赤擬谷盜四個半胱氨酸蛋白酶基因TccatB25、TccatL11、TccatL13和TcPigk的表達(dá)特性與RNAi效應(yīng)
發(fā)布時間:2023-01-15 11:49
半胱氨酸蛋白酶是一類含有半胱氨酸殘基活性中心并受巰基反應(yīng)基不可逆抑制的蛋白水解酶,在病毒、真菌、原生動物植物、哺乳動物中廣泛分布。除了基本的蛋白分解代謝功能外,還參與生理疾病、抗原呈遞以及其他重要的生命活動的信號傳遞等。本研究基于前期高通量測序結(jié)果,篩選出三個潛在的多功能半胱氨酸蛋白酶CA分支C1家族組織蛋白酶基因:TccatB25、TccatL11和TccatL13。并且以赤擬谷盜為模式昆蟲對組織蛋白酶基因在免疫、生殖、胚胎及胚后幼蟲發(fā)育等功能及其調(diào)節(jié)機制進(jìn)行初步探究。除此之外,本研究鑒定了隸屬于半胱氨酸蛋白酶CD分支C13家族的編碼糖基磷脂酰肌醇轉(zhuǎn)酰胺酶催化亞基的基因TcPigK在昆蟲生長發(fā)育中的功能,且利用RNA-seq對其下游信號轉(zhuǎn)導(dǎo)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行進(jìn)行探究,并得到以下結(jié)果:時期表達(dá)模式顯示:TccatB25、TccatL11和TccatL13基因在赤擬谷盜的各個發(fā)育時期均有表達(dá)。TccatB25在晚期幼蟲表達(dá)量最高。TccatL11在晚期蛹中表達(dá)量最高。而TccatL13在晚期成蟲表達(dá)量最高。組織表達(dá)模式顯示:TccatB25在頭部表達(dá)量最高,其次為觸角、腸以及血淋巴。Tccat...
【文章頁數(shù)】:101 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 .半胱氨酸蛋白酶的研究概況
