胎生蜥蜴MHC Ⅰ類基因的多態(tài)性及對母胎免疫影響的研究
發(fā)布時間:2022-07-08 13:25
胎生蜥蜴作為古北界蜥蜴的代表,具有卵胎生繁殖模式。在中國的分布僅局限于黑龍江、內(nèi)蒙古和新疆3個省區(qū)。由于人為干擾對其生境的破壞,導(dǎo)致胎生蜥蜴已處于漸危狀態(tài)。主要組織相容性復(fù)合體(Major histocompatibility complex,MHC)基因是免疫系統(tǒng)中的具有高度多態(tài)性的功能基因之一,且由于識別多種病原體和適應(yīng)環(huán)境的需要,使其抗原結(jié)合區(qū)存在較高的變異性。本研究首次對大小興安嶺山區(qū)共4個地區(qū)的胎生蜥蜴的74個個體的MHC Ⅰ類基因多態(tài)性和母胎免疫影響進行分析,得出以下4個結(jié)果:1.從19個個體中克隆出570條序列,其中α2的核苷酸長度為201~223 bp,α3的核苷酸長度為181~184 bp,α2和α3的氨基酸長度為111~178 aa。實驗中共得到47個等位基因,推測至少有3~6個MHC Ⅰ類基因座,符合基因“出生-死亡”進化模式,說明其在進化過程中經(jīng)歷了基因復(fù)制或丟失。2.通過對核苷酸序列變異位點的計算得出4個種群核苷酸多態(tài)性π在0.305~0.659之間,表明胎生蜥蜴核苷酸多態(tài)性水平較高,其中牙克石種群核苷酸多態(tài)性最高,嫩江種群最低。3.綜合平均氨基酸距離小于平均...
【文章頁數(shù)】:73 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第1章 緒論
1.1 胎生蜥蜴研究現(xiàn)狀
1.2 主要組織相容性復(fù)合體研究進展及其應(yīng)用
1.2.1 MHC分子結(jié)構(gòu)與功能
1.2.2 MHC基因特征
1.2.3 MHC分子在非爬行動物中的研究概況
1.2.4 爬行類動物經(jīng)典MHCⅠ類基因的遺傳進化機制研究
1.3 母胎免疫機制與遺傳多態(tài)性
1.3.1 母胎免疫機制概述
1.3.2 遺傳多態(tài)性分析與應(yīng)用
1.4 研究目的及意義
第2章 材料和方法
2.1 實驗材料
2.1.1 樣品的采集與飼養(yǎng)
2.1.2 主要儀器和設(shè)備
2.1.3 主要的實驗試劑及配制
2.2 實驗方法
2.3 數(shù)據(jù)分析
2.3.1 等位基因的確定及序列比對
2.3.2 計算遺傳多態(tài)性指標(biāo)
2.3.3 系統(tǒng)進化關(guān)系分析
2.3.4 選擇信號檢測
2.3.5 重組檢測
第3章 胎生蜥蜴MHCⅠ類基因的多態(tài)性
3.1 基因組DNA提取結(jié)果的檢測
3.2 總RNA提取結(jié)果的檢測
3.3 常規(guī)PCR產(chǎn)物檢測及純化測序
3.4 遺傳多態(tài)性分析
3.4.1 序列多態(tài)性分析
3.4.2 正選擇位點分析
3.4.3 跨種多態(tài)性分析
3.4.4 重組檢測
3.5 討論
3.5.1 MHCⅠ基因多態(tài)性分析
3.5.2 正選擇
3.5.3 跨物種多態(tài)性
3.5.4 重組現(xiàn)象
3.6 本章小結(jié)
第4章 胎生蜥蜴MHCⅠ類基因?qū)δ柑ッ庖叩挠绊?br> 4.1 RT-PCR產(chǎn)物檢測
4.2 不同生理時期基因的相對表達量
4.3 不同組織基因相對表達量
4.4 討論
4.5 本章小結(jié)
結(jié)論
參考文獻
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]母—胎界面免疫分子的相互作用以及其對妊娠結(jié)局的影響[J]. 張衛(wèi)國,李悅含,王仁杰,耿玉迪,靳鐳,廖書杰. 中國婦產(chǎn)科臨床雜志. 2018(05)
