MADS-box基因家族是一類特異識別結(jié)合[CArG]（A-rich）DNA特征序列的轉(zhuǎn)錄因子家族;在植物中參與調(diào)節(jié)包括植物花、果、葉、根的發(fā)育在內(nèi)的多個重要的植物發(fā)育過程;此類基因在高等植物中大量存在,僅在擬南芥中就存在109個MADS-box基因。對于這一家族的起源進(jìn)化分析已經(jīng)積累相當(dāng)豐碩的成果;比如這一家族起源于一次發(fā)生在真核生物祖先形成前的拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅱ的A亞基復(fù)制加倍且經(jīng)歷另一次早期真核祖先中的基因加倍分化出了 SRF和MEF2兩類基因的祖先。然而,前人的分析多集中在遠(yuǎn)源進(jìn)化;其近源的分析少有人做,本研究欲豐富這一不足,聚焦于十字花科植物,以期揭示MADS-box基因家族的十字花科科內(nèi)進(jìn)化史。本研究首先分析了目前的27個已測序十字花科物種測序質(zhì)量并結(jié)合現(xiàn)行十字花科植物分類系統(tǒng)確定有代表性的16個物種作為樣本,并選取十字花科植物最近源的7個已測序物種作為外類群。之后,對16個樣本植物進(jìn)行了 MADS-box基因檢測鑒定,得到了 2168個基因;最后,對這些基因進(jìn)行了逐層深入的系統(tǒng)發(fā)育分析。研究結(jié)果表明,在現(xiàn)存十字花科早期共同祖先中至少存在50個MADS-box基因——19個tYy... 

【文章頁數(shù)】：50 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
1 緒論
    1.1 十字花科植物簡介
    1.2 生物學(xué)中的系統(tǒng)發(fā)育分析
    1.3 MADS-box基因家族簡介
    1.4 MADS蛋白的結(jié)構(gòu)和細(xì)胞定位
    1.5 MADS蛋白的功能
    1.6 MADS-box家族進(jìn)化分析進(jìn)展
2 材料與方法
    2.1 生物信息學(xué)工具
    2.2 選材并獲取數(shù)據(jù)
    2.3 MADS基因預(yù)測
    2.4 序列比對和進(jìn)化樹繪制
3 結(jié)果與分析
    3.1 MADS-box全家族進(jìn)化分析
    3.2 TypeⅠ基因及其三個亞類的進(jìn)化分析
    3.3 TypeⅡ基因整體進(jìn)化分析
    3.4 TypeⅡ基因逐亞類分析
    3.5 總結(jié)
    3.6 討論
參考文獻(xiàn)
附錄A Type I在十字花科中的分布統(tǒng)計(jì)
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]擬南芥和琴葉擬南芥中MADS-box基因的比較進(jìn)化分析[J]. 薛皓月,徐桂霞,國春策,山紅艷,孔宏智.  生物多樣性. 2010(02)



本文編號：3711993