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擴(kuò)增子測(cè)序技術(shù)檢測(cè)石蠟包埋組織標(biāo)本耐藥結(jié)核基因的研究

發(fā)布時(shí)間:2022-01-24 22:47
  目的 用基于多重PCR(multiplex PCR,mPCR)擴(kuò)增子的二代測(cè)序(next-generation sequencing,NGS)技術(shù)(mPCR-NGS)檢測(cè)MTB的耐藥基因突變,并評(píng)估其檢測(cè)石蠟包埋組織標(biāo)本診斷耐藥結(jié)核病的臨床應(yīng)用價(jià)值。方法 選取北京市昌平區(qū)結(jié)核病防治所2013年4月至2015年10月常規(guī)進(jìn)行了利福平、異煙肼、乙胺丁醇、鏈霉素、卷曲霉素、卡那霉素、阿米卡星和氧氟沙星比例法檢測(cè)且具有藥敏試驗(yàn)結(jié)果的50株MTB臨床分離株,包括42株耐藥MTB和8株敏感MTB菌株。參考耐藥基因數(shù)據(jù)庫(kù)及相關(guān)文獻(xiàn),針對(duì)以上8種抗結(jié)核藥物主要耐藥基因及常見(jiàn)位點(diǎn)設(shè)計(jì)耐藥基因組合,建立有效的檢測(cè)方案。收集首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京胸科醫(yī)院病理科2017年11月至2018年9月耐藥結(jié)核病患者55例的石蠟包埋組織標(biāo)本,探針熔解曲線法檢測(cè)結(jié)果為利福平、異煙肼、乙胺丁醇和氟喹諾酮類至少存在一種耐藥相關(guān)基因突變。首先對(duì)已知表型藥敏試驗(yàn)結(jié)果的MTB臨床分離株進(jìn)行mPCR-NGS檢測(cè),驗(yàn)證該方法檢測(cè)純菌樣本的有效性,再進(jìn)一步檢測(cè)結(jié)核病患者石蠟包埋組織標(biāo)本進(jìn)行臨床驗(yàn)證。主要評(píng)價(jià)指標(biāo)為敏感度和特異度以及一致性。... 

【文章來(lái)源】:中華結(jié)核和呼吸雜志. 2020,43(03)

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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]熒光PCR探針熔解曲線法檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群對(duì)利福平和異煙肼耐藥性的價(jià)值[J]. 吳慧娜,孫付勝,劉清文,戎中錄,張紀(jì)東,高陽(yáng),李永福,常斐.  中國(guó)防癆雜志. 2019 (01)
[2]Comparison of Histological, Microbiological, and Molecular Methods in Diagnosis of Patients with TBLN Having Different Anti-TB Treatment Background[J]. CHE Nan Ying,HUANG Shao Jun,MA Yan,HAN Yi,LIU Zi Chen,ZHANG Chen,MU Jing,ZHAO Dan,QU Yang,ZHANG Hai Qing,LIU Zhi Dong,XU Shao Fa.  Biomedical and Environmental Sciences. 2017(06)
[3]中國(guó)結(jié)核病病理學(xué)診斷專家共識(shí)[J].   中華結(jié)核和呼吸雜志. 2017 (06)
[4]二代測(cè)序技術(shù)在結(jié)核分枝桿菌研究中的應(yīng)用進(jìn)展[J]. 徐鵬,甘明宇,高謙.  微生物與感染. 2015(01)
[5]比例法測(cè)試結(jié)核分支桿菌藥物敏感性的探討[J]. 劉宇紅,王甦民,那希寬.  中華結(jié)核和呼吸雜志. 2000(02)



本文編號(hào):3607435

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