應(yīng)用生物信息學(xué)方法對(duì)12種鳚亞目魚(yú)類(lèi)線(xiàn)粒體COI基因序列片段進(jìn)行了比較分析。結(jié)果表明:COI基因堿基組成偏倚明顯,A+T含量(54.40%)明顯高于G+C含量(45.60%)。轉(zhuǎn)換和顛換位點(diǎn)數(shù)分別為59和42個(gè)。應(yīng)用Kimura雙參數(shù)法計(jì)算鳚亞目魚(yú)類(lèi)COI基因序列的種間遺傳距離,結(jié)果表明:種間平均遺傳距離為0.232 4,是種內(nèi)遺傳距離的9.62倍。應(yīng)用MP和NJ法構(gòu)建了分子系統(tǒng)發(fā)生樹(shù),結(jié)果顯示,方氏云鳚、云鳚和六線(xiàn)鳚聚在一起,然后與頸鰭脂鳚聚在一起,再與巴西擬隆胎鳚、巴哈馬擬隆胎鳚聚類(lèi),最后與疣眼吉氏指鰧聚類(lèi);粗頭巖游鳚、環(huán)項(xiàng)副鳚和橫帶斯氏脂胎鳚聚為另一分支;背叉觸角鳚并沒(méi)有聚成一個(gè)單系分支,而是與旗鳚科和三鰭鳚科的魚(yú)類(lèi)交叉。此外,分子系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)的構(gòu)建結(jié)果大部分與形態(tài)學(xué)分類(lèi)結(jié)果相一致,相比之下,NJ法較MP法構(gòu)建的分子系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)與鳚亞目魚(yú)類(lèi)形態(tài)學(xué)分類(lèi)結(jié)果更接近。

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗(yàn)材料
    1.2 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 COI基因堿基組成
    2.2 種內(nèi)及種間遺傳距離
    2.3 分類(lèi)及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系
3 討論
    3.1 鳚亞目魚(yú)類(lèi)線(xiàn)粒體COI基因結(jié)構(gòu)特征
    3.2 鳚亞目魚(yú)類(lèi)分類(lèi)關(guān)系的探討
4 結(jié)論



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