【目的】明確β-防御素在黃沙鱉先天免疫中的潛在作用,為開(kāi)展黃沙鱉綠色病害防治及促進(jìn)其養(yǎng)殖業(yè)健康發(fā)展打下基礎(chǔ)�！痉椒ā窟\(yùn)用RACE克隆黃沙鱉β-防御素基因(Hs-BD1)cDNA序列,采用SignalP-5.0、PredictProtein、PSIPRED、Robetta和Clustal X等在線軟件進(jìn)行生物信息學(xué)分析,并通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)Hs-BD1基因在黃沙鱉不同組織中的表達(dá)特征及細(xì)菌感染前后的表達(dá)變化。【結(jié)果】Hs-BD1基因c DNA序列全長(zhǎng)493 bp,包括72 bp的5’非編碼區(qū)(5’-UTR)、201 bp的開(kāi)放閱讀框(ORF)及220 bp的3’非編碼區(qū)(3’-UTR)。Hs-BD1基因編碼66個(gè)氨基酸殘基,包括22個(gè)氨基酸殘基組成的信號(hào)肽區(qū)、3個(gè)氨基酸殘基組成的前肽區(qū)和41個(gè)氨基酸組成的成熟肽區(qū)。其中,成熟肽區(qū)具有6個(gè)保守的半胱氨酸殘基(³¹Cys、⁵⁸Cys、³⁸Cys、⁵²Cys、⁴²Cys和⁵⁹Cys)及位于C1和C2間的甘氨...

【文章頁(yè)數(shù)】：9 頁(yè)

【文章目錄】：
0 引言
1 材料與方法
    1.1 試驗(yàn)材料
    1.2 RNA提取及c DNA合成
    1.3 引物設(shè)計(jì)及基因克隆
    1.4 Hs-BD1基因在黃沙鱉不同組織中的表達(dá)分析
    1.5 Hs-BD1基因在黃沙鱉感染細(xì)菌前后的表達(dá)變化
    1.6 生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 Hs-BD1基因克隆及序列分析結(jié)果
    2.2 Hs-BD1氨基酸序列比對(duì)及系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化分析結(jié)果
    2.3 Hs-BD1蛋白空間結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果
    2.4 Hs-BD1基因在黃沙鱉不同組織中的表達(dá)特征
    2.5 攻毒前后Hs-BD1基因在黃沙鱉脾臟中的表達(dá)變化
3 討論
4 結(jié)論



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