小鼠Ogg1基因pET28a-mOgg1原核表達(dá)系統(tǒng)建立及其生物信息學(xué)探討
發(fā)布時間:2023-08-20 09:21
將小鼠Ogg1(mOgg1)基因克隆至pET-28a(+)原核表達(dá)載體上,分析其相關(guān)的生物信息學(xué)特性.運用分子克隆的方法,獲得重組質(zhì)粒pET28a-mOgg1;經(jīng)同源性分析證實與NCBI基因庫中mOgg1基因相似度為100%;mOgg1基因可翻譯成345個氨基酸序列,翻譯后的蛋白不存在N-糖基化位點、跨膜螺旋區(qū)域,不含信號肽且無信號肽剪切位點,但含有31個磷酸化位點;運用在線軟件對mOgg1蛋白進(jìn)行結(jié)構(gòu)分析并建立蛋白的3D結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)在該蛋白鏈上含有48%α螺旋、10%β折疊.成功獲得了pET28a-mOgg1重組質(zhì)粒,并對重組蛋白進(jìn)行Western-blot鑒定,從基因及氨基酸組成上分析該蛋白的特性,由此探討mOgg1基因及蛋白表達(dá)相關(guān)的生物信息學(xué)特性.
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 實驗動物
1.1.2 儀器與試劑
1.2 方法
1.2.1 小鼠肝組織RNA提取以及cDNA獲取
1.2.2 mOgg1基因的克隆及測序分析
1.2.3 mOgg1蛋白序列分析及蛋白的結(jié)構(gòu)預(yù)測與功能分析
1.2.4 pET28a-mOgg1表達(dá)蛋白的Western-blot鑒定
2 結(jié)果
2.1 mOgg1基因PCR擴增產(chǎn)物
2.2 重組質(zhì)粒pET28a-mOgg1 PCR鑒定結(jié)果
2.3 mOgg1基因測序結(jié)果及其不同物種同源性分析
2.4 mOgg1基因氨基酸序列分析
2.5 抗原肽分析
2.6 mOgg1蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測
2.7 重組質(zhì)粒pET28a-mOgg1表達(dá)蛋白的Western-blot鑒定
3 討論
本文編號:3842944
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1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 實驗動物
1.1.2 儀器與試劑
1.2 方法
1.2.1 小鼠肝組織RNA提取以及cDNA獲取
1.2.2 mOgg1基因的克隆及測序分析
1.2.3 mOgg1蛋白序列分析及蛋白的結(jié)構(gòu)預(yù)測與功能分析
1.2.4 pET28a-mOgg1表達(dá)蛋白的Western-blot鑒定
2 結(jié)果
2.1 mOgg1基因PCR擴增產(chǎn)物
2.2 重組質(zhì)粒pET28a-mOgg1 PCR鑒定結(jié)果
2.3 mOgg1基因測序結(jié)果及其不同物種同源性分析
2.4 mOgg1基因氨基酸序列分析
2.5 抗原肽分析
2.6 mOgg1蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測
2.7 重組質(zhì)粒pET28a-mOgg1表達(dá)蛋白的Western-blot鑒定
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