基于基因表達(dá)數(shù)據(jù)的癌癥共性分析方法研究
發(fā)布時(shí)間:2024-01-29 06:17
癌癥是全世界主要的公共衛(wèi)生問(wèn)題之一,一直威脅著人們的生命和健康。癌癥的發(fā)生發(fā)展是非常復(fù)雜的過(guò)程,迄今人們也未能完全理解其發(fā)病機(jī)理。理解癌癥機(jī)制,發(fā)現(xiàn)癌癥治療和預(yù)防的方法一直以來(lái)都是人們追求的目標(biāo)。隨著人類(lèi)基因組計(jì)劃的完成以及高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,涌現(xiàn)出一大批癌癥細(xì)胞基因表達(dá)數(shù)據(jù),為癌癥研究提供了數(shù)據(jù)基礎(chǔ),同時(shí)為理解癌癥機(jī)制打開(kāi)了新的視角。細(xì)胞信號(hào)通路和新陳代謝活動(dòng)發(fā)生異常都會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞活動(dòng)狀態(tài)的紊亂,進(jìn)而可能導(dǎo)致生命體的癌變。因此,基于基因表達(dá)數(shù)據(jù)從差異信號(hào)通路和代謝活動(dòng)角度研究癌癥共性分析方法,對(duì)于理解癌癥機(jī)制,檢測(cè)治療癌癥的靶標(biāo),以及預(yù)防癌癥具有十分重要的意義。本文采用癌癥細(xì)胞和正常細(xì)胞的基因表達(dá)數(shù)據(jù),研究癌癥共性分析方法,主要的特色工作包括:(1)提出一種基于信息散度的差異信號(hào)通路分析方法,該方法與5種經(jīng)典方法相比較,綜合敏感性,優(yōu)先級(jí)和假陽(yáng)性三種評(píng)價(jià)指標(biāo)取得了最優(yōu)異的性能。同時(shí),本文將此方法應(yīng)用于多種癌癥細(xì)胞基因表達(dá)數(shù)據(jù),挖掘癌癥顯著差異的信號(hào)通路,為癌癥研究提供思路。(2)提出一種重構(gòu)癌癥差異代謝網(wǎng)絡(luò)的方法,這種方法成功去除了不同癌癥間的組織差異性,使得能夠更好地挖掘癌癥代謝共...
【文章頁(yè)數(shù)】:72 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
本文編號(hào):3887827
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【學(xué)位級(jí)別】:碩士
圖2.1?SPAID方法流程??
圖2.2敏感性分布圖??.
圖2.3優(yōu)先級(jí)分布圖??
圖2.4假陽(yáng)性分布圖??
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