玉米大斑病菌Septin基因家族的鑒定與表達(dá)模式分析
發(fā)布時間:2024-03-02 15:19
【背景】隔膜蛋白Septin廣泛存在于除植物以外所有真核生物中,是高度保守的GTP結(jié)合蛋白家族,被認(rèn)為是繼微管、微絲和中間纖維之后的第4種細(xì)胞骨架蛋白。病原真菌的Septin蛋白參與細(xì)胞極性的確定、形態(tài)塑造及與致病相關(guān)的形態(tài)轉(zhuǎn)換。【目的】鑒定玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)Septin基因家族,并進(jìn)一步分析其在不同發(fā)育時期的表達(dá)模式,為明確隔膜蛋白Septin與真菌侵染結(jié)構(gòu)發(fā)育之間的關(guān)系打下基礎(chǔ)!痉椒ā恳杂衩仔“卟【(Bipolaris maydis)中6個Septin蛋白的氨基酸序列為探針,在玉米大斑病菌數(shù)據(jù)庫在線Blastp比對和關(guān)鍵詞搜索,獲得大斑病菌的候選Septin,對其基因結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)以及跨膜區(qū)結(jié)構(gòu)等方面進(jìn)行生物信息學(xué)分析。收集人造疏水介質(zhì)誘導(dǎo)下侵染結(jié)構(gòu)發(fā)育不同時期以及侵染感病寄主葉片不同時間的玉米大斑病菌材料,利用實(shí)時熒光定量PCR(real-time fluorescence quantitative PCR,RT-qPCR)技術(shù)系統(tǒng)分析Septin基因家族在玉米大斑病菌侵染結(jié)構(gòu)形成不同階段的轉(zhuǎn)錄水平!窘Y(jié)果】獲得了玉米大斑病菌6個候選Sep...
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本文編號:3917010
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圖1玉米大斑病菌Septin基因結(jié)構(gòu)
不同植物病原真菌Septin同源基因在氨基酸水平上呈現(xiàn)高度的相似性,系統(tǒng)發(fā)育樹分成兩個大的進(jìn)化支,玉米大斑病菌的StSep1、StSep2、StSep3、StSep4與不同病原真菌的核心Septin(Cdc3、Cdc10、Cdc11和Cdc12)聚于同一進(jìn)化支,而StS....
圖4玉米大斑病菌Septin的二級結(jié)構(gòu)特征
分析Septin基因家族在病菌侵染感病寄主葉片過程中的轉(zhuǎn)錄水平,以接種初期1h的基因表達(dá)水平為對照。結(jié)果表明,StSep1和StSep4的轉(zhuǎn)錄水平均呈現(xiàn)先上調(diào)后下調(diào)的變化趨勢。StSep1在接種后6h轉(zhuǎn)錄水平極顯著上調(diào)(P<0.01),隨后迅速下降,至接種后18h和2....
圖5Septin表達(dá)模式分析
圖4玉米大斑病菌Septin的二級結(jié)構(gòu)特征3討論
圖3Septin的保守結(jié)構(gòu)域分析
總體而言,相對分子質(zhì)量最大的是StSep4,相對分子質(zhì)量最小的是StSep1。StSep1的PI為7.20,屬于中性蛋白質(zhì);StSep2、StSep4的PI分別為5.07、6.56,屬于酸性蛋白質(zhì);StSep3的PI為8.54,屬于堿性蛋白質(zhì)(表4)。4個Septin....
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