為研究Glyma.05G222700.2基因編碼的絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶在抗非生物脅迫過(guò)程的功能和原理,促進(jìn)大豆抗逆候選基因的開(kāi)發(fā)利用,本研究通過(guò)生物信息學(xué)方法對(duì)大豆Glyma.05G222700.2基因進(jìn)行同源序列、蛋白結(jié)構(gòu)、進(jìn)化樹(shù)和轉(zhuǎn)錄組分析,通過(guò)qRT-PCR分析鹽脅迫下大豆不同組織中該基因的表達(dá)情況。結(jié)果表明:該基因編碼區(qū)長(zhǎng)2 040 bp,編碼697個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)分子量為656.54 kD,pI8.026。多序列比對(duì)發(fā)現(xiàn)Glyma.05G222700.2蛋白包含1個(gè)Pkinase結(jié)構(gòu)域。進(jìn)化樹(shù)分析表明該蛋白與野大豆、刺毛黧豆、赤豆一致性較高。轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)表明Glyma.05G222700.2基因在大豆各組織中均有表達(dá),其中在種子中表達(dá)量最高,在根中表達(dá)量最低。qRT-PCR結(jié)果發(fā)現(xiàn)Glyma.05G222700.2基因在毛狀根、莖、葉中均有表達(dá),在莖中表達(dá)量最高,在葉中表達(dá)量最低;在毛狀根中鹽脅迫12 h表達(dá)量達(dá)到極值,鹽脅迫24 h表達(dá)量下降;在莖中表達(dá)量呈上升趨勢(shì),在24 h表達(dá)量達(dá)到極值;在葉中表達(dá)量不穩(wěn)定,鹽脅迫2 h該基因不表達(dá),鹽脅迫6 h該基因表達(dá)量達(dá)到極值并高于...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 試驗(yàn)設(shè)計(jì)
    1.3 方法
        1.3.1 生物信息學(xué)分析
        1.3.2 總RNA提取
        1.3.3 cDNA合成
        1.3.4 qRT-PCR
    1.4 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 Glyma.05G222700.2基因序列分析
    2.2 Glyma.05G222700.2蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
    2.3 Glyma.05G222700.2基因組織特異性表達(dá)預(yù)測(cè)與檢測(cè)
    2.4 Glyma.05G222700.2基因在鹽脅迫下的表達(dá)量分析
3 討 論
4 結(jié) 論



本文編號(hào)：3875186