家蠶繭絲產(chǎn)量數(shù)量性狀位點(diǎn)定位及主效基因鑒定
發(fā)布時(shí)間:2023-02-11 10:16
家蠶是一種重要的經(jīng)濟(jì)昆蟲,其強(qiáng)大的絲蛋白合成能力是蠶絲產(chǎn)業(yè)的基礎(chǔ)。自上世紀(jì)70年代以后,以產(chǎn)量提升為目的的家蠶育種進(jìn)入平臺(tái)期,因此,需要借助日益發(fā)展的現(xiàn)代分子生物學(xué)技術(shù)來促進(jìn)包括繭絲產(chǎn)量在內(nèi)的家蠶經(jīng)濟(jì)性狀提升。近些年來,蠶絲蛋白在生物醫(yī)藥、功能性生物材料等領(lǐng)域展現(xiàn)了廣闊的應(yīng)用前景。另一方面,家蠶絲腺強(qiáng)大的絲蛋白合成能力也使得它有望成為一種理想的生物反應(yīng)器。而無論是促進(jìn)家蠶育種還是推動(dòng)絲蛋白及絲腺的新應(yīng)用,均依賴于對(duì)產(chǎn)絲能力的遺傳基礎(chǔ)及絲蛋白合成的調(diào)控機(jī)制的理解。家蠶繭絲產(chǎn)量相關(guān)性狀,如全繭量(CW)、繭層量(CSW)和繭層率(CSR),具有典型的數(shù)量性狀特征。其遺傳基礎(chǔ)的解析依賴于數(shù)量遺傳學(xué)方法的應(yīng)用。盡管已經(jīng)有研究人員對(duì)繭絲產(chǎn)量相關(guān)性狀進(jìn)行了數(shù)量性狀位點(diǎn)(Quantitative traitloci,QTL)的定位分析,但目前仍然沒有控制基因被克隆并獲得功能驗(yàn)證。究其原因,可能是家蠶自身的遺傳特性的干擾,如性別效應(yīng)和雌完全連鎖等。本文的研究中,我們基于家蠶的遺傳特性,開發(fā)了一套適合家蠶數(shù)量性狀的高效QTL定位分析方法,并對(duì)CSW進(jìn)行了QTL分析,在此基礎(chǔ)上對(duì)其主效位點(diǎn)進(jìn)行精細(xì)定位及主...
【文章頁數(shù)】:113 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 蠶絲的傳統(tǒng)應(yīng)用和新拓展
1.1.1 蠶絲產(chǎn)業(yè)歷史
1.1.2 我國蠶絲產(chǎn)業(yè)的現(xiàn)狀
1.1.3 家蠶相關(guān)新產(chǎn)品開發(fā)及新應(yīng)用拓展研究
1.2 家蠶經(jīng)濟(jì)性狀的馴化和育種選擇
1.2.1 家蠶馴化對(duì)其經(jīng)濟(jì)性狀及家蠶資源的貢獻(xiàn)
1.2.2 基于現(xiàn)代遺傳學(xué)理論的家蠶遺傳選育
1.3 數(shù)量性狀的定位方法
1.3.1 基于連鎖分析的數(shù)量性狀定位方法(QTL)
1.3.2 基于連鎖不平衡的數(shù)量性狀定位方法(Associationanalysis)
1.4 數(shù)量性狀定位常用遺傳分析群體
1.4.1 F2和BC等臨時(shí)性群體的應(yīng)用
1.4.2 重組近交系(RILs)等永久性群體的應(yīng)用
1.4.3 自然群體在關(guān)聯(lián)分析中的應(yīng)用
1.4.4 多親本高級(jí)世代互交系(MAGIC)的應(yīng)用
1.5 家蠶繭絲產(chǎn)量相關(guān)性狀的遺傳基礎(chǔ)及調(diào)控機(jī)制研究現(xiàn)狀
1.5.1 家蠶繭絲產(chǎn)量相關(guān)性狀的遺傳基礎(chǔ)研究:
1.5.2 家蠶絲蛋白合成及絲腺發(fā)育調(diào)控的相關(guān)研究及進(jìn)展:
第二章 引言
2.1 研究背景及目的意義
2.2 主要研究?jī)?nèi)容
