新疆漢族食管鱗癌mRNA差異表達(dá)基因的篩選
發(fā)布時(shí)間:2024-01-27 10:22
目的:本研究將利用基因芯片技術(shù)對(duì)新疆6對(duì)漢族食管鱗癌的癌組織及其癌旁正常組織進(jìn)行分析,檢測(cè)新疆漢族食管鱗癌的差異表達(dá)基因,并對(duì)其進(jìn)行生物學(xué)分析。方法:1.取新疆石河子大學(xué)醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院兵團(tuán)內(nèi)鏡中心2014年11月至2015年9月經(jīng)內(nèi)鏡及病理診斷確診的漢族食管鱗癌確診患者癌組織及癌旁正常組織各6例。對(duì)所取組織進(jìn)行總RNA的提取和純化,并經(jīng)過(guò)反復(fù)擴(kuò)增并RT-PCR得到c DNA,用Cy3進(jìn)行熒光標(biāo)記,然后在含有34235個(gè)m RNAs檢測(cè)探針的基因芯片上進(jìn)行雜交。2.掃描基因芯片熒光信號(hào)圖像,并使用軟件對(duì)熒光信號(hào)圖片結(jié)果進(jìn)行分析,檢測(cè)新疆漢族食管鱗癌的差異表達(dá)基因。結(jié)果:此次研究共篩選出漢族食管鱗癌差異表達(dá)的m RNAs337個(gè),其中有140個(gè)表達(dá)上調(diào)的m RNAs和197個(gè)表達(dá)下調(diào)的m RNAs。對(duì)這些基因進(jìn)行pathway、GO和disease富集分析。pathway富集分析顯示這些差異表達(dá)的m RNAs共參與六個(gè)信號(hào)通路數(shù)據(jù)庫(kù)49個(gè)信號(hào)通路,包括硬脂酸的生物合成、Sema4D介導(dǎo)的細(xì)胞粘附和遷移的抑制作用等。GO富集分析顯示這些差異表達(dá)基因在細(xì)胞成分、生物學(xué)過(guò)程和分子功能方面共有...
【文章頁(yè)數(shù)】:56 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
本文編號(hào):3886786
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【學(xué)位級(jí)別】:碩士
圖1食管鱗癌組織總RNA的1.2%甲醛變性膠電泳圖
圖2基因芯片雜交信號(hào)的掃描結(jié)果
圖3漢族食管鱗癌差異表達(dá)的mRNAs聚類分析
圖4漢族食管鱗癌差異表達(dá)mRNAs的火山圖
本文編號(hào):3886786
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