龍眼SPS基因克隆及其表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2023-02-19 17:53
【目的】克隆龍眼蔗糖磷酸合成酶基因(DlSPS)并分析其表達(dá)特性,為深入探究SPS基因家族成員在植物生長發(fā)育過程中的調(diào)控機(jī)制提供理論依據(jù)!痉椒ā恳允堼堁蹫椴牧,利用RT-PCR和RACE技術(shù)克隆DlSPS基因,對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)分析,并用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)龍眼不同組織[根、莖、葉、幼果、果皮、花、熟果(果肉和果皮)]的相對(duì)表達(dá)量;測(cè)定分析果實(shí)發(fā)育過程中蔗糖含量、SPS活性及DlSPS基因表達(dá)的相關(guān)性!窘Y(jié)果】克隆獲得的DlSPS基因(GenBank登錄號(hào)為KP769779)cDNA全長3504 bp,編碼1057個(gè)氨基酸殘基,其編碼蛋白分子量118.38 kD,理論等電點(diǎn)6.09,脂溶指數(shù)85.53,不穩(wěn)定系數(shù)43.69,親/疏水性平均值-0.412,為不穩(wěn)定的親水蛋白。DlSPS蛋白與溫州蜜桔(BAA23213.1)SPS蛋白同源性最高,聚在同一小分支上,表明二者親緣關(guān)系較近。DlSPS蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)中,α-螺旋占35.0%,延伸鏈占13.8%,無規(guī)則卷曲占51.2%,與其三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果相符。DlSPS基因在不同組織中均有表達(dá),但表達(dá)量存在明顯差異,其中在葉中的表達(dá)量顯著高于...
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
0 引言
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.1.1 植物材料
1.1.2 主要試劑
1.1.3 主要儀器設(shè)備
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 總RNA提取與cDNA第一鏈合成
1.2.2 基因克隆
1.2.3 生物信息學(xué)分析
1.2.4 實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)
1.2.5 果實(shí)蔗糖含量測(cè)定
1.2.6 SPS活性測(cè)定
1.3 數(shù)據(jù)處理與作圖
2 結(jié)果與分析
2.1 DlSPS基因克隆結(jié)果
2.2 DlSPS基因的核苷酸序列分析結(jié)果及基因家族鑒定
2.3 DlSPS蛋白理化性質(zhì)預(yù)測(cè)分析結(jié)果
2.3.1 DlSPS蛋白親/疏水性預(yù)測(cè)預(yù)測(cè)結(jié)果
2.3.2 系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹分析結(jié)果
2.3.3 DlSPS蛋白質(zhì)二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
2.4 DlSPS基因組織表達(dá)特性分析結(jié)果
2.5 龍眼果實(shí)蔗糖含量與SPS的相關(guān)性分析結(jié)果
3 討論
4 結(jié)論
本文編號(hào):3746686
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0 引言
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.1.1 植物材料
1.1.2 主要試劑
1.1.3 主要儀器設(shè)備
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 總RNA提取與cDNA第一鏈合成
1.2.2 基因克隆
1.2.3 生物信息學(xué)分析
1.2.4 實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)
1.2.5 果實(shí)蔗糖含量測(cè)定
1.2.6 SPS活性測(cè)定
1.3 數(shù)據(jù)處理與作圖
2 結(jié)果與分析
2.1 DlSPS基因克隆結(jié)果
2.2 DlSPS基因的核苷酸序列分析結(jié)果及基因家族鑒定
2.3 DlSPS蛋白理化性質(zhì)預(yù)測(cè)分析結(jié)果
2.3.1 DlSPS蛋白親/疏水性預(yù)測(cè)預(yù)測(cè)結(jié)果
2.3.2 系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹分析結(jié)果
2.3.3 DlSPS蛋白質(zhì)二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
2.4 DlSPS基因組織表達(dá)特性分析結(jié)果
2.5 龍眼果實(shí)蔗糖含量與SPS的相關(guān)性分析結(jié)果
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