發(fā)布時(shí)間：2022-05-08 14:07

　　南極地區(qū)氣候惡劣,營養(yǎng)匱乏,不利于生物的生存,但土壤中存在著較為豐富的微生物群落,這些土壤微生物為適應(yīng)南極極端環(huán)境形成了獨(dú)特的生物多樣性、遺傳機(jī)制和代謝途徑。本研究以第31次南極科學(xué)考察期間于南極地區(qū)ASPA113和ASPA125區(qū)域采集的8例土壤樣本為研究對(duì)象,通過宏基因組高通量測序,初步分析了南極地區(qū)土壤微生物多樣性和群落結(jié)構(gòu)。根據(jù)分析結(jié)果選取最具有物種多樣性的一例土壤樣本進(jìn)行傳統(tǒng)的分離培養(yǎng)及形態(tài)觀察,對(duì)篩選出的70株細(xì)菌進(jìn)行ddRAD測序,對(duì)測序數(shù)據(jù)分析完成物種鑒定。分離得到的部分微生物通過鹽脅迫條件下培養(yǎng),篩選出3株具有耐鹽特征的細(xì)菌,并通過基因組二代測序和三代測序,組裝拼接繪制了242號(hào)細(xì)菌（Pseudomonas sp.TKP）的全基因組圖。為進(jìn)一步挖掘與耐鹽調(diào)控機(jī)制相關(guān)的功能基因,對(duì)鹽脅迫條件下培養(yǎng)的細(xì)菌進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測序。基于宏基因組高通量測序技術(shù),初步分析南極土壤的微生物種群構(gòu)成。結(jié)果顯示,8例土壤樣本注釋共有9門14綱27目41科52屬74種。8份南極土壤樣本中的微生物包含酸桿菌門（Acidobacteria）、放線菌門（Actinobacteria）、擬桿菌門（Ba... 

【文章頁數(shù)】：90 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

Nanopore測序原理[61]

1緒論81.5.2技術(shù)路線圖1-2技術(shù)路線圖Figure1-2Thetechnicalroute1.5.3研究意義(1)探究微生物多樣性可以為南極土壤微生物的資源利用提供理論依據(jù)，為開發(fā)利用南極可培養(yǎng)微生物提供材料，還可以為研究南極土壤環(huán)境與微生物動(dòng)態(tài)變化提供數(shù)據(jù)支持。(2)本研究基于ddRAD技術(shù)進(jìn)行物種鑒定，經(jīng)濟(jì)高效，在分子生物學(xué)方面進(jìn)行菌種鑒定提供了新的思路。(3)通過對(duì)南極土壤微生物進(jìn)行分離培養(yǎng)和功能基因篩選以探究微生物適應(yīng)南極環(huán)境而產(chǎn)生的生理特性和遺傳機(jī)制；通過篩選功能基因，為改善其他鹽堿、干旱地區(qū)的生物生存環(huán)境，增加經(jīng)濟(jì)作物和綠色植物的種植面積提供研究基矗

煙臺(tái)大學(xué)碩士學(xué)位論文17MS14S16S22S24S59S61S62S632.3實(shí)驗(yàn)結(jié)果2.3.1宏基因組提取結(jié)果電泳檢測如圖2-1所示，主帶完整性較好，輕微降解，無明顯雜帶。NanoDrop測定樣本吸光度A260/A280（表2-9）均分布于1.8~2.0，純度符合實(shí)驗(yàn)要求。根據(jù)Qubit檢測結(jié)果（表2-9），樣本量可以滿足兩次及以上的建庫需求。表2-9NanoDrop和Qubit檢測DNA質(zhì)量結(jié)果Table2-9QualityresultdetectedbyNanoDropforgenomicDNA圖2-1DNA電泳結(jié)果Figure2-1Agarosegel(1%)electrophoresisresultsofgenomicDNA注：M表示SuperDNAMarker。2.3.2宏基因組文庫構(gòu)建結(jié)果根據(jù)電泳檢測結(jié)果（圖2-2），發(fā)現(xiàn)8個(gè)樣本的文庫片段均分布在500bp上下，樣本編號(hào)A260/A280A260/A230Qubit濃度單位S141.952.010.592ng/μLS161.801.980.964ng/μLS221.902.051.12ng/μLS241.891921.67ng/μLS591.951.912.06ng/μLS611.821.774.86ng/μLS621.901.862.42ng/μLS631.921.834.76ng/μL10000bp

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號(hào)：3651795