1.2 .CA分支C1 家族組織蛋白酶的研究概況
1.2.1 .組織蛋白酶酶解體系
1.2.2 .組織蛋白酶的基本生理功能
1.2.3 .組織蛋白酶與免疫信號激活
1.2.4 .昆蟲組織蛋白酶
1.3 .CD分支C13 家族GPI轉(zhuǎn)酰胺酶的研究概況
1.3.1 .GPI錨定的研究概況
1.3.2 .GPI轉(zhuǎn)酰胺酶的分類與功能
1.3.3 .PIGK(GPI8)的功能
1.4 .赤擬谷盜的研究現(xiàn)狀
1.4.1 .赤擬谷盜簡介
1.4.2 .RNAi在害蟲防治中的應(yīng)用
1.4.3 .RNA-seq在昆蟲研究中的應(yīng)用
1.5 .本研究的目的及意義
第二章 赤擬谷盜TccatB25、TccatL11和TccatL13 的免疫功能及其調(diào)節(jié)機制
2.1 引言
2.2 實驗材料、儀器和試劑
2.2.1 實驗材料
2.2.2 實驗儀器
2.2.3 實驗藥品與試劑
2.3 實驗方法
2.3.1 緩沖液的配制
2.3.2 總RNA抽提
2.3.3 cDNA的合成
2.3.4 各個基因不同發(fā)育時期、組織的表達(dá)模式分析
2.3.5 細(xì)菌注射侵染后TccatB25、TccatL11、TccatL13 表達(dá)量檢測
2.3.6 雙鏈RNA(double-strand RNA,dsRNA)的合成
2.3.7 dsRNA的注射
2.3.8 qRT-PCR檢測免疫相關(guān)基因的表達(dá)水平
2.3.9 病原菌入侵后死亡率統(tǒng)計
2.3.10 數(shù)據(jù)處理
2.4 結(jié)果與分析
2.4.1 TccatB25、TccatL11和TccatL13 各個發(fā)育時期表達(dá)模式分析
2.4.2 TccatB25、TccatL11和TccatL13 成蟲各個組織表達(dá)模式分析
2.4.3 TccatB25、TccatL11和TccatL13 對病原菌入侵的應(yīng)答模式分析..
2.4.4 TccatB25、TccatL11和TccatL13 對免疫通路中關(guān)鍵基因的調(diào)節(jié)作用
2.4.5 TccatB25、TccatL11和TccatL13 通過正調(diào)控抗菌肽參與免疫功能。
2.5 討論
第三章 赤擬谷盜TccatB25、TccatL11和TccatL13 的生理功能分析
3.1 引言
3.2 實驗材料、儀器和試劑
3.2.1 實驗材料
3.2.2 實驗儀器
3.2.3 實驗試劑
3.3 實驗方法
3.3.1 qRT-PCR檢測胰島素相關(guān)基因的表達(dá)水平
3.3.2 赤擬谷盜產(chǎn)卵量和孵化率統(tǒng)計
3.3.3 赤擬谷盜成蟲組織的解剖和拍照
3.3.4 數(shù)據(jù)處理
3.4 結(jié)果與分析
3.4.1 TccatB25、TccatL11和TccatL13 對胰島素通路關(guān)鍵基因的調(diào)控作用
3.4.2 TccatB25、TccatL11和TccatL13 在生殖腺形成中的作用
3.4.3 TccatB25、TccatL11和TccatL13 在生殖過程和胚胎發(fā)育的作用..
3.4.4 TccatB25、TccatL11和TccatL13 在胚后幼蟲發(fā)育中的作用
3.5 討論
第四章 赤擬谷盜TcPigK功能研究及下游基因鑒定
4.1 引言
4.2 實驗材料、儀器和試劑
4.2.1 實驗材料
4.2.2 實驗儀器
4.2.3 實驗藥品與試劑
4.3 實驗方法
4.3.1 PigK基因的克隆與序列比對
4.3.2 時期組織表達(dá)分析與RNAi分析
4.3.3 總RNA的抽提、純化及質(zhì)量檢測
4.3.4 RNA測序?qū)嶒灹鞒?br> 4.3.5 RNA測序標(biāo)準(zhǔn)信息分析
4.4 結(jié)果與分析
4.4.1 TcPigK結(jié)構(gòu)及序列比對分析
4.4.2 TcPigK各個發(fā)育時期及組織表達(dá)模式分析
4.4.3 TcPigK RNAi分析
4.4.4 TcPigK Illumina測序結(jié)果比對到赤擬谷盜基因組
4.4.5 基因表達(dá)量分析
4.4.6 差異表達(dá)基因的鑒定
4.4.7 差異表達(dá)基因的功能分析
4.5 討論
第五章 結(jié)論
創(chuàng)新與不足
參考文獻(xiàn)
期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文及研究結(jié)果
致謝
本文編號:3731010
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【學(xué)位級別】:碩士
