bZIP轉(zhuǎn)錄因子參與多種非生物脅迫,為研究澇害脅迫下大豆bZIP轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控作用,本研究對耐澇性極強(qiáng)大豆品種齊黃34進(jìn)行淹水處理,對處理不同時(shí)間根部組織樣品進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,篩選出1個(gè)響應(yīng)耐澇的差異表達(dá)的bZIP轉(zhuǎn)錄因子編碼基因Glyma04g04170,其qRT-PCR分析結(jié)果與轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)趨勢一致,在4個(gè)取樣時(shí)間點(diǎn)都下調(diào)表達(dá),證明該轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)具有可靠性,Glyma04g04170可能通過負(fù)調(diào)控的方式參與大豆耐澇應(yīng)答反應(yīng)。Glyma04g04170蛋白保守結(jié)構(gòu)域分析發(fā)現(xiàn)該蛋白內(nèi)部含有bZIP保守結(jié)構(gòu)域。蛋白三級結(jié)構(gòu)中存在參與寡聚化作用的亮氨酸拉鏈保守結(jié)構(gòu)域,同時(shí)也包含與特異DNA序列相結(jié)合、起核定位信號作用的N-x7-R/K結(jié)構(gòu)。分離鑒定的Glyma04g04170蛋白是一個(gè)結(jié)合AREB/ABF的bZIP轉(zhuǎn)錄因子,預(yù)測結(jié)果顯示,與該蛋白互作的蛋白主要是絲氨酸/蘇氨酸殘基蛋白磷酸酶。轉(zhuǎn)錄組和RT-qPCR數(shù)據(jù)表明,Glyma02g37090基因在4個(gè)取樣時(shí)間點(diǎn)的表達(dá)量都呈顯著性差異,處理與對照相比,表達(dá)量升高。 

【文章頁數(shù)】：7 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 試驗(yàn)設(shè)計(jì)
    1.3 方法
        1.3.1 RNA提取和轉(zhuǎn)錄組測序
        1.3.2 大豆響應(yīng)澇害bZIP轉(zhuǎn)錄因子篩選
        1.3.3 qRT-PCR表達(dá)分析
        1.3.4 基因理化性質(zhì)及保守結(jié)構(gòu)域分析
        1.3.5 蛋白高級結(jié)構(gòu)分析
        1.3.6 蛋白互作分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中差異表達(dá)基因分析
    2.2 bZIP轉(zhuǎn)錄因子的篩選與鑒定
    2.3 Glyma04g04170表達(dá)情況的qRT-PCR驗(yàn)證
    2.4 Glyma04g04170的理化性質(zhì)和保守結(jié)構(gòu)域分析
    2.5 Glyma04g04170高級結(jié)構(gòu)預(yù)測
    2.6 Glyma04g04170蛋白互作分析
3 討 論
4 結(jié) 論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]大豆轉(zhuǎn)錄因子GmbZIP60對非生物脅迫的表達(dá)模式分析[J]. 邢錦城,孫晨曦,洪立洲,許玲,徐照龍,張大勇.  大豆科學(xué). 2018(01)



本文編號：3686211