[2]中華鱉實時定量PCR內(nèi)參基因的篩選與評價[J]. 劉文婷,張貝貝,張耀紅,管越強. 內(nèi)蒙古大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2017(05)
[3]HLA-G與復(fù)發(fā)性流產(chǎn)的相關(guān)性研究進展[J]. 顧靈,何曉燕. 中國優(yōu)生與遺傳雜志. 2017(03)
[4]HLA-G與母胎免疫耐受[J]. 李靜博,周美英,許惠惠,顏衛(wèi)華. 醫(yī)學(xué)研究雜志. 2017(01)
[5]珠江口3種鯨豚的MHC-I基因多態(tài)性研究[J]. 余新建,張西陽,林文治,周蕊蓮,吳玉萍. 海洋科學(xué). 2016(10)
[6]母—胎免疫耐受研究進展[J]. 王松存,杜美蓉,李大金. 科學(xué)通報. 2016(27)
[7]我國蜥蜴科動物線粒體基因組全序列的研究現(xiàn)狀[J]. 馬微微,劉歡,趙文閣,劉鵬. 野生動物學(xué)報. 2016(01)
[8]平衡選擇和重組作用共同維持大熊貓I類MHC基因的遺傳變異(英文)[J]. 于方鑒,朱英,熊鐵一,萬秋紅,張和民. Science Bulletin. 2015(01)
[9]尼羅羅非魚MHC Ⅰα全長cDNA的克隆、多態(tài)性及組織表達特征[J]. 黎建平,高風(fēng)英,盧邁新,曹建萌,朱華平,可小麗,劉志剛. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2014(06)
[10]3種麻蜥MHC I類基因外顯子3和外顯子4序列特征[J]. 原秀云,劉金龍,曾曉茂,郭憲光. 應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)報. 2014(05)
博士論文
[1]川金絲猴MHCⅡ類基因遺傳分析及其對配偶選擇的影響[D]. 宋曉越.西北大學(xué) 2016
[2]浙江揚子鱷遷地保護種群的譜系構(gòu)建和放歸野外奠基種群的篩選[D]. 倪小偉.浙江大學(xué) 2012
碩士論文
[1]基于微衛(wèi)星對中國胎生蜥蜴遺傳多樣性及親權(quán)關(guān)系的研究[D]. 趙丹.哈爾濱師范大學(xué) 2017
[2]胎生蜥蜴遺傳多樣性研究[D]. 劉歡.哈爾濱師范大學(xué) 2016
[3]有尾兩棲動物MHC1類基因的多態(tài)性及其進化機制[D]. 李穎華.華中師范大學(xué) 2016
[4]虎紋蛙MHCⅠ類、Ⅱ類基因的克隆與多態(tài)性分析[D]. 程巖巖.浙江師范大學(xué) 2016
[5]HCV5’非翻譯區(qū)靶向性M1GS核酶構(gòu)建及其胞內(nèi)反義活性的研究[D]. 羅桂飛.廣東藥學(xué)院 2013
本文編號:3657110
【文章頁數(shù)】:73 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第1章 緒論
1.1 胎生蜥蜴研究現(xiàn)狀
1.2 主要組織相容性復(fù)合體研究進展及其應(yīng)用
1.2.1 MHC分子結(jié)構(gòu)與功能
1.2.2 MHC基因特征
1.2.3 MHC分子在非爬行動物中的研究概況
1.2.4 爬行類動物經(jīng)典MHCⅠ類基因的遺傳進化機制研究
1.3 母胎免疫機制與遺傳多態(tài)性
1.3.1 母胎免疫機制概述
1.3.2 遺傳多態(tài)性分析與應(yīng)用
1.4 研究目的及意義
第2章 材料和方法
2.1 實驗材料
2.1.1 樣品的采集與飼養(yǎng)
2.1.2 主要儀器和設(shè)備
2.1.3 主要的實驗試劑及配制
2.2 實驗方法
2.3 數(shù)據(jù)分析
2.3.1 等位基因的確定及序列比對
2.3.2 計算遺傳多態(tài)性指標(biāo)
2.3.3 系統(tǒng)進化關(guān)系分析
2.3.4 選擇信號檢測
2.3.5 重組檢測
第3章 胎生蜥蜴MHCⅠ類基因的多態(tài)性
3.1 基因組DNA提取結(jié)果的檢測
3.2 總RNA提取結(jié)果的檢測