2.2.1 家蠶繭絲產(chǎn)量的遺傳參數(shù)調(diào)查及繭層量的數(shù)量性狀位點(diǎn)分析
2.2.2 主效位點(diǎn)的精細(xì)定位及候選基因篩查
2.2.3 候選基因的功能及馴化特征分析
2.3 技術(shù)路線
第三章 家蠶繭絲產(chǎn)量的遺傳參數(shù)調(diào)查及繭層量的數(shù)量性狀位點(diǎn)分析
3.1 材料與方法
3.1.1 家蠶資源及群體配置
3.1.2 主要試劑耗和耗材
3.1.3 引物
3.1.4 主要儀器
3.1.5 實(shí)驗(yàn)使用的生物分析軟件和數(shù)據(jù)庫
3.1.6 溶液配制
3.1.7 主要實(shí)驗(yàn)方法及步驟
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 繭質(zhì)相關(guān)性狀的遺傳規(guī)律調(diào)查
3.2.2 適合于家蠶的QTL定位策略開發(fā)
3.2.3 家蠶繭層量(CSW)的連鎖及定位分析
3.3 小結(jié)與討論
第四章 csw2的精細(xì)定位及候選基因篩查分析
4.1 材料與方法
4.1.1 家蠶資源及群體配置
4.1.2 主要試劑和溶液配制
4.1.3 引物
4.1.4 主要儀器
4.1.5 主要實(shí)驗(yàn)方法及步驟
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 BSA-sequencing驗(yàn)證初定位結(jié)果
4.2.2 極端群體定位分析
4.2.3 候選區(qū)域基因的表達(dá)模式分析
4.3 小結(jié)與討論
第五章 BmGlcNase1的功能研究及馴化特征分析
5.1 材料與方法
5.1.1 家蠶資源及群體配置
5.1.2 主要試劑和溶液配制
5.1.3 主要儀器
5.1.4 主要實(shí)驗(yàn)方法及步驟
5.1.5 數(shù)據(jù)處理
5.2 結(jié)果與分析
5.2.1 候選基因序列分析及以其為核心的關(guān)聯(lián)分析(后面可以補(bǔ)上關(guān)聯(lián)位點(diǎn)基因型與基因表達(dá)水平之間的關(guān)聯(lián)性)
5.2.2 以候選基因?yàn)楹诵牡年P(guān)聯(lián)分析
5.2.3 轉(zhuǎn)基因檢測(cè)候選基因?qū)SW的影響
5.2.4 后部絲腺異位表達(dá)檢測(cè)候選基因?qū)SW的影響
5.2.5 候選基因的馴化特征分析
5.3 小結(jié)與討論
第六章 綜合與結(jié)論
論文創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
附錄
博士研究生期間發(fā)表論文和參研課題
致謝
本文編號(hào):3740194
【文章頁數(shù)】:113 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 蠶絲的傳統(tǒng)應(yīng)用和新拓展
1.1.1 蠶絲產(chǎn)業(yè)歷史
1.1.2 我國蠶絲產(chǎn)業(yè)的現(xiàn)狀
1.1.3 家蠶相關(guān)新產(chǎn)品開發(fā)及新應(yīng)用拓展研究
1.2 家蠶經(jīng)濟(jì)性狀的馴化和育種選擇
1.2.1 家蠶馴化對(duì)其經(jīng)濟(jì)性狀及家蠶資源的貢獻(xiàn)
1.2.2 基于現(xiàn)代遺傳學(xué)理論的家蠶遺傳選育
1.3 數(shù)量性狀的定位方法
1.3.1 基于連鎖分析的數(shù)量性狀定位方法(QTL)
1.3.2 基于連鎖不平衡的數(shù)量性狀定位方法(Associationanalysis)
