目的:通過數(shù)據(jù)庫分析LUM基因在胃癌中的表達(dá)情況及意義。方法:通過Oncomine數(shù)據(jù)庫分析LUM基因在胃癌中的差異性表達(dá),基于GEPIA網(wǎng)站分析LUM基因表達(dá)與胃癌患者生存周期的關(guān)系;同時利用MethHC數(shù)據(jù)庫分析LUM基因甲基化水平,使用基于TCGA數(shù)據(jù)集的UALCAN在線數(shù)據(jù)庫對LUM在胃癌患者中的表達(dá)及預(yù)后進(jìn)行驗證;并通過String數(shù)據(jù)庫分析LUM基因的蛋白相互作用及上下游調(diào)控關(guān)系。結(jié)果:胃癌組織中LUM的mRNA表達(dá)較正常對照組明顯增高;Meta分析進(jìn)一步證實LUM基因的表達(dá)在胃癌組織中明顯增高。GEPIA分析發(fā)現(xiàn)高表達(dá)組患者生存周期明顯短于低表達(dá)組（P<0.05）。與此同時,甲基化分析中得出LUM基因甲基化水平腫瘤組明顯高于正常組;TCGA數(shù)據(jù)集驗證顯示LUM在胃癌組織中的表達(dá)量與預(yù)后有關(guān);蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)分析得出,LUM可能與OGN、CHST1、CHST5、CHST6、DCN、COL1A1、COL1A2、COL3A1、COL4A2、ACAN等蛋白相互作用。結(jié)論:基于多個數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)挖掘發(fā)現(xiàn),LUM基因在胃癌組織中呈現(xiàn)高表達(dá),且其表達(dá)水平與胃癌患者總體生存相關(guān);LUM是與... 

【文章來源】：腫瘤預(yù)防與治療. 2020,33(07)

【文章頁數(shù)】：6 頁

【部分圖文】：

Oncomine數(shù)據(jù)庫中在胃癌中的基因差異性表達(dá)

Oncomine數(shù)據(jù)庫中LUM在不同胃癌組織芯片中的表達(dá)結(jié)果顯示,共有5項符合條件的研究并且每項研究中胃癌組織中LUM基因表達(dá)均高于正常對照組織(圖3)。進(jìn)一步對這5項研究進(jìn)行薈萃分析發(fā)現(xiàn),在胃癌組織中LUM表達(dá)明顯高于正常對照組織(P<0.001)(圖4)。圖3 Oncomine數(shù)據(jù)庫中LUM在不同胃癌中的表達(dá)

Oncomine數(shù)據(jù)庫中LUM在不同胃癌中的表達(dá)

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基于Oncomine數(shù)據(jù)庫薈萃分析COL1A2在胃癌患者中的表達(dá)及其臨床意義[J]. 肖毓,張洪攀,譚榜憲.  腫瘤預(yù)防與治療. 2019(06)
[2]上消化道惡性腫瘤流行病學(xué)趨勢[J]. 李道娟,梁迪,靳晶,師金,瞿峰,賀宇彤.  腫瘤預(yù)防與治療. 2018(01)
[3]Gastric cancer:Prevention,screening and early diagnosis[J]. Victor Pasechnikov,Sergej Chukov,Evgeny Fedorov,Ilze Kikuste,Marcis Leja.  World Journal of Gastroenterology. 2014(38)



本文編號：3608291