3.3 常規(guī)PCR產(chǎn)物檢測及純化測序
3.4 遺傳多態(tài)性分析
3.4.1 序列多態(tài)性分析
3.4.2 正選擇位點分析
3.4.3 跨種多態(tài)性分析
3.4.4 重組檢測
3.5 討論
3.5.1 MHCⅠ基因多態(tài)性分析
3.5.2 正選擇
3.5.3 跨物種多態(tài)性
3.5.4 重組現(xiàn)象
3.6 本章小結(jié)
第4章 胎生蜥蜴MHCⅠ類基因?qū)δ柑ッ庖叩挠绊?br> 4.1 RT-PCR產(chǎn)物檢測
4.2 不同生理時期基因的相對表達量
4.3 不同組織基因相對表達量
4.4 討論
4.5 本章小結(jié)
結(jié)論
參考文獻
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]母—胎界面免疫分子的相互作用以及其對妊娠結(jié)局的影響[J]. 張衛(wèi)國,李悅含,王仁杰,耿玉迪,靳鐳,廖書杰. 中國婦產(chǎn)科臨床雜志. 2018(05)
[2]中華鱉實時定量PCR內(nèi)參基因的篩選與評價[J]. 劉文婷,張貝貝,張耀紅,管越強. 內(nèi)蒙古大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2017(05)
[3]HLA-G與復(fù)發(fā)性流產(chǎn)的相關(guān)性研究進展[J]. 顧靈,何曉燕. 中國優(yōu)生與遺傳雜志. 2017(03)
[4]HLA-G與母胎免疫耐受[J]. 李靜博,周美英,許惠惠,顏衛(wèi)華. 醫(yī)學(xué)研究雜志. 2017(01)
[5]珠江口3種鯨豚的MHC-I基因多態(tài)性研究[J]. 余新建,張西陽,林文治,周蕊蓮,吳玉萍. 海洋科學(xué). 2016(10)
[6]母—胎免疫耐受研究進展[J]. 王松存,杜美蓉,李大金. 科學(xué)通報. 2016(27)
[7]我國蜥蜴科動物線粒體基因組全序列的研究現(xiàn)狀[J]. 馬微微,劉歡,趙文閣,劉鵬. 野生動物學(xué)報. 2016(01)
[8]平衡選擇和重組作用共同維持大熊貓I類MHC基因的遺傳變異(英文)[J]. 于方鑒,朱英,熊鐵一,萬秋紅,張和民. Science Bulletin. 2015(01)
[9]尼羅羅非魚MHC Ⅰα全長cDNA的克隆、多態(tài)性及組織表達特征[J]. 黎建平,高風(fēng)英,盧邁新,曹建萌,朱華平,可小麗,劉志剛. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2014(06)
[10]3種麻蜥MHC I類基因外顯子3和外顯子4序列特征[J]. 原秀云,劉金龍,曾曉茂,郭憲光. 應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)報. 2014(05)
博士論文
[1]川金絲猴MHCⅡ類基因遺傳分析及其對配偶選擇的影響[D]. 宋曉越.西北大學(xué) 2016
[2]浙江揚子鱷遷地保護種群的譜系構(gòu)建和放歸野外奠基種群的篩選[D]. 倪小偉.浙江大學(xué) 2012
碩士論文
[1]基于微衛(wèi)星對中國胎生蜥蜴遺傳多樣性及親權(quán)關(guān)系的研究[D]. 趙丹.哈爾濱師范大學(xué) 2017
[2]胎生蜥蜴遺傳多樣性研究[D]. 劉歡.哈爾濱師范大學(xué) 2016
[3]有尾兩棲動物MHC1類基因的多態(tài)性及其進化機制[D]. 李穎華.華中師范大學(xué) 2016
[4]虎紋蛙MHCⅠ類、Ⅱ類基因的克隆與多態(tài)性分析[D]. 程巖巖.浙江師范大學(xué) 2016
[5]HCV5’非翻譯區(qū)靶向性M1GS核酶構(gòu)建及其胞內(nèi)反義活性的研究[D]. 羅桂飛.廣東藥學(xué)院 2013
本文編號:3657110
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