利用生物信息學技術(shù)鑒定高粱脂氧合酶(LOX)家族基因,并對其進化關(guān)系、基因結(jié)構(gòu)、保守基序、不同組織及低溫脅迫下的表達模式等進行分析,以此為高粱LOX基因的功能研究奠定基礎(chǔ)。結(jié)果表明,共鑒定出11條高粱LOX家族基因,根據(jù)其染色體位置命名為SbLOX1—SbLOX11,該家族基因可分為2個亞族(9-LOX、13-LOX)且同一亞族基因結(jié)構(gòu)基本相似。表達分析發(fā)現(xiàn),不同基因家族成員在不同組織部位的表達模式各不相同,SbLOX10和SbLOX9基因在各個組織部位中表達量均較低,SbLOX2—SbLOX5、SbLOX8在各個組織部位中表達量均較高。對低溫(4℃)處理下高粱LOX基因轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進行分析發(fā)現(xiàn),耐冷型高粱9-LOX亞族中的SbLOX1、SbLOX3、SbLOX5和13-LOX亞族中的SbLOX4、SbLOX9在大多時間點均呈上調(diào)表達,且在冷敏感材料中表達量也較高,推測LOX基因在低溫脅迫響應中具有重要作用。

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【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 高粱LOX家族基因的鑒定及理化性質(zhì)分析
    1.2 高粱LOX家族基因系統(tǒng)進化分析
    1.3 高粱LOX家族基因結(jié)構(gòu)、保守基序(Motif)及二級結(jié)構(gòu)預測
    1.4 高粱LOX家族基因表達模式分析
    1.5 低溫處理高粱幼苗轉(zhuǎn)錄組學分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 高粱LOX家族基因的鑒定、理化性質(zhì)及染色體定位分析
    2.2 高粱LOX基因家族成員系統(tǒng)進化分析
    2.3 高粱LOX家族基因結(jié)構(gòu)及蛋白保守基序分析
    2.4 高粱LOX家族蛋白的結(jié)構(gòu)預測
    2.5 高粱LOX家族基因的表達分析
        2.5.1 不同生長發(fā)育時期組織中的表達
        2.5.2 低溫脅迫下的表達
3 結(jié)論與討論



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