目的采用生物信息學(xué)方法探討狼瘡腎炎(lupus nephritis,LN)發(fā)生的潛在機制。方法通過GEO數(shù)據(jù)庫獲得正常腎組織和LN腎組織的基因表達(dá)譜,分析二者基因表達(dá)情況,尋找差異基因,利用DAVID數(shù)據(jù)庫對LN發(fā)生發(fā)展過程中的差異基因進(jìn)行富集分析,使用STRING數(shù)據(jù)庫和Cytoscape對差異基因進(jìn)行可視化分析。結(jié)果篩選出146個上調(diào)基因和28個下調(diào)基因。在細(xì)胞通路方面,差異基因主要參與I型干擾素信號通路等;在細(xì)胞定位方面,差異基因主要分布在胞外體等;在分子功能方面,差異基因主要與MHCⅡ類受體活性等相關(guān)。KEGG分析結(jié)果表明,差異基因與甲型流感病毒感染、金黃色葡萄球菌感染、單純皰疹病毒感染、利什曼病和哮喘等通路有關(guān)。篩選發(fā)現(xiàn)IFI35、MX2、OAS3、IFI6、IRF7、OAS2、IFIT2、RSAD2、OAS1、MX1是LN發(fā)生風(fēng)險相關(guān)蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)中的核心基因。結(jié)論通過對數(shù)據(jù)集的分析,利用生物信息學(xué)方法找出了LN發(fā)生過程中的關(guān)鍵基因,為尋找有價值的LN標(biāo)志物提供了依據(jù)。

【文章頁數(shù)】：5 頁

【文章目錄】：
資料與方法
    一、研究資料的獲取
    二、方法
        1.差異基因數(shù)據(jù)篩選
        2.差異基因富集分析
        3.蛋白質(zhì)相互作用分析
結(jié) 果
    一、LN發(fā)生風(fēng)險相關(guān)差異表達(dá)基因分析
    二、LN發(fā)生風(fēng)險相關(guān)差異基因富集分析
    三、構(gòu)建LN發(fā)生風(fēng)險相關(guān)基因的蛋白網(wǎng)絡(luò)及尋找核心基因
討 論



本文編號：3873508