小麥PIN基因家族的鑒定及表達(dá)分析
發(fā)布時間:2022-12-06 19:59
【目的】PIN(puroindoline)是植物所特有的一類蛋白家族,對控制小麥籽粒硬度有重要功能。分析小麥PIN家族成員在全基因組的分布、結(jié)構(gòu)及進(jìn)化,研究其在不同組織的表達(dá)特異性以及在不同硬度種子的表達(dá)模式,為闡明小麥PIN基因家族的生物學(xué)功能奠定基礎(chǔ)!痉椒ā扛鶕(jù)已報道的小麥PIN基因和大麥HIN基因,利用BLASTP和HMM方法,在最新發(fā)布的小麥中國春參考序列中鑒定小麥PIN基因家族成員。利用UniProt、URGI、PFAM、CDD、expVIP等數(shù)據(jù)庫,采用Clustal X、MEGA 7.0、ExPASy、MEME、GSDS、TB tools、GraphPad Prism5等軟件進(jìn)行生物信息學(xué)分析。采用qRT-PCR方法檢測TaPIN基因家族在不同籽粒硬度小麥樣品中的表達(dá)情況!窘Y(jié)果】共鑒定出19個小麥PIN基因,集中成簇分布于第1、5和7染色體同源群,編碼148—327個氨基酸,編碼蛋白相對分子量為16.39—37.19 kD,等電點為6.35—9.34。通過結(jié)構(gòu)域和系統(tǒng)發(fā)育分析,可將19個TaPIN基因分為A和B兩大類。大部分TaPINs基因僅有1個外顯子,沒有內(nèi)含子,...
【文章頁數(shù)】:10 頁
【文章目錄】:
0 引言
1 材料與方法
1.1 試驗材料和處理方法
1.2 小麥PIN基因家族的鑒定和系統(tǒng)發(fā)育分析
1.3 小麥PIN基因的序列分析
1.4 小麥PIN基因的表達(dá)分析
2 結(jié)果
2.1 小麥PIN基因的鑒定和序列分析
2.2 小麥PIN基因的系統(tǒng)發(fā)育分析、蛋白保守結(jié)構(gòu)域及基因結(jié)構(gòu)分析
2.3 小麥PIN基因在不同組織、不同時期的表達(dá)分析
2.4 小麥PIN基因在不同硬度小麥中的相對表達(dá)分析
3 討論
4 結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]小麥puroindoline及其相關(guān)基因分子遺傳基礎(chǔ)研究進(jìn)展[J]. 陳鋒,董中東,程西永,詹克慧,許海霞,崔黨群. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(06)
[2]氮、鉀及其互作對兩種質(zhì)型小麥品質(zhì)性狀的影響[J]. 李友軍,熊瑛,駱炳山. 干旱地區(qū)農(nóng)業(yè)研究. 2006(02)
[3]施氮量對小麥籽粒蛋白質(zhì)組分含量及加工品質(zhì)的影響[J]. 王月福,于振文,李尚霞,余松烈. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2002(09)
本文編號:3711543
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【文章目錄】:
0 引言
1 材料與方法
1.1 試驗材料和處理方法
1.2 小麥PIN基因家族的鑒定和系統(tǒng)發(fā)育分析
1.3 小麥PIN基因的序列分析
1.4 小麥PIN基因的表達(dá)分析
2 結(jié)果
2.1 小麥PIN基因的鑒定和序列分析
2.2 小麥PIN基因的系統(tǒng)發(fā)育分析、蛋白保守結(jié)構(gòu)域及基因結(jié)構(gòu)分析
2.3 小麥PIN基因在不同組織、不同時期的表達(dá)分析
2.4 小麥PIN基因在不同硬度小麥中的相對表達(dá)分析
3 討論
4 結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]小麥puroindoline及其相關(guān)基因分子遺傳基礎(chǔ)研究進(jìn)展[J]. 陳鋒,董中東,程西永,詹克慧,許海霞,崔黨群. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(06)
[2]氮、鉀及其互作對兩種質(zhì)型小麥品質(zhì)性狀的影響[J]. 李友軍,熊瑛,駱炳山. 干旱地區(qū)農(nóng)業(yè)研究. 2006(02)
[3]施氮量對小麥籽粒蛋白質(zhì)組分含量及加工品質(zhì)的影響[J]. 王月福,于振文,李尚霞,余松烈. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2002(09)
本文編號:3711543
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