紫心甘薯轉(zhuǎn)錄因子bHLH的基因克隆及功能研究
發(fā)布時間:2023-09-03 18:41
通過對紫心甘薯中bHLH類轉(zhuǎn)錄因子的基因進行分子克隆,對其結(jié)構(gòu)、表達(dá)模式及功能進行研究,明確了其結(jié)構(gòu)特征和生物學(xué)功能.通過采用RACE克隆方法,獲得了編碼bHLH基因且長度分別為2 516 bp和2 304 bp的cDNA全序列.基于DNA序列的分子進化樹分析結(jié)果表明:兩者分別屬于植物bHLH1和b HLH2基因家族的成員,分別將其命名為IbbHLH1(Gen Bank登錄號:KC708871)和IbbHLH2 (Gen Bank登錄號:JF508437); IbbHLH1和IbbHLH2蛋白均定位于細(xì)胞核;在3個甘薯品種(系)的塊根中,IbbHLH2基因與花色素苷合成途徑中的酶基因(CHS、CHI、F3H、DFR、ANS和3GT)的表達(dá)量變化趨勢相一致,初步推測轉(zhuǎn)錄因子IbbHLH2可能參與了紫心甘薯花色素苷合成途徑一系列酶基因的表達(dá)與調(diào)控.
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實驗材料
1.2 實驗方法
1.2.1 RNA和DNA的提取
1.2.2 RACE克隆技術(shù)
1.2.3 IbbHLH1和IbbHLH2的生物信息學(xué)分析
1.2.4 真核表達(dá)載體的構(gòu)建及亞細(xì)胞定位
1.2.5 RT-PCR
2 結(jié)果與分析
2.1 紫心甘薯IbbHLH1和IbbHLH2全長cDNA的克隆及序列特征分析
2.1.1 IbbHLH1和IbbHLH2全長cDNA的克隆
2.1.2 IbbHLH1和IbbHLH2推導(dǎo)的氨基酸序列的多重比對分析
2.1.3 IbbHLH1和IbbHLH2的系統(tǒng)進化樹分析
2.1.4 IbbHLH1和Ibb HLH2蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測與亞細(xì)胞定位
2.2 不同品種中IbbHLH1、IbbHLH2及花色素苷合成相關(guān)基因的表達(dá)特征
3 討論
本文編號:3845578
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1 材料與方法
1.1 實驗材料
1.2 實驗方法
1.2.1 RNA和DNA的提取
1.2.2 RACE克隆技術(shù)
1.2.3 IbbHLH1和IbbHLH2的生物信息學(xué)分析
1.2.4 真核表達(dá)載體的構(gòu)建及亞細(xì)胞定位
1.2.5 RT-PCR
2 結(jié)果與分析
2.1 紫心甘薯IbbHLH1和IbbHLH2全長cDNA的克隆及序列特征分析
2.1.1 IbbHLH1和IbbHLH2全長cDNA的克隆
2.1.2 IbbHLH1和IbbHLH2推導(dǎo)的氨基酸序列的多重比對分析
2.1.3 IbbHLH1和IbbHLH2的系統(tǒng)進化樹分析
2.1.4 IbbHLH1和Ibb HLH2蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測與亞細(xì)胞定位
2.2 不同品種中IbbHLH1、IbbHLH2及花色素苷合成相關(guān)基因的表達(dá)特征
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