基于線粒體DNA tRNA leu C OⅡ序列的川西地區(qū)東方蜜蜂保護遺傳學(xué)研究
發(fā)布時間:2023-05-10 17:50
東方蜜蜂(Apis cerana)在分類學(xué)上屬昆蟲綱(Insecta)、膜翅目(Hymenoptera)、蜜蜂科(Apidae)、蜜蜂屬(Apis)。我國境內(nèi)除新疆以外,大部分地區(qū)都有東方蜜蜂的分布,但是受到西方蜜蜂(Apis melliffera)以及人類活動的影響,我國東方蜜蜂的分布范圍和種群數(shù)量明顯減少,遺傳資源破壞較嚴重。目前,四川省已成為我國東方蜜蜂主要分布區(qū)之一。本研究選取了四川省23個地理種群411個東方蜜蜂個體,利用線粒體DNA tRNAleuCOⅡ片段序列作為分子標記,對東方蜜蜂的遺傳多樣性、遺傳結(jié)構(gòu)、種群歷史動態(tài)等方面進行分析,主要研究結(jié)果如下:試驗成功擴增出長度為436 bp的東方蜜蜂mtDNA tRNAleuCOⅡ基因片段,該段序列A+T的平均含量為85.10%,C+G的平均含量為14.91%,說明此段為A+T富集區(qū);該段序列共存在58個變異位點,包括26個簡約信息位點,27個單突變位點和5個堿基缺失位點,共定義了53個單倍型。對23個地理種群進行遺傳多樣性分析,發(fā)現(xiàn)平均核苷...
【文章頁數(shù)】:79 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
1 文獻綜述
1.1 東方蜜蜂概述
1.1.1 分類地位
1.1.2 分布范圍與亞種分類
1.1.3 遺傳資源狀況
1.1.4 生存現(xiàn)狀
1.2 蜜蜂保護遺傳學(xué)研究概述
1.2.1 保護遺傳學(xué)誕生及研究內(nèi)容
1.2.2 保護遺傳學(xué)的研究方法
1.2.3 蜜蜂保護遺傳學(xué)研究概況
1.3 本研究的目的和意義
2 材料與方法
2.1 試驗材料
2.1.1 樣品采集
2.1.2 主要試劑
2.1.3 主要儀器設(shè)備
2.2 試驗方法
2.2.1 基因組DNA提取
2.2.2 樣品DNA溶液濃度檢測
2.2.3 序列擴增與測序
2.3 數(shù)據(jù)分析
2.3.1 遺傳多樣性
2.3.2 遺傳分化與種群結(jié)構(gòu)
2.3.3 系統(tǒng)進化發(fā)育分析
2.3.4 種群動態(tài)研究
3 結(jié)果
3.1 東方蜜蜂DNA提取和PCR擴增
3.1.1 東方蜜蜂DNA提取結(jié)果
3.1.2 東方蜜蜂線粒體DNA擴增結(jié)果
3.2 遺傳多樣性
3.2.1 堿基組成
3.2.2 多態(tài)信息位點
3.2.3 單倍型分析
3.2.4 核苷酸多態(tài)性分析
3.2.5 核苷酸差異分析
3.3 遺傳分化與種群結(jié)構(gòu)
3.3.1 遺傳距離分析
3.3.2 種群間的遺傳分化與基因流
3.3.3 分子變異分析(AMOVA)
3.4 系統(tǒng)進化樹
3.4.1 單倍型之間的系統(tǒng)地理關(guān)系
3.4.2 單倍型與全國的系統(tǒng)地理關(guān)系
3.5 單倍型網(wǎng)絡(luò)中介圖
3.6 種群進化歷史動態(tài)分析
3.6.1 中性檢驗
3.6.2 歧點分布
4 討論
4.1 東方蜜蜂DNA tRNAleu
COⅡ基因片段討論
4.2 遺傳多樣性討論
4.3 種群間的遺傳分化與親緣關(guān)系討論
4.4 種群遺傳結(jié)構(gòu)劃分
4.5 系統(tǒng)地理格局形成
4.6 阿壩州和甘孜州東方蜜蜂的探討
4.7 種質(zhì)資源的保護
4.8 遺傳管理單元的劃分及保護建議
5 結(jié)論
參考文獻
致謝
作者簡歷
本文編號:3813218
【文章頁數(shù)】:79 頁
【學(xué)位級別】:碩士
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摘要
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1 文獻綜述
1.1 東方蜜蜂概述
1.1.1 分類地位
1.1.2 分布范圍與亞種分類
1.1.3 遺傳資源狀況
1.1.4 生存現(xiàn)狀
1.2 蜜蜂保護遺傳學(xué)研究概述
1.2.1 保護遺傳學(xué)誕生及研究內(nèi)容
1.2.2 保護遺傳學(xué)的研究方法
1.2.3 蜜蜂保護遺傳學(xué)研究概況
1.3 本研究的目的和意義
2 材料與方法
2.1 試驗材料
2.1.1 樣品采集
2.1.2 主要試劑
2.1.3 主要儀器設(shè)備
2.2 試驗方法
2.2.1 基因組DNA提取
2.2.2 樣品DNA溶液濃度檢測
2.2.3 序列擴增與測序
2.3 數(shù)據(jù)分析
2.3.1 遺傳多樣性
2.3.2 遺傳分化與種群結(jié)構(gòu)
2.3.3 系統(tǒng)進化發(fā)育分析
2.3.4 種群動態(tài)研究
3 結(jié)果
3.1 東方蜜蜂DNA提取和PCR擴增
3.1.1 東方蜜蜂DNA提取結(jié)果
3.1.2 東方蜜蜂線粒體DNA擴增結(jié)果
3.2 遺傳多樣性
3.2.1 堿基組成
3.2.2 多態(tài)信息位點
3.2.3 單倍型分析
3.2.4 核苷酸多態(tài)性分析
3.2.5 核苷酸差異分析
3.3 遺傳分化與種群結(jié)構(gòu)
3.3.1 遺傳距離分析
3.3.2 種群間的遺傳分化與基因流
3.3.3 分子變異分析(AMOVA)
3.4 系統(tǒng)進化樹
3.4.1 單倍型之間的系統(tǒng)地理關(guān)系
3.4.2 單倍型與全國的系統(tǒng)地理關(guān)系
3.5 單倍型網(wǎng)絡(luò)中介圖
3.6 種群進化歷史動態(tài)分析
3.6.1 中性檢驗
3.6.2 歧點分布
4 討論
4.1 東方蜜蜂DNA tRNAleu
COⅡ基因片段討論
4.2 遺傳多樣性討論
4.3 種群間的遺傳分化與親緣關(guān)系討論
4.4 種群遺傳結(jié)構(gòu)劃分
4.5 系統(tǒng)地理格局形成
4.6 阿壩州和甘孜州東方蜜蜂的探討
4.7 種質(zhì)資源的保護
4.8 遺傳管理單元的劃分及保護建議
5 結(jié)論
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本文編號:3813218
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