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基于多元關(guān)聯(lián)分析識(shí)別與多種精神疾病相關(guān)的基因研究

發(fā)布時(shí)間:2022-02-11 21:46
  《精神疾病診斷與統(tǒng)計(jì)手冊(cè)》(DSM)和《國(guó)際疾病分類》(ICD)中的精神疾病分類的修訂,再次引發(fā)了關(guān)于診斷界限有效性的爭(zhēng)論。隨著全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)研究的深入,多元關(guān)聯(lián)分析可以為在分子水平上研究多個(gè)精神類疾病的公共致病基因提供新思路。目前尚未有精神類疾病的基于基因的公共致病因子的研究。將多元關(guān)聯(lián)分析檢測(cè)結(jié)果與單疾病GWAS研究報(bào)告對(duì)比,可以為確定精神類疾病診斷界限提供重要證據(jù)。多元關(guān)聯(lián)分析中疾病間遺傳相關(guān)性的選擇是一大難點(diǎn)。本文基于躁郁癥、重度抑郁癥、精神分裂癥的3種疾病GWAS數(shù)據(jù),將多元關(guān)聯(lián)分析模型MGAS分別應(yīng)用于混合線性模型和LD hub模型提供的遺傳相關(guān)性數(shù)據(jù),檢測(cè)得到兩組與3種疾病相關(guān)的基因。結(jié)果顯示,對(duì)于混合線性模型和LD hub模型提供的遺傳相關(guān)性數(shù)據(jù),兩者的多元關(guān)聯(lián)分析結(jié)果有較強(qiáng)的一致性。因此作為一種替代策略,在由原始數(shù)據(jù)計(jì)算表型相關(guān)性困難的情況下,LD hub模型得到的遺傳相關(guān)性可以應(yīng)用于更多類的疾病的多元關(guān)聯(lián)分析。此外,本文提出一種新的多元關(guān)聯(lián)分析的數(shù)據(jù)處理方法,以填充位點(diǎn)統(tǒng)計(jì)關(guān)聯(lián)測(cè)試P值的方式增加輸入位點(diǎn)數(shù),并以此方法對(duì)躁郁癥、重度抑郁癥、精神分裂癥、注... 

【文章來(lái)源】:浙江理工大學(xué)浙江省

【文章頁(yè)數(shù)】:57 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

基于多元關(guān)聯(lián)分析識(shí)別與多種精神疾病相關(guān)的基因研究


圖3.1聯(lián)合數(shù)據(jù)I疾病與位點(diǎn)統(tǒng)計(jì)關(guān)聯(lián)測(cè)試P值Q-Q圖??圖中橫軸表示位點(diǎn)與疾病的P值負(fù)對(duì)數(shù)的期望值,縱軸表示該位點(diǎn)與疾病??的P值負(fù)對(duì)數(shù)的觀測(cè)值,直觀來(lái)聯(lián)合數(shù)據(jù)I中看5種疾病的位點(diǎn)P值數(shù)據(jù)都近似??

位點(diǎn),疾病,曼哈頓,數(shù)據(jù)


浙江理工大學(xué)碩士學(xué)位論文?基于多元關(guān)聯(lián)分析識(shí)別與多種精神疾病相關(guān)的基因研究??11*96??10.77??9.57??8.37??7.1B?????'??1,5.98??4.79?:??lii?iiliiii?ii?lii?i|??f?1?2?1?3?^?g?1?9?P?10?1? ̄ii ̄ ̄1? ̄12 ̄ ̄16?17?18?19?20?^1^2??Chromosomes??圖3.2聯(lián)合數(shù)據(jù)I位點(diǎn)P值曼哈頓圖??圖中橫坐標(biāo)表示22個(gè)染色體,縱坐標(biāo)表示位點(diǎn)P值的負(fù)對(duì)數(shù),位置越高的??點(diǎn)P值越小,位點(diǎn)與疾病的關(guān)聯(lián)性越強(qiáng)。??至少與兩種疾病存在關(guān)聯(lián)性P值的多疾病聯(lián)合數(shù)據(jù)II中,位點(diǎn)有4,624,263??個(gè),有效位點(diǎn)4,623,563個(gè),其中有2,564,642個(gè)(52.57%)位于18,524個(gè)基因??內(nèi)。疾病與位點(diǎn)關(guān)聯(lián)性P值Q-Q圖如圖3.3。??12.19r?—。。。。"。?°??10-97-?ADHD?□?jr^?n??廣,。!??9.75-?/?wf?。。??5:?MDD?□??窆?8.53-?SCZ?口??I,,,?/J?J?/??1:??I?I?t?1?1?I?I?I?I??0.67?1.34?2.01?2.68?3.34?4.01?4.68?5.35?6.02?6.69??Expected?[-log10(P)]??圖3.3聯(lián)合數(shù)據(jù)II疾病與位點(diǎn)統(tǒng)計(jì)關(guān)聯(lián)測(cè)試P值Q-Q圖??聯(lián)合數(shù)據(jù)II中5種疾病的位點(diǎn)P值數(shù)據(jù)也都近似地在一條直線附近,即聯(lián)??合數(shù)據(jù)II中的位點(diǎn)P值數(shù)據(jù)也均服從正態(tài)分布。位點(diǎn)與單疾病的統(tǒng)計(jì)關(guān)聯(lián)測(cè)試??P值數(shù)據(jù)經(jīng)FDR修正

位點(diǎn),疾病,數(shù)據(jù),合數(shù)


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本文編號(hào):3620996

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