“丁氏”核心種質(zhì)（150份）具有豐富遺傳變異,對(duì)于水稻非生物脅迫（鋁毒和冷害）研究具有重要價(jià)值。本研究對(duì)群體進(jìn)行全基因組簡(jiǎn)化測(cè)序,分析其結(jié)構(gòu)分層與遺傳關(guān)系;并結(jié)合耐鋁表型數(shù)據(jù)（相對(duì)根長(zhǎng)）與耐冷表型數(shù)據(jù)（死苗率）對(duì)核心種質(zhì)群體進(jìn)行抗逆性的全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）（混合線性模型）,挖掘及驗(yàn)證水稻核心種質(zhì)中優(yōu)異抗逆基因。研究結(jié)果簡(jiǎn)述如下:（1）SLAF-seq測(cè)序標(biāo)記的高密度SNP位點(diǎn),群體結(jié)構(gòu)分析結(jié)果顯示群體分為2-4個(gè)亞群。采用GWAS方法,鑒定到153個(gè)與耐鋁顯著關(guān)聯(lián)的SNP位點(diǎn),并定位30個(gè)與耐鋁相關(guān)的QTL,其中6個(gè)QTL與前人研究結(jié)果共定位。進(jìn)一步對(duì)具有較高顯著性SNP位點(diǎn)（qALT3.2、qALT3.3、qALT3.4、qALT3.5,qALT1.2、qALT1.5、qALT2.3、qALT3.6、qALT3.7、qALT4.1、qALT6.1,和qALT9.1）所在QTL區(qū)域的候選基因進(jìn)行RT-PCR檢測(cè)、基因注釋分析、氨基酸序列分析以及表達(dá)譜分析的多重篩選,最終定位到兩個(gè)與耐鋁相關(guān)的新基因（Os03g0437200與Os01g0304100）,對(duì)這兩個(gè)基因的功能驗(yàn)證有待... 

【文章頁(yè)數(shù)】：92 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

世界水稻產(chǎn)量與消耗量變化預(yù)測(cè)

植物低溫應(yīng)答的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)Figure1-2Networksofplantcold-responsivegeneregulatory本圖引用肖寧等.2016

水稻耐冷性相關(guān)QTLFigure1-3QTLrelatedtocoldtoleranceinrice

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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[2]基于表達(dá)譜芯片和新一代測(cè)序技術(shù)的高通量基因分型方法的開(kāi)發(fā)[D]. 謝為博.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
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碩士論文
[1]黑龍江省水稻骨干親本對(duì)衍生品種的遺傳貢獻(xiàn)及孕穗期耐冷性的關(guān)聯(lián)分析[D]. 王允祥.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]水稻核心種質(zhì)抗倒特性及其主要農(nóng)藝性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析[D]. 姚玉瑩.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014



本文編號(hào)：3716906