黃沙鱉β-防御素基因克隆及其表達分析
發(fā)布時間:2023-02-07 13:45
【目的】明確β-防御素在黃沙鱉先天免疫中的潛在作用,為開展黃沙鱉綠色病害防治及促進其養(yǎng)殖業(yè)健康發(fā)展打下基礎(chǔ)!痉椒ā窟\用RACE克隆黃沙鱉β-防御素基因(Hs-BD1)cDNA序列,采用SignalP-5.0、PredictProtein、PSIPRED、Robetta和Clustal X等在線軟件進行生物信息學(xué)分析,并通過實時熒光定量PCR檢測Hs-BD1基因在黃沙鱉不同組織中的表達特征及細菌感染前后的表達變化!窘Y(jié)果】Hs-BD1基因c DNA序列全長493 bp,包括72 bp的5’非編碼區(qū)(5’-UTR)、201 bp的開放閱讀框(ORF)及220 bp的3’非編碼區(qū)(3’-UTR)。Hs-BD1基因編碼66個氨基酸殘基,包括22個氨基酸殘基組成的信號肽區(qū)、3個氨基酸殘基組成的前肽區(qū)和41個氨基酸組成的成熟肽區(qū)。其中,成熟肽區(qū)具有6個保守的半胱氨酸殘基(31Cys、58Cys、38Cys、52Cys、42Cys和59Cys)及位于C1和C2間的甘氨...
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
0 引言
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 RNA提取及c DNA合成
1.3 引物設(shè)計及基因克隆
1.4 Hs-BD1基因在黃沙鱉不同組織中的表達分析
1.5 Hs-BD1基因在黃沙鱉感染細菌前后的表達變化
1.6 生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 Hs-BD1基因克隆及序列分析結(jié)果
2.2 Hs-BD1氨基酸序列比對及系統(tǒng)發(fā)育進化分析結(jié)果
2.3 Hs-BD1蛋白空間結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果
2.4 Hs-BD1基因在黃沙鱉不同組織中的表達特征
2.5 攻毒前后Hs-BD1基因在黃沙鱉脾臟中的表達變化
3 討論
4 結(jié)論
本文編號:3736937
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0 引言
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 RNA提取及c DNA合成
1.3 引物設(shè)計及基因克隆
1.4 Hs-BD1基因在黃沙鱉不同組織中的表達分析
1.5 Hs-BD1基因在黃沙鱉感染細菌前后的表達變化
1.6 生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 Hs-BD1基因克隆及序列分析結(jié)果
2.2 Hs-BD1氨基酸序列比對及系統(tǒng)發(fā)育進化分析結(jié)果
2.3 Hs-BD1蛋白空間結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果
2.4 Hs-BD1基因在黃沙鱉不同組織中的表達特征
2.5 攻毒前后Hs-BD1基因在黃沙鱉脾臟中的表達變化
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