茶樹(shù)CsDREB-A2轉(zhuǎn)錄因子基因的克隆與非生物脅迫響應(yīng)分析
發(fā)布時(shí)間:2023-10-04 02:25
干旱應(yīng)答元件結(jié)合蛋白(DREB)類(lèi)轉(zhuǎn)錄因子在植物逆境信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑中具有重要的調(diào)控作用。為了解AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子在茶樹(shù)逆境脅迫的分子調(diào)控機(jī)理,本研究從茶樹(shù)龍井43葉片的cDNA中克隆得到一個(gè)編碼CsDREB-A2轉(zhuǎn)錄因子的基因;對(duì)CsDREB-A2基因及其編碼蛋白序列特征進(jìn)行分析,并利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR法檢測(cè)該基因在茶樹(shù)不同非生物脅迫處理下的表達(dá)水平。結(jié)果表明,CsDREB-A2基因開(kāi)放閱讀框?yàn)? 056 bp,編碼351個(gè)氨基酸,其編碼氨基酸序列具有AP2保守結(jié)構(gòu)域,包含典型的YRG元件和WLG基序。AP2結(jié)構(gòu)域第14、第19位氨基酸分別為纈氨酸和谷氨酸。擬南芥AP2/ERF家族轉(zhuǎn)錄因子的進(jìn)化分析表明,該轉(zhuǎn)錄因子屬于DREB亞族的A2組。CsDREB-A2相對(duì)分子質(zhì)量為39 080 Da,理論等電點(diǎn)為5.32,屬于親水性蛋白,主要由α-螺旋和隨機(jī)卷曲組成,無(wú)序化特征明顯且存在一個(gè)LM無(wú)序區(qū)域;可能定位于細(xì)胞核,不存在信號(hào)肽和跨膜結(jié)構(gòu),屬于非分泌蛋白。CsDREB-A2基因在高溫(38℃)和干旱(200 g·L-1 PEG)脅迫下均能快速誘導(dǎo)表達(dá),并顯著高于對(duì)...
【文章頁(yè)數(shù)】:11 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料及處理
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 總RNA提取和cDNA合成
1.2.2 CsDREB-A2基因的克隆
1.2.3 生物信息學(xué)分析
1.2.4 茶樹(shù)CsDREB-A2基因的表達(dá)特性分析
2 結(jié)果與分析
2.1 茶樹(shù)CsDREB-A2基因的克隆
2.2 茶樹(shù)CsDREB-A2轉(zhuǎn)錄因子進(jìn)化樹(shù)分析
2.3 茶樹(shù)CsDREB-A2轉(zhuǎn)錄因子與其他植物相關(guān)氨基酸序列比對(duì)
2.4 茶樹(shù)CsDREB-A2轉(zhuǎn)錄因子氨基酸組成及理化性質(zhì)分析
2.5 茶樹(shù)CsDREB-A2蛋白亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)
2.6 茶樹(shù)CsDREB-A2蛋白氨基酸親、疏水性和無(wú)序化分析
2.7 茶樹(shù)CsDREB-A2轉(zhuǎn)錄因子信號(hào)肽、跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)與分析
2.8 茶樹(shù)CsDREB-A2蛋白推導(dǎo)的二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)與分析
2.9 茶樹(shù)CsDREB-A2基因在非生物脅迫下的表達(dá)情況
3 討論
4 結(jié)論
本文編號(hào):3851125
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1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料及處理
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 總RNA提取和cDNA合成
1.2.2 CsDREB-A2基因的克隆
1.2.3 生物信息學(xué)分析
1.2.4 茶樹(shù)CsDREB-A2基因的表達(dá)特性分析
2 結(jié)果與分析
2.1 茶樹(shù)CsDREB-A2基因的克隆
2.2 茶樹(shù)CsDREB-A2轉(zhuǎn)錄因子進(jìn)化樹(shù)分析
2.3 茶樹(shù)CsDREB-A2轉(zhuǎn)錄因子與其他植物相關(guān)氨基酸序列比對(duì)
2.4 茶樹(shù)CsDREB-A2轉(zhuǎn)錄因子氨基酸組成及理化性質(zhì)分析
2.5 茶樹(shù)CsDREB-A2蛋白亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)
2.6 茶樹(shù)CsDREB-A2蛋白氨基酸親、疏水性和無(wú)序化分析
2.7 茶樹(shù)CsDREB-A2轉(zhuǎn)錄因子信號(hào)肽、跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)與分析
2.8 茶樹(shù)CsDREB-A2蛋白推導(dǎo)的二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)與分析
2.9 茶樹(shù)CsDREB-A2基因在非生物脅迫下的表達(dá)情況
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