玉米抗南方銹病基因挖掘和精細定位
發(fā)布時間:2022-01-22 01:23
玉米(Zea mays L.)是我國重要的糧飼作物,玉米的安全生產(chǎn)關乎我國糧食生產(chǎn)的安全。玉米南方銹病是由多堆柄銹菌(Puccinia polysora Underw.)引起的氣傳性病害,隨著全球氣候變化和感病品種的推廣,現(xiàn)在我國熱帶、亞熱帶和黃淮海玉米產(chǎn)區(qū)均有廣泛的分布,嚴重影響玉米的產(chǎn)量和品質(zhì)。利用抗病品種是控制玉米南方銹病最為經(jīng)濟有效的方法,篩選抗南方銹病的玉米種質(zhì)、發(fā)掘和鑒定南方銹病抗病基因和抗性QTL是進行抗病品種培育的基礎。本研究對玉米種質(zhì)資源進行了抗南方銹病鑒定與評價。以抗南方銹病自交系齊319和感病自交系掖478衍生的重組自交系和染色體片段置換系為材料,構(gòu)建高密度遺傳圖譜,進行QTL定位和精細定位。研究主要結(jié)果如下:1、玉米種質(zhì)資源抗南方銹病鑒定與評價:對337份國外引進玉米種質(zhì)資源進行了田間人工接種和抗性鑒定,從中篩選出對南方銹病表現(xiàn)抗。≧)、中抗(MR)、感。⊿)和高感(HS)的材料各57、105、95和77份,表明上述引進種質(zhì)中含有較為豐富的抗性資源,為玉米抗南方銹病育種提供基礎材料。2、重組自交家系結(jié)合高密度連鎖圖譜進行抗南方銹病QTL定位:對以自交系掖47...
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學院北京市
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
齊319和掖478表型Fig.2-1PhenotypesofQi319andYe478在鑒定的份材料中無高抗()種質(zhì),抗。ǎ┓,占總數(shù)的;中抗()
中國農(nóng)業(yè)科學院碩士學位論文第三章利用玉米重組自交家系進行抗南方銹病QTL定位16QTL定位要求和規(guī)律。RIL群體在兩環(huán)境下的表型數(shù)據(jù)均值分別為5.40和5.52,最大值均為7.0,最小值均為3.0,均值和中位數(shù)相差不大說明表型數(shù)據(jù)集中性好。偏度和峰度分別為-0.545和-1.556,結(jié)合RIL群體的正態(tài)分布曲線,表明抗南方銹病病級分布為偏正態(tài)分布(圖3-1),說明該性狀可作為數(shù)量性狀進行QTL定位。RIL群體和親本在兩環(huán)境下的表型數(shù)據(jù)詳見表3-1。表3-1親本和重組自交家系在兩環(huán)境下的表型數(shù)據(jù)Table3-1Phenotypesofparentsandarecombinantinbredlines(RIL)populationbasedontwoenvironments環(huán)境齊319掖478RIL群體平均值平均值平均值±標準差極差偏度峰度變異系數(shù)(%)廣義遺傳力(%)環(huán)境1(E1)3.67.05.40±2.003.0-7.0-0.538-1.4494.013環(huán)境2(E2)3.39.05.52±1.933.0-7.0-0.549-1.7063.72091.98平均3.48.05.46±1.973.0-7.0-0.545-1.5563.865對RIL群體表型數(shù)據(jù)進行方差分析(表3-2),從抗南方銹病這一性狀各指標的變異大小看,基因型P值小于環(huán)境P值,且基因型P=1.36×10-8,達1%極顯著水平,環(huán)境P=0.98,說明基因型引起群體中南方銹病抗性的變異大于環(huán)境的影響,環(huán)境引起的表型變異很小,可以對抗病QTL進行遺傳分析。廣義遺傳力為91.98%,說明在RIL群體中抗南方銹病表型差異主要是由遺傳因素控制的。圖3-1親本抗南方銹病表型Fig.3-1TheresultofPhenotypicinSCRresistancebetweentheparentallines.