1.4 數(shù)量性狀定位常用遺傳分析群體
1.4.1 F2和BC等臨時(shí)性群體的應(yīng)用
1.4.2 重組近交系(RILs)等永久性群體的應(yīng)用
1.4.3 自然群體在關(guān)聯(lián)分析中的應(yīng)用
1.4.4 多親本高級(jí)世代互交系(MAGIC)的應(yīng)用
1.5 家蠶繭絲產(chǎn)量相關(guān)性狀的遺傳基礎(chǔ)及調(diào)控機(jī)制研究現(xiàn)狀
1.5.1 家蠶繭絲產(chǎn)量相關(guān)性狀的遺傳基礎(chǔ)研究:
1.5.2 家蠶絲蛋白合成及絲腺發(fā)育調(diào)控的相關(guān)研究及進(jìn)展:
第二章 引言
2.1 研究背景及目的意義
2.2 主要研究?jī)?nèi)容
2.2.1 家蠶繭絲產(chǎn)量的遺傳參數(shù)調(diào)查及繭層量的數(shù)量性狀位點(diǎn)分析
2.2.2 主效位點(diǎn)的精細(xì)定位及候選基因篩查
2.2.3 候選基因的功能及馴化特征分析
2.3 技術(shù)路線
第三章 家蠶繭絲產(chǎn)量的遺傳參數(shù)調(diào)查及繭層量的數(shù)量性狀位點(diǎn)分析
3.1 材料與方法
3.1.1 家蠶資源及群體配置
3.1.2 主要試劑耗和耗材
3.1.3 引物
3.1.4 主要儀器
3.1.5 實(shí)驗(yàn)使用的生物分析軟件和數(shù)據(jù)庫
3.1.6 溶液配制
3.1.7 主要實(shí)驗(yàn)方法及步驟
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 繭質(zhì)相關(guān)性狀的遺傳規(guī)律調(diào)查
3.2.2 適合于家蠶的QTL定位策略開發(fā)
3.2.3 家蠶繭層量(CSW)的連鎖及定位分析
3.3 小結(jié)與討論
第四章 csw2的精細(xì)定位及候選基因篩查分析
4.1 材料與方法
4.1.1 家蠶資源及群體配置
4.1.2 主要試劑和溶液配制
4.1.3 引物
4.1.4 主要儀器
4.1.5 主要實(shí)驗(yàn)方法及步驟
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 BSA-sequencing驗(yàn)證初定位結(jié)果
4.2.2 極端群體定位分析
4.2.3 候選區(qū)域基因的表達(dá)模式分析
4.3 小結(jié)與討論
第五章 BmGlcNase1的功能研究及馴化特征分析
5.1 材料與方法
5.1.1 家蠶資源及群體配置
5.1.2 主要試劑和溶液配制
5.1.3 主要儀器
5.1.4 主要實(shí)驗(yàn)方法及步驟
5.1.5 數(shù)據(jù)處理
5.2 結(jié)果與分析
5.2.1 候選基因序列分析及以其為核心的關(guān)聯(lián)分析(后面可以補(bǔ)上關(guān)聯(lián)位點(diǎn)基因型與基因表達(dá)水平之間的關(guān)聯(lián)性)
5.2.2 以候選基因?yàn)楹诵牡年P(guān)聯(lián)分析
5.2.3 轉(zhuǎn)基因檢測(cè)候選基因?qū)SW的影響
5.2.4 后部絲腺異位表達(dá)檢測(cè)候選基因?qū)SW的影響
5.2.5 候選基因的馴化特征分析
5.3 小結(jié)與討論
第六章 綜合與結(jié)論
論文創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
附錄
博士研究生期間發(fā)表論文和參研課題
致謝
本文編號(hào):3740194
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