發(fā)布時(shí)間：2023-03-19 21:42

　　【目的】篩選并分析菠蘿TCP(Teosinte branched 1/Cycloidea/Proliferating)基因家族,為菠蘿TCP基因在乙烯利誘花過程中的功能研究提供參考�！痉椒ā恳浴_(tái)農(nóng)16號’菠蘿為材料,通過生物信息學(xué)軟件系統(tǒng)地分析該基因家族的蛋白質(zhì)理化性質(zhì)、染色體定位、基因共線性、系統(tǒng)進(jìn)化、基因結(jié)構(gòu)、啟動(dòng)子順式作用元件及RNA-Seq數(shù)據(jù),并通過qRTPCR分析該基因家族在成花誘導(dǎo)階段的表達(dá)情況�！窘Y(jié)果】共鑒定出9個(gè)菠蘿TCP基因,均含有TCP結(jié)構(gòu)域,系統(tǒng)進(jìn)化將其劃分為PCF、CIN和CYC/TB1三個(gè)亞家族。菠蘿TCP基因家族的擴(kuò)增與全基因組倍增事件無關(guān),不存在片段復(fù)制和串聯(lián)復(fù)制事件。啟動(dòng)子順式作用元件分析發(fā)現(xiàn),AcTCP2、AcTCP5～AcTCP9均含有乙烯響應(yīng)元件。表達(dá)譜分析表明,AcTCP對乙烯利均有不同程度的響應(yīng),在花芽分化時(shí)期,AcTCP1、AcTCP3、AcTCP7和AcTCP8在莖尖中的表達(dá)水平均有顯著上調(diào),分別約為0時(shí)期的8.15、18.0、14.6和7.91倍�！窘Y(jié)論】鑒定并分析了AcTCP基因家族成員信息,發(fā)現(xiàn)AcTCP1、AcTCP3、AcTC...

【文章頁數(shù)】：13 頁

【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 材料及處理
    1.2 菠蘿TCP基因家族的鑒定
    1.3 菠蘿TCP基因家族的生物信息學(xué)分析
    1.4 菠蘿TCP基因家族RNA-Seq表達(dá)分析
    1.5 菠蘿TCP基因家族的q RT-PCR分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 菠蘿TCP基因家族染色體定位及蛋白質(zhì)理化性質(zhì)分析
    2.2 菠蘿TCP基因共線性分析
    2.3 菠蘿TCP基因家族的系統(tǒng)進(jìn)化分析
    2.4 菠蘿TCP結(jié)構(gòu)分析
    2.5 菠蘿TCP啟動(dòng)子順式作用元件分析
    2.6 mi RNA的靶基因預(yù)測
    2.7 基于RNA-Seq數(shù)據(jù)的菠蘿TCP表達(dá)分析
    2.8 菠蘿TCP基因的q RT-PCR分析
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