phylog....


圖2-2小麥水通道蛋白保守基序和基因結(jié)構(gòu)分析

圖2-2小麥水通道蛋白保守基序和基因結(jié)構(gòu)分析

45圖2-2小麥水通道蛋白保守基序和基因結(jié)構(gòu)分析A:保守基序分析;B:基因結(jié)構(gòu)分析Fig.2-2AnalysisofconservedmotifandgenestructureofwheataquaporinA:Conservativemotifanalysis;B:geneti....


圖2-3六倍體小麥的亞基因組供體水通道蛋白保守基序和基因結(jié)構(gòu)分析

圖2-3六倍體小麥的亞基因組供體水通道蛋白保守基序和基因結(jié)構(gòu)分析

45圖2-2小麥水通道蛋白保守基序和基因結(jié)構(gòu)分析A:保守基序分析;B:基因結(jié)構(gòu)分析Fig.2-2AnalysisofconservedmotifandgenestructureofwheataquaporinA:Conservativemotifanalysis;B:geneti....


圖2-4小麥近緣種大麥和二穗短柄草水通道蛋白保守基序和基因結(jié)構(gòu)分析

圖2-4小麥近緣種大麥和二穗短柄草水通道蛋白保守基序和基因結(jié)構(gòu)分析

46Fig.2-3AnalysisofconservedmotifandgenestructureofdiploidandtetraploiddonoraquaporinsinhexaploidwheatA:Conservativemotifanalysis;B:genetics....



本文編號:3961174

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