目的了解2018年青海省手足口病(HFMD)病原譜的構(gòu)成及基因特征,掌握HFMD主要致病原的流行規(guī)律。方法采集青海省HFMD患者的咽拭子標(biāo)本共713份,進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量檢測(cè)和病毒分離;對(duì)陽(yáng)性標(biāo)本進(jìn)行特異性引物核酸擴(kuò)增和測(cè)序分析,參考NCBI部分毒株序列構(gòu)建基因進(jìn)化樹(shù)。結(jié)果 2018年共采集臨床確診HFMD患者標(biāo)本713份,檢測(cè)到EV-A71型病毒9份,CVA16型病毒109份,CVA6型病毒510份,CVA10型病毒12份,CVA4型病毒5份,CVA2型病毒2份,柯薩奇B組病毒4份,陰性3份。其中CVA6病毒占總數(shù)的71.53%,CVA16病毒占15.29%。經(jīng)測(cè)序后選取典型的15株柯薩奇病毒A、B組基因序列進(jìn)行核酸序列分析,同源性在23.5%-100%之間,表明引起青海HFMD流行的非EV-A71、CVA16型柯薩奇病毒A、B組核酸序列不同基因型之間的變異性強(qiáng)。結(jié)論 2018年青海省HFMD病毒譜包括EV-A71、CVA16、CVA6等,主要為CVA6,其次是CVA16。

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圖1青海省2018HFMD病毒分離株與其它基因代表毒株的親緣性進(jìn)化樹(shù)

參照NCBI庫(kù)中比對(duì)結(jié)果，選取不同基因型的23株代表株作為參考基因序列，使用ClustaX鄰位法與測(cè)序得到的15株青海省非EV-A71、CVA16型分離株構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)，結(jié)果如圖1。進(jìn)化樹(shù)分為4個(gè)分支，CVA2和CVA4在一個(gè)大的分支上，青海省分離到的02/2018、89/201....

本文編號(hào)：3902023