本研究對3個白樺AP2/ERF家族基因進行了生物信息學(xué)分析,并研究了鹽和干旱脅迫下白樺ERF基因的表達模式。結(jié)果表明,bERF1和bERF2蛋白定位在細(xì)胞核內(nèi),而bERF3蛋白則定位在葉綠體上;三個基因都含有磷酸化位點;bERF1、bERF2和bERF3基因都屬于ERF家族的ERF亞家族,bERF1和bERF2屬于B-1組,與擬南芥的AT1G28360.1同源性最高,B-1組的擬南芥ERF基因都屬于轉(zhuǎn)錄抑制子,說明bERF1和bERF2基因可能具有轉(zhuǎn)錄抑制作用;bERF3屬于B-5組,與擬南芥的AT4G11140.1同源性最高。3個ERF基因都可以響應(yīng)鹽和干旱脅迫,并且在不同組織中表達量存在差異。

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【部分圖文】：

圖1ERF蛋白的磷酸化位點分析

通過軟件預(yù)測3個ERF蛋白的磷酸化位點，結(jié)果表明，bERF1蛋白共含有4個磷酸化位點，包括3個絲氨酸磷酸化位點，1個蘇氨酸磷酸化位點；bERF2蛋白含有16個磷酸化位點11個絲氨酸磷酸化位點，5個蘇氨酸磷酸化位點；bERF3蛋白含有11個絲氨酸磷酸化位點，6個蘇氨酸磷酸化位點，1....

圖2bERF1,bERF2和bERF3蛋白的三級結(jié)構(gòu)預(yù)測模型

3個白樺ERF基因和21個擬南芥ERF基因都具有1個保守的AP2結(jié)構(gòu)域，保守結(jié)構(gòu)域都包含3個β折疊和1個α螺旋，白樺ERF基因和擬南芥ERF基因具有較高的同源性。bERF1、bERF2和bERF3蛋白和部分?jǐn)M南芥ERF蛋白的14位和19位氨基酸是丙氨酸(A)和天冬氨酸(D)，說明....

圖3白樺和擬南芥ERF基因AP2結(jié)構(gòu)域的多序列比對

bERF1、bERF2和bERF3基因可以被NaCl脅迫所誘導(dǎo)，但在根、莖和葉中的表達模式存在差異。bERF1基因除了在葉和根的個別時間點外，在根、莖和葉中都呈下調(diào)表達趨勢，在莖中下調(diào)表達明顯，在脅迫6h時表達量最低，為對照表達量的0.12倍。bERF2和bERF3基因在葉中都....

圖4白樺和擬南芥ERF基因的系統(tǒng)進化分析

圖3白樺和擬南芥ERF基因AP2結(jié)構(gòu)域的多序列比對在PEG脅迫下，bERF1基因的表達模式與NaCl脅迫下表達模式相似，在根、莖、葉中基本都呈下調(diào)表達趨勢。bERF2基因在葉中呈上調(diào)表達趨勢，在脅迫6h時表達量最高，為對照的3.48倍，在根中的各時間點都呈明顯的下調(diào)表達趨勢....

本文編號：3948398