發(fā)布時(shí)間：2024-02-24 19:22

　　細(xì)胞色素c過(guò)氧化物酶(cytochrome C peroxidase,Cc P)是細(xì)胞內(nèi)H2O2的主要降解酶,參與真菌的氧化應(yīng)答過(guò)程。本研究基于基因組數(shù)據(jù)獲得一個(gè)金針菇細(xì)胞色素c過(guò)氧化物酶編碼基因,命名為ffccp。該基因全長(zhǎng)1 913bp,包含一個(gè)1 098bp的完整開(kāi)放閱讀框,編碼365個(gè)氨基酸。生物信息學(xué)分析結(jié)果顯示,該基因編碼的蛋白質(zhì)(Ff Cc P)無(wú)跨膜結(jié)構(gòu)和信號(hào)肽,不形成二硫鍵結(jié)構(gòu),亞細(xì)胞定位于線粒體上,具備血紅素結(jié)合蛋白的保守位點(diǎn)。序列比對(duì)和進(jìn)化分析結(jié)果顯示,金針菇與糙皮側(cè)耳Pleurotus ostreatus等大型真菌的Cc P序列高度相似(相似度均超過(guò)70%),屬于Cc P家族蛋白。RT-q PCR的檢測(cè)結(jié)果顯示,氧化脅迫和損傷脅迫均能誘導(dǎo)ffccp基因上調(diào)表達(dá),但兩種脅迫對(duì)ffccp表達(dá)的調(diào)控機(jī)制可能并不相同。進(jìn)一步檢測(cè)ffccp在子實(shí)體發(fā)育過(guò)程中的差異表達(dá)情況,發(fā)現(xiàn)ffccp在伸長(zhǎng)期菌柄出現(xiàn)顯著上調(diào)表達(dá),且表達(dá)量與菌柄伸長(zhǎng)速度的相關(guān)性達(dá)到0.998,為極強(qiáng)正相關(guān)。推測(cè)ffccp的上調(diào)表達(dá)可能有利于菌柄的伸長(zhǎng)。

【文章頁(yè)數(shù)】：13 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 供試菌株
    1.2 基因組及轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)
    1.3 金針菇I類血紅素過(guò)氧化物酶注釋與基因序列分析
    1.4 氨基酸序列特征分析
    1.5 多序列比對(duì)與進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建
    1.6 樣品的處理與收集
        1.6.1 損傷脅迫處理：
        1.6.2 過(guò)氧化氫脅迫處理：
        1.6.3 子實(shí)體培養(yǎng)與取樣標(biāo)準(zhǔn)：
    1.7 RNA提取及定量PCR檢測(cè)基因相對(duì)表達(dá)量
    1.8 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
2 結(jié)果與分析
    2.1 金針菇I類血紅素過(guò)氧化物酶注釋與基因序列結(jié)構(gòu)
    2.2 金針菇Ff Cc P氨基酸序列及其生物信息學(xué)分析
    2.3 FfCcP的系統(tǒng)進(jìn)化與序列保守性分析
    2.4 金針菇ffccp基因在脅迫應(yīng)答過(guò)程中的差異表達(dá)
    2.5 金針菇ffccp基因在子實(shí)體發(fā)育過(guò)程的差異表達(dá)
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本文編號(hào)：3909502