雙胞胎兒童牙菌斑微生態(tài)的組成分析及齲壞牙牙菌斑的耐酸基因功能篩選研究
發(fā)布時間:2022-02-04 16:16
齲病是人類口腔的常見病、多發(fā)病,其中低齡兒童齲對兒童的口腔健康甚至全身健康都帶來了嚴重的危害,因此齲病的預防和治療一直是口腔醫(yī)生研究的重點。而齲機制的探索能明顯促進相關(guān)方面的研究,基于廣為接受的齲機制理論——四聯(lián)因素論,我們知道宿主、飲食、微生物可通過相互作用,隨著時間的推移誘導齲病的發(fā)生。微生物在這一過程中發(fā)揮著直接且重要的作用,但與宿主、飲食相關(guān)的遺傳和環(huán)境因素對微生物的影響具體有哪些,我們卻知之甚少。此外,基于目前被廣泛認可的微生物致齲機制——生態(tài)菌斑假說,我們知道齲病的發(fā)生通常是由多個菌株相互調(diào)節(jié)完成的,這些微生物均具備一定的特性,如產(chǎn)酸性、耐酸性、代謝糖等,其中耐酸性是幫助微生物在齲環(huán)境中生存并發(fā)揮作用的重要特性。然而,由于培養(yǎng)方法的局限性,目前已知的耐酸基因僅從以變異鏈球菌為主的可培養(yǎng)微生物中獲得,而其他同樣值得被探索研究的、不可培養(yǎng)的齲相關(guān)微生物的耐酸基因卻鮮有研究。因此本研究將以齲病的菌斑微生物為中心,向上探索遺傳和環(huán)境因素對菌斑微生物的影響(第一部分),向下探索菌斑微生物的耐酸基因(第二部分),從而進一步增進對齲機制的認識,并為齲病的預防和治療提供新的研究思路。第一部...
【文章來源】:武漢大學湖北省211工程院校985工程院校教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:150 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1.1?PCR產(chǎn)物純化操作步驟??
(見表1.1)??2)?OTU?Venn圖分析:在0.97的相似度下,得到每個樣本的OTU個數(shù),然后??用Venn圖展示三組樣本共有和各自特有的OUT數(shù)目。圖1.2顯示三組共有??的OTU數(shù)有169個,齲壞組(Chc2,?OTU=881)的OTU數(shù)多于健康組(Hhcl??和Hhc2,?OTU=820和804),但統(tǒng)計分析發(fā)現(xiàn)無明顯差異(P>0.05)。??臀??圖1.2?OTU?Venn圖分析。不同顏色圖形代表不同的組別,其交疊部分數(shù)字為兩組別之間??共有的OTU個數(shù)。同理,多個顏色圖形間的交疊部分數(shù)字為多個組別間共有的OTU個數(shù)。??3)?OTU?PCA分析:可根據(jù)樣本聚集和分散的程度判斷樣本間組成是否具有相??似性。圖1.3基于OTU豐度的PCA分析發(fā)現(xiàn)同一組別的樣本并沒有很好的??聚集在一起,初步反映了三組間的樣本組成并無明顯差異。????Chc2????Hhcl?.????Hhc2?_?#?.??2??、?.??I。???????s?..??Q-????-2????■??-4??-2?6?2?4?6??PC1(22.73%)??圖1.3基于OTU豐度的PCA分析。橫坐標表示第一主成分,括號中的百分比則表示第一主??成分對樣品差異的貢獻值;縱坐標表示第二主成分,括號中的百分比表示第二主成分對樣品??差異的貢獻值。圖中點分別表示各個樣品
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【參考文獻】:
期刊論文
[1]Saliva in the diagnosis of diseases[J]. Chen-Zi Zhang,Xing-Qun Cheng,Ji-Yao Li,Ping Zhang,Ping Yi,Xin Xu,Xue-Dong Zhou. International Journal of Oral Science. 2016(03)
[2]微生物蘋果酸脫氫酶的功能、動力學特征、晶體結(jié)構(gòu)以及調(diào)控(英文)[J]. Tóshiko TAKAHASHI-í?IGUEZ,Nelly ABURTO-RODRíGUEZ,Ana Laura VILCHIS-GONZáLEZ,María Elena FLORES. Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2016(04)
[3]牙菌斑形成早期微生物定植規(guī)律的定量PCR研究[J]. 劉紅春,歐陽勇,涂家珍. 中國微生態(tài)學雜志. 2014(09)
[4]唾液和唾液組學與疾病早期診斷[J]. 程興群,鄧盟,徐欣,周學東. 國際口腔醫(yī)學雜志. 2014(02)
[5]酸性固體培養(yǎng)基中瓊脂凝固性影響因素的初探[J]. 王泉,孫珮石,王樹坤,王海玉. 環(huán)?萍. 2008(02)
[6]牙菌斑生物膜的研究進展[J]. 凌均棨. 中華口腔醫(yī)學研究雜志(電子版). 2008(02)
[7]一種DNA側(cè)翼序列分離技術(shù)——TAIL-PCR[J]. 羅麗娟,施季森. 南京林業(yè)大學學報(自然科學版). 2003(04)
本文編號:3613529
【文章來源】:武漢大學湖北省211工程院校985工程院校教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:150 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1.1?PCR產(chǎn)物純化操作步驟??
