通過外顯子組基因測序發(fā)現(xiàn)2個MEN1基因突變可導(dǎo)致散發(fā)性胰島素細(xì)胞瘤
發(fā)布時(shí)間:2022-02-22 18:26
目的:胰島素瘤(insulinoma)又稱胰島β-細(xì)胞瘤,是一種以分泌大量胰島素而引起發(fā)作性低血糖癥候群為特征的疾病,為器質(zhì)性低血糖癥中較常見的病因。本實(shí)驗(yàn)通過采用外顯子組測序技術(shù)對散發(fā)性胰島素瘤患者的腫瘤組織和血液DNA進(jìn)行外顯子組測序,以篩選獲得散發(fā)性胰島素瘤的致病基因突變,為胰島素瘤的早期篩查和靶向治療提供新的依據(jù)。方法:選取河北醫(yī)科大學(xué)第二醫(yī)院肝膽外科2015年9月至2016年9月期間收治的診斷明確的散發(fā)性胰島素細(xì)胞瘤患者3例。首先對腫瘤組織和配對的血液樣本進(jìn)行DNA提取,建庫,進(jìn)行Illumina HiSeq 2500測序。測序完成后使用BWA軟件將測序片段與參考基因組進(jìn)行對比,并使用Picard軟件去除PCR-duplication產(chǎn)生的測序序列。參考hg19基因組對3例患者基因測序結(jié)果進(jìn)行SNV和InDel分析后,通過Mutect對配對樣本進(jìn)行體細(xì)胞突變預(yù)測,而后采用annovar程序結(jié)合UCSC Genome Browser的refGene注釋信息,對SNV進(jìn)行注釋。最后通過SIFT和polyphen對在exonic區(qū)域的SNV突變位點(diǎn)對蛋白翻譯的影響進(jìn)行注釋,從而找出...
【文章來源】:河北醫(yī)科大學(xué)河北省
【文章頁數(shù)】:45 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
英文摘要
英文縮寫
前言
材料與方法
1 臨床資料
2 樣本采集
3 提取DNA
4 建庫及測序流程
5 生物信息學(xué)分析
結(jié)果
1 患者的臨床信息
2 DNA 提取結(jié)果
3 基因分析結(jié)果
4 MEN1 功能突變
附圖
附表
討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述 胰島素細(xì)胞瘤相關(guān)性基因研究進(jìn)展
參考文獻(xiàn)
致謝
個人簡歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]YY1在胰島素瘤中的表達(dá)及意義[J]. 李雯霞,黃業(yè)恩,石曉欣,林佩欣,鄒振寧,張耀忠,申洪. 南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(03)
[2]多內(nèi)分泌腺瘤病研究進(jìn)展[J]. 李小英. 上海交通大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2006(01)
[3]胰島素瘤頻發(fā)MEN-1抑癌基因及22q的雜合缺失及其意義[J]. 蔣衛(wèi)君,劉彤華,陳杰,高潔,武莎斐,陳原稼. 中華醫(yī)學(xué)雜志. 2004(20)
本文編號:3639993
【文章來源】:河北醫(yī)科大學(xué)河北省
【文章頁數(shù)】:45 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
英文摘要
英文縮寫
前言
材料與方法
1 臨床資料
2 樣本采集
3 提取DNA
4 建庫及測序流程
5 生物信息學(xué)分析
結(jié)果
1 患者的臨床信息
2 DNA 提取結(jié)果
3 基因分析結(jié)果
4 MEN1 功能突變
附圖
附表
討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述 胰島素細(xì)胞瘤相關(guān)性基因研究進(jìn)展
參考文獻(xiàn)
致謝
個人簡歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]YY1在胰島素瘤中的表達(dá)及意義[J]. 李雯霞,黃業(yè)恩,石曉欣,林佩欣,鄒振寧,張耀忠,申洪. 南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(03)
[2]多內(nèi)分泌腺瘤病研究進(jìn)展[J]. 李小英. 上海交通大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2006(01)
[3]胰島素瘤頻發(fā)MEN-1抑癌基因及22q的雜合缺失及其意義[J]. 蔣衛(wèi)君,劉彤華,陳杰,高潔,武莎斐,陳原稼. 中華醫(yī)學(xué)雜志. 2004(20)
本文編號:3639993
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