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摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 .半胱氨酸蛋白酶的研究概況
1.2 .CA分支C1 家族組織蛋白酶的研究概況
1.2.1 .組織蛋白酶酶解體系
1.2.2 .組織蛋白酶的基本生理功能
1.2.3 .組織蛋白酶與免疫信號激活
1.2.4 .昆蟲組織蛋白酶
1.3 .CD分支C13 家族GPI轉(zhuǎn)酰胺酶的研究概況
1.3.1 .GPI錨定的研究概況
1.3.2 .GPI轉(zhuǎn)酰胺酶的分類與功能
1.3.3 .PIGK(GPI8)的功能
1.4 .赤擬谷盜的研究現(xiàn)狀
1.4.1 .赤擬谷盜簡介
1.4.2 .RNAi在害蟲防治中的應(yīng)用
1.4.3 .RNA-seq在昆蟲研究中的應(yīng)用
1.5 .本研究的目的及意義
第二章 赤擬谷盜TccatB25、TccatL11和TccatL13 的免疫功能及其調(diào)節(jié)機制
2.1 引言
2.2 實驗材料、儀器和試劑
2.2.1 實驗材料
2.2.2 實驗儀器
2.2.3 實驗藥品與試劑
2.3 實驗方法
2.3.1 緩沖液的配制
2.3.2 總RNA抽提
2.3.3 cDNA的合成
2.3.4 各個基因不同發(fā)育時期、組織的表達(dá)模式分析
2.3.5 細(xì)菌注射侵染后TccatB25、TccatL11、TccatL13 表達(dá)量檢測
2.3.6 雙鏈RNA(double-strand RNA,dsRNA)的合成
2.3.7 dsRNA的注射
2.3.8 qRT-PCR檢測免疫相關(guān)基因的表達(dá)水平
2.3.9 病原菌入侵后死亡率統(tǒng)計
2.3.10 數(shù)據(jù)處理
2.4 結(jié)果與分析
2.4.1 TccatB25、TccatL11和TccatL13 各個發(fā)育時期表達(dá)模式分析
2.4.2 TccatB25、TccatL11和TccatL13 成蟲各個組織表達(dá)模式分析
2.4.3 TccatB25、TccatL11和TccatL13 對病原菌入侵的應(yīng)答模式分析..
2.4.4 TccatB25、TccatL11和TccatL13 對免疫通路中關(guān)鍵基因的調(diào)節(jié)作用
2.4.5 TccatB25、TccatL11和TccatL13 通過正調(diào)控抗菌肽參與免疫功能。
2.5 討論
第三章 赤擬谷盜TccatB25、TccatL11和TccatL13 的生理功能分析
3.1 引言
3.2 實驗材料、儀器和試劑
3.2.1 實驗材料
3.2.2 實驗儀器
3.2.3 實驗試劑
3.3 實驗方法
3.3.1 qRT-PCR檢測胰島素相關(guān)基因的表達(dá)水平
3.3.2 赤擬谷盜產(chǎn)卵量和孵化率統(tǒng)計
3.3.3 赤擬谷盜成蟲組織的解剖和拍照
3.3.4 數(shù)據(jù)處理
3.4 結(jié)果與分析
3.4.1 TccatB25、TccatL11和TccatL13 對胰島素通路關(guān)鍵基因的調(diào)控作用
3.4.2 TccatB25、TccatL11和TccatL13 在生殖腺形成中的作用
3.4.3 TccatB25、TccatL11和TccatL13 在生殖過程和胚胎發(fā)育的作用..
3.4.4 TccatB25、TccatL11和TccatL13 在胚后幼蟲發(fā)育中的作用
3.5 討論
第四章 赤擬谷盜TcPigK功能研究及下游基因鑒定
4.1 引言
4.2 實驗材料、儀器和試劑
4.2.1 實驗材料
4.2.2 實驗儀器
4.2.3 實驗藥品與試劑
4.3 實驗方法
4.3.1 PigK基因的克隆與序列比對
4.3.2 時期組織表達(dá)分析與RNAi分析
4.3.3 總RNA的抽提、純化及質(zhì)量檢測
4.3.4 RNA測序?qū)嶒灹鞒?br> 4.3.5 RNA測序標(biāo)準(zhǔn)信息分析
4.4 結(jié)果與分析
4.4.1 TcPigK結(jié)構(gòu)及序列比對分析
4.4.2 TcPigK各個發(fā)育時期及組織表達(dá)模式分析
4.4.3 TcPigK RNAi分析
4.4.4 TcPigK Illumina測序結(jié)果比對到赤擬谷盜基因組
4.4.5 基因表達(dá)量分析
4.4.6 差異表達(dá)基因的鑒定
4.4.7 差異表達(dá)基因的功能分析
4.5 討論
第五章 結(jié)論
創(chuàng)新與不足
參考文獻(xiàn)
期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文及研究結(jié)果
致謝
本文編號:3731010
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