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龍眼DlbZIP21基因克隆與表達分析

發(fā)布時間:2024-02-20 21:45
  【目的】分析bZIP轉(zhuǎn)錄因子基因DlbZIP21在石硤和四季蜜兩個龍眼品種不同組織和年周期表達水平的差異性,為揭示不同龍眼品種成花差異的分子調(diào)控機制提供理論依據(jù)!痉椒ā恳允埡退募久埤堁蹫樵嚥,克隆其DlbZIP21基因,并對其編碼蛋白理化性質(zhì)特性、磷酸化位點和結(jié)構(gòu)域進行生物信息學(xué)分析,利用實時熒光定量PCR分析該基因的時空表達特征!窘Y(jié)果】克隆獲得石硤和四季蜜龍眼DlbZIP21基因分別命名為DlbZIP21-sx和DlbZIP21-sj,其開放閱讀框(ORF)均為1353 bp,各編碼450個氨基酸殘基,預(yù)測蛋白質(zhì)分子量分別為49.80和49.81 kD,理論等電點均為6.53。BLAST比對和系統(tǒng)發(fā)育進化樹分析結(jié)果表明,DlbZIP21-sx與DlbZIP21-sj蛋白的同源性為99.78%,同時與大豆、水稻和菜豆的親緣關(guān)系較近。DlbZIP21基因在花芽中的表達量表現(xiàn)為四季蜜龍眼比石硤龍眼高5倍;在年周期中,從1~12月DlbZIP21基因在四季蜜龍眼中的表達量均普遍高于石硤龍眼,其中在花芽分化期和開花期(12月—翌年4月)的表達量高于石硤龍眼6~8倍!窘Y(jié)論】DlbZIP2...

【文章頁數(shù)】:7 頁

【部分圖文】:

圖1龍眼總RNA(A)和DlbZIP21(B)擴增序列的瓊脂糖凝膠電泳檢測結(jié)果

圖1龍眼總RNA(A)和DlbZIP21(B)擴增序列的瓊脂糖凝膠電泳檢測結(jié)果

以NCBI-CDS對2個DlbZIP21蛋白保守結(jié)構(gòu)域進行在線預(yù)測,結(jié)果(圖2)表明,兩個DlbZIP21蛋白保守結(jié)構(gòu)域相同,均屬于bZIP蛋白超家族[13],具有調(diào)節(jié)細胞發(fā)育功能,該結(jié)構(gòu)包括1個bZIP-HBP-1b結(jié)構(gòu)和1個DOG1結(jié)構(gòu)域,DOG1結(jié)構(gòu)域是一種特殊的植物種子....


圖2DlbZIP21編碼蛋白的保守功能域

圖2DlbZIP21編碼蛋白的保守功能域

圖1龍眼總RNA(A)和DlbZIP21(B)擴增序列的瓊脂糖凝膠電泳檢測結(jié)果2.4DlbZIP21蛋白磷酸化位點分析結(jié)果


圖3DlbZIP21蛋白磷酸位點預(yù)測結(jié)果

圖3DlbZIP21蛋白磷酸位點預(yù)測結(jié)果

從圖6還可看出,在不同組織中,DlbZIP21基因在2個龍眼品種的果皮和果肉中表達量均偏低,在四季蜜龍眼花芽中的表達量較在石硤龍眼花芽表達量高5倍;在年周期中,從1-12月DlbZIP21基因在兩個利用品種中的表達量總體上呈先上升后下降再上升的變化趨勢,在四季蜜龍眼中的表達量普遍....


圖4DlbZIP21與其他物種bZIP的氨基酸序列比對分析結(jié)果

圖4DlbZIP21與其他物種bZIP的氨基酸序列比對分析結(jié)果

圖3DlbZIP21蛋白磷酸位點預(yù)測結(jié)果圖5基于bZIP21氨基酸序列相似性構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育進化樹



本文編號:3904565

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