KIT基因表達(dá)量通常與黑色素含量呈正比,通過(guò)3種毛色烏蘇里貉KIT基因轉(zhuǎn)錄本定量表達(dá)分析發(fā)現(xiàn),白貉KIT基因表達(dá)量較高,為探究烏蘇里貉KIT基因及編碼蛋白結(jié)構(gòu)特性,使用基于機(jī)器學(xué)習(xí)和神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)算法軟件對(duì)其編碼蛋白結(jié)構(gòu)作全面生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明,烏蘇里貉KIT基因編碼蛋白含有972個(gè)氨基酸,屬于酸性親水型蛋白,無(wú)規(guī)則卷曲為主要二級(jí)結(jié)構(gòu),存在兩個(gè)跨膜區(qū),細(xì)胞膜外側(cè)存在信號(hào)肽,含有21個(gè)糖基位點(diǎn),60個(gè)磷酸化位點(diǎn),4個(gè)保守結(jié)構(gòu)域,與5個(gè)蛋白密切作用,系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)構(gòu)建結(jié)果與生物學(xué)分類(lèi)一致。分析結(jié)果為進(jìn)一步研究烏蘇里貉KIT蛋白生物學(xué)特性奠定基礎(chǔ)。

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圖1烏蘇里貉KIT蛋白親水性和疏水性分析

在線(xiàn)工具Proscal分析親水性和疏水性結(jié)果表明，烏蘇里貉KIT基因編碼蛋白中疏水性氨基酸（Ala、Val、Leu、Ile、Phe、Trp、Met、Pro)399個(gè)，親水性氨基酸（Gly、Thr、Ser、Cys、Asn、Gln、Tyr、Lys、Arg、His、Asp、Glu)57....

圖2烏蘇里貉KIT蛋白跨膜區(qū)

在線(xiàn)SignalP軟件預(yù)測(cè)該蛋白質(zhì)信號(hào)肽結(jié)果顯示，該蛋白在第1～25位氨基酸為信號(hào)肽序列，因此推測(cè)該蛋白為分泌型蛋白（見(jiàn)圖3）。圖3烏蘇里貉KIT蛋白信號(hào)肽預(yù)測(cè)

圖3烏蘇里貉KIT蛋白信號(hào)肽預(yù)測(cè)

圖2烏蘇里貉KIT蛋白跨膜區(qū)2.5.2保守結(jié)構(gòu)域

圖4KIT蛋白結(jié)構(gòu)域

NCBIConservedDomain預(yù)測(cè)結(jié)果表明，烏蘇里貉KIT蛋白共有4個(gè)保守結(jié)構(gòu)域，包括2個(gè)免疫球蛋白結(jié)構(gòu)域（Ig），分別位于第216～305、426～505位氨基酸殘基，1個(gè)干細(xì)胞因子受體第四免疫球蛋白樣域（Ig4＿SCFR），位于第311～411位氨基酸殘基，1個(gè)蛋....

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