)縮寫,數(shù)字表示QTL在染色體上的位置。qSCR5.07和qSCR9.03加性效應為負,對抗南方銹病起增效作用的等位基因來自于感性親本掖478,qSCR3.04、qSCR6.01、qSCR10.01加性效應為負,抗病基因來自于抗性親本。其中qSCR6.01、qSCR10.01的LOD值分別為27.93和26.42,表型貢獻率分別為24.15%和22.98%,加性效應分別為-2.36和-2.32。前人研究中抗南方銹病基因和QTL多定位在10號染色體上,因此本實驗將具有最大表型貢獻率的qSCR6.01作為本實驗研究的重點。將qSCR6.01初步定位在mk2838和mk2843之間,物理距離為75.30~78.25Mb(表3-3)。圖3-2兩環(huán)境下抗南方銹病QTL的檢測Fig.3-2DetectionofSCR-resistanceQTLsintwoenvironments3.3結(jié)論與討論QTL定位是一種高效的定量性狀定位方法,極大地提高了玉米的育種效率(CHENetal.,2014)。在目前的研究中,低密度的遺傳圖譜不足以進行精確的QTL定位,可能會丟失部分染色體上的重要的抗病QTL,例如,在陳翠霞的研究中,齊319的3、5、6、9號染色體上與抗南方銹病相關的QTL未被檢測到(CHENetal.,2004)。QTL定位的準確性受遺傳圖譜質(zhì)量的影響。本研究中的高密度遺傳圖譜可以提高重組斷點的識別,從而提高QTL定位的準確性(VARSHNEYetal.,2009;SCHNABLEetal.,2009)。在鑒定重組自交家系時,利用了高通量測序的方法。高效、省力,且能夠獲得高密度的遺傳圖譜(WANGetal.,2018;LUetal.,2020)。從RIL群體定位結(jié)果來看,結(jié)合SNP標記共定位到5個QTL(圖3-2)。對比高密度和低密度遺傳圖譜定位結(jié)果可見,高密度SNP標記所定位的QTL范圍小,定位準確性高。重組自交家系作為QTL的理想材料,與重測序技術相結(jié)合,大大提高了QTL定位的效率與準確性。在目前的研究中,我們檢測了5個與玉米南方銹病抗性相關的QTL。兩個主效抗病QTLqSC
【參考文獻】:
期刊論文
[1]山東省玉米主導品種抗南方銹病鑒定及對災情的影響[J]. 鄢洪海,王琰,張茹琴,宋希云,王志奎,夏淑春. 玉米科學. 2019(06)
[2]一個高抗玉米南方銹病基因的QTL定位及遺傳分析[J]. 王兵偉,覃嘉明,時成俏,鄭加興,覃永嬡,黃安霞. 中國農(nóng)業(yè)科學. 2019(12)
[3]河北省12個小麥主栽品種(系)抗葉銹性鑒定及基因分析[J]. 張曉玲,張換換,徐新玉,楊華麗,段振盈,姚占軍. 植物遺傳資源學報. 2019(04)
[4]玉米抗南方銹病基因的QTL定位[J]. 陳文娟,路璐,李萬昌,張小杰,孫素麗,朱振東,王曉鳴,段燦星. 植物遺傳資源學報. 2019(03)
[5]玉米抗南方銹病種質(zhì)資源初步鑒定及遺傳多樣性分析[J]. 陳文娟,李萬昌,楊知還,孫素麗,王曉鳴,朱振東,段燦星. 植物遺傳資源學報. 2018(02)
[6]南繁區(qū)玉米銹病種類鑒定及病原生物學特性[J]. 趙志祥,肖敏,陳圓,嚴婉榮,肖彤斌. 分子植物育種. 2018(01)
[7]基于ISSR-PCR對山東玉米多堆柄銹菌遺傳多樣性的研究及其初侵染菌源的推測[J]. 鄢洪海,王琰,張茹琴,夏淑春,王志奎,宋希云. 菌物學報. 2018(02)
[8]生防菌R-4的鑒定及其對玉米南方銹病的防效[J]. 趙晨晨,焦鑄錦,龐發(fā)虎,王坦,王潞,李森,陶愛麗,黃思良. 玉米科學. 2017(02)
[9]皖北玉米南方銹病的發(fā)生及防治[J]. 謝守田. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2016(15)
[10]玉米南方銹病菌的超微結(jié)構(gòu)研究[J]. 邢國珍,李晶晶,肖繼斌,焦志鑫,劉娜,韓青梅,鄭文明. 中國農(nóng)學通報. 2016(18)
碩士論文
[1]中國玉米南方銹菌的分子遺傳多樣性和超微結(jié)構(gòu)研究[D]. 邢國珍.河南農(nóng)業(yè)大學 2011
本文編號:3601304
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學院北京市
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
齊319和掖478表型Fig.2-1PhenotypesofQi319andYe478在鑒定的份材料中無高抗()種質(zhì),抗。ǎ┓,占總數(shù)的;中抗()
中國農(nóng)業(yè)科學院碩士學位論文第三章利用玉米重組自交家系進行抗南方銹病QTL定位16QTL定位要求和規(guī)律。RIL群體在兩環(huán)境下的表型數(shù)據(jù)均值分別為5.40和5.52,最大值均為7.0,最小值均為3.0,均值和中位數(shù)相差不大說明表型數(shù)據(jù)集中性好。偏度和峰度分別為-0.545和-1.556,結(jié)合RIL群體的正態(tài)分布曲線,表明抗南方銹病病級分布為偏正態(tài)分布(圖3-1),說明該性狀可作為數(shù)量性狀進行QTL定位。RIL群體和親本在兩環(huán)境下的表型數(shù)據(jù)詳見表3-1。表3-1親本和重組自交家系在兩環(huán)境下的表型數(shù)據(jù)Table3-1Phenotypesofparentsandarecombinantinbredlines(RIL)populationbasedontwoenvironments環(huán)境齊319掖478RIL群體平均值平均值平均值±標準差極差偏度峰度變異系數(shù)(%)廣義遺傳力(%)環(huán)境1(E1)3.67.05.40±2.003.0-7.0-0.538-1.4494.013環(huán)境2(E2)3.39.05.52±1.933.0-7.0-0.549-1.7063.72091.98平均3.48.05.46±1.973.0-7.0-0.545-1.5563.865對RIL群體表型數(shù)據(jù)進行方差分析(表3-2),從抗南方銹病這一性狀各指標的變異大小看,基因型P值小于環(huán)境P值,且基因型P=1.36×10-8,達1%極顯著水平,環(huán)境P=0.98,說明基因型引起群體中南方銹病抗性的變異大于環(huán)境的影響,環(huán)境引起的表型變異很小,可以對抗病QTL進行遺傳分析。廣義遺傳力為91.98%,說明在RIL群體中抗南方銹病表型差異主要是由遺傳因素控制的。圖3-1親本抗南方銹病表型Fig.3-1TheresultofPhenotypicinSCRresistancebetweentheparentallines.
