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龍眼SPS基因克隆及其表達分析

發(fā)布時間:2023-02-19 17:53
  【目的】克隆龍眼蔗糖磷酸合成酶基因(DlSPS)并分析其表達特性,為深入探究SPS基因家族成員在植物生長發(fā)育過程中的調(diào)控機制提供理論依據(jù)!痉椒ā恳允堼堁蹫椴牧,利用RT-PCR和RACE技術克隆DlSPS基因,對其進行生物信息學分析,并用實時熒光定量PCR檢測龍眼不同組織[根、莖、葉、幼果、果皮、花、熟果(果肉和果皮)]的相對表達量;測定分析果實發(fā)育過程中蔗糖含量、SPS活性及DlSPS基因表達的相關性。【結果】克隆獲得的DlSPS基因(GenBank登錄號為KP769779)cDNA全長3504 bp,編碼1057個氨基酸殘基,其編碼蛋白分子量118.38 kD,理論等電點6.09,脂溶指數(shù)85.53,不穩(wěn)定系數(shù)43.69,親/疏水性平均值-0.412,為不穩(wěn)定的親水蛋白。DlSPS蛋白與溫州蜜桔(BAA23213.1)SPS蛋白同源性最高,聚在同一小分支上,表明二者親緣關系較近。DlSPS蛋白二級結構中,α-螺旋占35.0%,延伸鏈占13.8%,無規(guī)則卷曲占51.2%,與其三級結構預測結果相符。DlSPS基因在不同組織中均有表達,但表達量存在明顯差異,其中在葉中的表達量顯著高于...

【文章頁數(shù)】:8 頁

【文章目錄】:
0 引言
1 材料與方法
    1.1 試驗材料
        1.1.1 植物材料
        1.1.2 主要試劑
        1.1.3 主要儀器設備
    1.2 試驗方法
        1.2.1 總RNA提取與cDNA第一鏈合成
        1.2.2 基因克隆
        1.2.3 生物信息學分析
        1.2.4 實時熒光定量PCR檢測
        1.2.5 果實蔗糖含量測定
        1.2.6 SPS活性測定
    1.3 數(shù)據(jù)處理與作圖
2 結果與分析
    2.1 DlSPS基因克隆結果
    2.2 DlSPS基因的核苷酸序列分析結果及基因家族鑒定
    2.3 DlSPS蛋白理化性質(zhì)預測分析結果
        2.3.1 DlSPS蛋白親/疏水性預測預測結果
        2.3.2 系統(tǒng)發(fā)育進化樹分析結果
        2.3.3 DlSPS蛋白質(zhì)二級和三級結構預測
    2.4 DlSPS基因組織表達特性分析結果
    2.5 龍眼果實蔗糖含量與SPS的相關性分析結果
3 討論
4 結論



本文編號:3746686

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