KIT基因表達量通常與黑色素含量呈正比,通過3種毛色烏蘇里貉KIT基因轉(zhuǎn)錄本定量表達分析發(fā)現(xiàn),白貉KIT基因表達量較高,為探究烏蘇里貉KIT基因及編碼蛋白結(jié)構(gòu)特性,使用基于機器學習和神經(jīng)網(wǎng)絡算法軟件對其編碼蛋白結(jié)構(gòu)作全面生物信息學分析。結(jié)果表明,烏蘇里貉KIT基因編碼蛋白含有972個氨基酸,屬于酸性親水型蛋白,無規(guī)則卷曲為主要二級結(jié)構(gòu),存在兩個跨膜區(qū),細胞膜外側(cè)存在信號肽,含有21個糖基位點,60個磷酸化位點,4個保守結(jié)構(gòu)域,與5個蛋白密切作用,系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建結(jié)果與生物學分類一致。分析結(jié)果為進一步研究烏蘇里貉KIT蛋白生物學特性奠定基礎(chǔ)。

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【部分圖文】：

圖1烏蘇里貉KIT蛋白親水性和疏水性分析

在線工具Proscal分析親水性和疏水性結(jié)果表明，烏蘇里貉KIT基因編碼蛋白中疏水性氨基酸（Ala、Val、Leu、Ile、Phe、Trp、Met、Pro)399個，親水性氨基酸（Gly、Thr、Ser、Cys、Asn、Gln、Tyr、Lys、Arg、His、Asp、Glu)57....

圖2烏蘇里貉KIT蛋白跨膜區(qū)

在線SignalP軟件預測該蛋白質(zhì)信號肽結(jié)果顯示，該蛋白在第1～25位氨基酸為信號肽序列，因此推測該蛋白為分泌型蛋白（見圖3）。圖3烏蘇里貉KIT蛋白信號肽預測

圖3烏蘇里貉KIT蛋白信號肽預測

圖2烏蘇里貉KIT蛋白跨膜區(qū)2.5.2保守結(jié)構(gòu)域

圖4KIT蛋白結(jié)構(gòu)域

NCBIConservedDomain預測結(jié)果表明，烏蘇里貉KIT蛋白共有4個保守結(jié)構(gòu)域，包括2個免疫球蛋白結(jié)構(gòu)域（Ig），分別位于第216～305、426～505位氨基酸殘基，1個干細胞因子受體第四免疫球蛋白樣域（Ig4＿SCFR），位于第311～411位氨基酸殘基，1個蛋....

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