(見表1.1)??2)?OTU?Venn圖分析:在0.97的相似度下,得到每個樣本的OTU個數(shù),然后??用Venn圖展示三組樣本共有和各自特有的OUT數(shù)目。圖1.2顯示三組共有??的OTU數(shù)有169個,齲壞組(Chc2,?OTU=881)的OTU數(shù)多于健康組(Hhcl??和Hhc2,?OTU=820和804),但統(tǒng)計分析發(fā)現(xiàn)無明顯差異(P>0.05)。??臀??圖1.2?OTU?Venn圖分析。不同顏色圖形代表不同的組別,其交疊部分數(shù)字為兩組別之間??共有的OTU個數(shù)。同理,多個顏色圖形間的交疊部分數(shù)字為多個組別間共有的OTU個數(shù)。??3)?OTU?PCA分析:可根據(jù)樣本聚集和分散的程度判斷樣本間組成是否具有相??似性。圖1.3基于OTU豐度的PCA分析發(fā)現(xiàn)同一組別的樣本并沒有很好的??聚集在一起,初步反映了三組間的樣本組成并無明顯差異。????Chc2????Hhcl?.????Hhc2?_?#?.??2??、?.??I。???????s?..??Q-????-2????■??-4??-2?6?2?4?6??PC1(22.73%)??圖1.3基于OTU豐度的PCA分析。橫坐標表示第一主成分,括號中的百分比則表示第一主??成分對樣品差異的貢獻值;縱坐標表示第二主成分,括號中的百分比表示第二主成分對樣品??差異的貢獻值。圖中點分別表示各個樣品
(見表1.1)??2)?OTU?Venn圖分析:在0.97的相似度下,得到每個樣本的OTU個數(shù),然后??用Venn圖展示三組樣本共有和各自特有的OUT數(shù)目。圖1.2顯示三組共有??的OTU數(shù)有169個,齲壞組(Chc2,?OTU=881)的OTU數(shù)多于健康組(Hhcl??和Hhc2,?OTU=820和804),但統(tǒng)計分析發(fā)現(xiàn)無明顯差異(P>0.05)。??臀??圖1.2?OTU?Venn圖分析。不同顏色圖形代表不同的組別,其交疊部分數(shù)字為兩組別之間??共有的OTU個數(shù)。同理,多個顏色圖形間的交疊部分數(shù)字為多個組別間共有的OTU個數(shù)。??3)?OTU?PCA分析:可根據(jù)樣本聚集和分散的程度判斷樣本間組成是否具有相??似性。圖1.3基于OTU豐度的PCA分析發(fā)現(xiàn)同一組別的樣本并沒有很好的??聚集在一起,初步反映了三組間的樣本組成并無明顯差異。????Chc2????Hhcl?.????Hhc2?_?#?.??2??、?.??I。???????s?..??Q-????-2????■??-4??-2?6?2?4?6??PC1(22.73%)??圖1.3基于OTU豐度的PCA分析。橫坐標表示第一主成分,括號中的百分比則表示第一主??成分對樣品差異的貢獻值;縱坐標表示第二主成分,括號中的百分比表示第二主成分對樣品??差異的貢獻值。圖中點分別表示各個樣品
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Saliva in the diagnosis of diseases[J]. Chen-Zi Zhang,Xing-Qun Cheng,Ji-Yao Li,Ping Zhang,Ping Yi,Xin Xu,Xue-Dong Zhou. International Journal of Oral Science. 2016(03)
[2]微生物蘋果酸脫氫酶的功能、動力學特征、晶體結(jié)構(gòu)以及調(diào)控(英文)[J]. Tóshiko TAKAHASHI-í?IGUEZ,Nelly ABURTO-RODRíGUEZ,Ana Laura VILCHIS-GONZáLEZ,María Elena FLORES. Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2016(04)
[3]牙菌斑形成早期微生物定植規(guī)律的定量PCR研究[J]. 劉紅春,歐陽勇,涂家珍. 中國微生態(tài)學雜志. 2014(09)
[4]唾液和唾液組學與疾病早期診斷[J]. 程興群,鄧盟,徐欣,周學東. 國際口腔醫(yī)學雜志. 2014(02)
[5]酸性固體培養(yǎng)基中瓊脂凝固性影響因素的初探[J]. 王泉,孫珮石,王樹坤,王海玉. 環(huán)?萍. 2008(02)
[6]牙菌斑生物膜的研究進展[J]. 凌均棨. 中華口腔醫(yī)學研究雜志(電子版). 2008(02)
[7]一種DNA側(cè)翼序列分離技術(shù)——TAIL-PCR[J]. 羅麗娟,施季森. 南京林業(yè)大學學報(自然科學版). 2003(04)
本文編號:3613529
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