一種可預(yù)測彌漫大B細(xì)胞淋巴瘤患者生存的新型6基因預(yù)測模型
發(fā)布時(shí)間:2023-02-26 03:18
目的從分子生物學(xué)角度構(gòu)建預(yù)測彌漫大B細(xì)胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL)預(yù)后的模型。方法從GEO和TCGA數(shù)據(jù)庫下載相應(yīng)的基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)及臨床數(shù)據(jù),采用Lasso回歸和多因素Cox回歸構(gòu)建基因預(yù)測模型,將基因模型與其他臨床預(yù)后因素相結(jié)合構(gòu)建列線圖模型。結(jié)果本研究建立了基于6個(gè)基因(LNPEP、SNX20、GTPBP10、CALR、BDH1、C5orf30)的預(yù)測模型,該模型可將各個(gè)隊(duì)列的患者分為高風(fēng)險(xiǎn)組及低風(fēng)險(xiǎn)組,訓(xùn)練集GSE10846及驗(yàn)證集GSE32918、NCICCR預(yù)測3年總生存率的AUC分別為0.722、0.758、0.693;谠摶蚰P团c年齡、亞型、治療方案、ECOG、分期、結(jié)外部位數(shù)量等臨床因素構(gòu)建的列線圖模型預(yù)測DLBCL患者3年總生存率的AUC在GSE10846數(shù)據(jù)集為0.796,校準(zhǔn)圖一致性良好。GO及KEGG富集分析顯示,該模型的基因主要與DNA復(fù)制和修復(fù)、蛋白加工、細(xì)胞周期、病毒致癌等生物功能及通路相關(guān)。結(jié)論本研究成功構(gòu)建了可預(yù)測DLBCL患者生存的基因預(yù)測模型,與臨床因素結(jié)合,能更準(zhǔn)確地評(píng)估患者的預(yù)后。
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1 方法
1.1 數(shù)據(jù)來源及處理
1.2 模型的構(gòu)建及驗(yàn)證
2 結(jié)果
2.1 基因預(yù)測模型的構(gòu)建
2.2 基因預(yù)測模型的驗(yàn)證
2.3 6基因風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分是DLBCL患者的獨(dú)立預(yù)后因素
2.4 分層分析
2.5 列線圖模型的構(gòu)建及評(píng)估
2.6 功能分析
3 討論
本文編號(hào):3749706
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1 方法
1.1 數(shù)據(jù)來源及處理
1.2 模型的構(gòu)建及驗(yàn)證
2 結(jié)果
2.1 基因預(yù)測模型的構(gòu)建
2.2 基因預(yù)測模型的驗(yàn)證
2.3 6基因風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分是DLBCL患者的獨(dú)立預(yù)后因素
2.4 分層分析
2.5 列線圖模型的構(gòu)建及評(píng)估
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