目的研究頭頸部鱗癌（HNSCC）的自噬基因調(diào)控及生物標(biāo)志物FK506結(jié)合蛋白1A（FKBP1A）在HNSCC中的表達(dá)及影響。方法利用腫瘤基因組圖譜（TCGA）分析HNSCC組織與正常黏膜組織的基因表達(dá)差異;利用DAVID生物信息學(xué)資源庫進(jìn)行HNSCC中差異明顯的自噬相關(guān)基因功能注釋與富集的研究,利用單因素與多因素COX回歸分析尋找對(duì)于TCGA中HNSCC患者預(yù)后有意義的基因;利用基因表達(dá)綜合數(shù)據(jù)庫（GEO）驗(yàn)證目的基因與HNSCC患者的預(yù)后,利用Kaplan-Meier Plotter分析自噬相關(guān)基因與HNSCC患者預(yù)后相關(guān)性;利用免疫組化實(shí)驗(yàn)及實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測對(duì)比臨床HNSCC組織樣本與癌旁樣本中FKBP1A的表達(dá)量。結(jié)果相比于正常組織,HNSCC組織共有38個(gè)自噬相關(guān)基因（其中28個(gè)上調(diào),10個(gè)下調(diào)）發(fā)生顯著的變化。這些差異基因主要參與人體中生物過程（BP）,細(xì)胞成分（CC）和分子功能（MF）部分中的自噬相關(guān)通路。單因素與多因素Cox回歸分析發(fā)現(xiàn)有18個(gè)自噬相關(guān)基因在TCGA數(shù)據(jù)庫中與HNSCC患者的預(yù)后相關(guān)。將其中的高風(fēng)險(xiǎn)基因在GEO數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)FKBP1A與HN... 

【文章來源】：中國醫(yī)師雜志. 2020,22(08)

【文章頁數(shù)】：6 頁


本文編號(hào)：3608041