擴增子測序技術(shù)檢測石蠟包埋組織標本耐藥結(jié)核基因的研究
發(fā)布時間:2022-01-24 22:47
目的 用基于多重PCR(multiplex PCR,mPCR)擴增子的二代測序(next-generation sequencing,NGS)技術(shù)(mPCR-NGS)檢測MTB的耐藥基因突變,并評估其檢測石蠟包埋組織標本診斷耐藥結(jié)核病的臨床應用價值。方法 選取北京市昌平區(qū)結(jié)核病防治所2013年4月至2015年10月常規(guī)進行了利福平、異煙肼、乙胺丁醇、鏈霉素、卷曲霉素、卡那霉素、阿米卡星和氧氟沙星比例法檢測且具有藥敏試驗結(jié)果的50株MTB臨床分離株,包括42株耐藥MTB和8株敏感MTB菌株。參考耐藥基因數(shù)據(jù)庫及相關(guān)文獻,針對以上8種抗結(jié)核藥物主要耐藥基因及常見位點設計耐藥基因組合,建立有效的檢測方案。收集首都醫(yī)科大學附屬北京胸科醫(yī)院病理科2017年11月至2018年9月耐藥結(jié)核病患者55例的石蠟包埋組織標本,探針熔解曲線法檢測結(jié)果為利福平、異煙肼、乙胺丁醇和氟喹諾酮類至少存在一種耐藥相關(guān)基因突變。首先對已知表型藥敏試驗結(jié)果的MTB臨床分離株進行mPCR-NGS檢測,驗證該方法檢測純菌樣本的有效性,再進一步檢測結(jié)核病患者石蠟包埋組織標本進行臨床驗證。主要評價指標為敏感度和特異度以及一致性。...
【文章來源】:中華結(jié)核和呼吸雜志. 2020,43(03)
【文章頁數(shù)】: 頁
【參考文獻】:
期刊論文
[1]熒光PCR探針熔解曲線法檢測結(jié)核分枝桿菌復合群對利福平和異煙肼耐藥性的價值[J]. 吳慧娜,孫付勝,劉清文,戎中錄,張紀東,高陽,李永福,常斐. 中國防癆雜志. 2019 (01)
[2]Comparison of Histological, Microbiological, and Molecular Methods in Diagnosis of Patients with TBLN Having Different Anti-TB Treatment Background[J]. CHE Nan Ying,HUANG Shao Jun,MA Yan,HAN Yi,LIU Zi Chen,ZHANG Chen,MU Jing,ZHAO Dan,QU Yang,ZHANG Hai Qing,LIU Zhi Dong,XU Shao Fa. Biomedical and Environmental Sciences. 2017(06)
[3]中國結(jié)核病病理學診斷專家共識[J]. 中華結(jié)核和呼吸雜志. 2017 (06)
[4]二代測序技術(shù)在結(jié)核分枝桿菌研究中的應用進展[J]. 徐鵬,甘明宇,高謙. 微生物與感染. 2015(01)
[5]比例法測試結(jié)核分支桿菌藥物敏感性的探討[J]. 劉宇紅,王甦民,那希寬. 中華結(jié)核和呼吸雜志. 2000(02)
本文編號:3607435
【文章來源】:中華結(jié)核和呼吸雜志. 2020,43(03)
【文章頁數(shù)】: 頁
【參考文獻】:
期刊論文
[1]熒光PCR探針熔解曲線法檢測結(jié)核分枝桿菌復合群對利福平和異煙肼耐藥性的價值[J]. 吳慧娜,孫付勝,劉清文,戎中錄,張紀東,高陽,李永福,常斐. 中國防癆雜志. 2019 (01)
[2]Comparison of Histological, Microbiological, and Molecular Methods in Diagnosis of Patients with TBLN Having Different Anti-TB Treatment Background[J]. CHE Nan Ying,HUANG Shao Jun,MA Yan,HAN Yi,LIU Zi Chen,ZHANG Chen,MU Jing,ZHAO Dan,QU Yang,ZHANG Hai Qing,LIU Zhi Dong,XU Shao Fa. Biomedical and Environmental Sciences. 2017(06)
[3]中國結(jié)核病病理學診斷專家共識[J]. 中華結(jié)核和呼吸雜志. 2017 (06)
[4]二代測序技術(shù)在結(jié)核分枝桿菌研究中的應用進展[J]. 徐鵬,甘明宇,高謙. 微生物與感染. 2015(01)
[5]比例法測試結(jié)核分支桿菌藥物敏感性的探討[J]. 劉宇紅,王甦民,那希寬. 中華結(jié)核和呼吸雜志. 2000(02)
本文編號:3607435
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