目的基于生物信息學(xué),對缺血性腦卒中(IS)相關(guān)差異表達(dá)基因(DEGs)進(jìn)行分子層面的分析,深入分析IS的發(fā)病機(jī)制和關(guān)鍵基因。方法從GEO數(shù)據(jù)庫下載與IS相關(guān)的生物基因芯片,基于P值及l(fā)og|FC|值對GEO原始數(shù)據(jù)進(jìn)行篩選,確定DEGs。對DEGs進(jìn)行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,了解DEGs介導(dǎo)的生物過程與代謝通路。利用String在線平臺,構(gòu)建DEGs的蛋白相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)。利用cytoscape的cyto Hubba軟件,找出IS的關(guān)鍵基因。結(jié)果本研究共篩選出110個DEGs。功能和通路富集結(jié)果顯示,上述基因參與MAPK、NF-kappa B、TNF等多種細(xì)胞因子和趨化因子的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路;共同介導(dǎo)炎癥以及免疫應(yīng)答、細(xì)胞凋亡等相關(guān)生物過程。PPI網(wǎng)絡(luò)顯示,這些基因之間具有相互作用關(guān)系。JUN、CXCL2和TNF為IS病理過程中的關(guān)鍵基因。結(jié)論本研究結(jié)果揭示,IS的發(fā)生發(fā)展與炎癥密切相關(guān)。針對關(guān)鍵基因進(jìn)行靶向治療,如JUN、CXCL2和TNF,或許對臨床防治IS具有重要的發(fā)展意義。

【文章頁數(shù)】：5 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 芯片信息的獲取
    1.2 DEGs的確定
    1.3 功能富集與通路分析
    1.4 PPI網(wǎng)絡(luò)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 芯片和DEGs的信息
    2.2 GO功能富集分析
    2.3 KEGG通路富集分析
    2.4 PPI網(wǎng)絡(luò)分析
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