)縮寫,數(shù)字表示QTL在染色體上的位置。qSCR5.07和qSCR9.03加性效應為負,對抗南方銹病起增效作用的等位基因來自于感性親本掖478,qSCR3.04、qSCR6.01、qSCR10.01加性效應為負,抗病基因來自于抗性親本。其中qSCR6.01、qSCR10.01的LOD值分別為27.93和26.42,表型貢獻率分別為24.15%和22.98%,加性效應分別為-2.36和-2.32。前人研究中抗南方銹病基因和QTL多定位在10號染色體上,因此本實驗將具有最大表型貢獻率的qSCR6.01作為本實驗研究的重點。將qSCR6.01初步定位在mk2838和mk2843之間,物理距離為75.30~78.25Mb(表3-3)。圖3-2兩環(huán)境下抗南方銹病QTL的檢測Fig.3-2DetectionofSCR-resistanceQTLsintwoenvironments3.3結(jié)論與討論QTL定位是一種高效的定量性狀定位方法,極大地提高了玉米的育種效率(CHENetal.,2014)。在目前的研究中,低密度的遺傳圖譜不足以進行精確的QTL定位,可能會丟失部分染色體上的重要的抗病QTL,例如,在陳翠霞的研究中,齊319的3、5、6、9號染色體上與抗南方銹病相關的QTL未被檢測到(CHENetal.,2004)。QTL定位的準確性受遺傳圖譜質(zhì)量的影響。本研究中的高密度遺傳圖譜可以提高重組斷點的識別,從而提高QTL定位的準確性(VARSHNEYetal.,2009;SCHNABLEetal.,2009)。在鑒定重組自交家系時,利用了高通量測序的方法。高效、省力,且能夠獲得高密度的遺傳圖譜(WANGetal.,2018;LUetal.,2020)。從RIL群體定位結(jié)果來看,結(jié)合SNP標記共定位到5個QTL(圖3-2)。對比高密度和低密度遺傳圖譜定位結(jié)果可見,高密度SNP標記所定位的QTL范圍小,定位準確性高。重組自交家系作為QTL的理想材料,與重測序技術相結(jié)合,大大提高了QTL定位的效率與準確性。在目前的研究中,我們檢測了5個與玉米南方銹病抗性相關的QTL。兩個主效抗病QTLqSC
【參考文獻】:
期刊論文
[1]山東省玉米主導品種抗南方銹病鑒定及對災情的影響[J]. 鄢洪海,王琰,張茹琴,宋希云,王志奎,夏淑春. 玉米科學. 2019(06)
[2]一個高抗玉米南方銹病基因的QTL定位及遺傳分析[J]. 王兵偉,覃嘉明,時成俏,鄭加興,覃永嬡,黃安霞. 中國農(nóng)業(yè)科學. 2019(12)
[3]河北省12個小麥主栽品種(系)抗葉銹性鑒定及基因分析[J]. 張曉玲,張換換,徐新玉,楊華麗,段振盈,姚占軍. 植物遺傳資源學報. 2019(04)
[4]玉米抗南方銹病基因的QTL定位[J]. 陳文娟,路璐,李萬昌,張小杰,孫素麗,朱振東,王曉鳴,段燦星. 植物遺傳資源學報. 2019(03)
[5]玉米抗南方銹病種質(zhì)資源初步鑒定及遺傳多樣性分析[J]. 陳文娟,李萬昌,楊知還,孫素麗,王曉鳴,朱振東,段燦星. 植物遺傳資源學報. 2018(02)
[6]南繁區(qū)玉米銹病種類鑒定及病原生物學特性[J]. 趙志祥,肖敏,陳圓,嚴婉榮,肖彤斌. 分子植物育種. 2018(01)
[7]基于ISSR-PCR對山東玉米多堆柄銹菌遺傳多樣性的研究及其初侵染菌源的推測[J]. 鄢洪海,王琰,張茹琴,夏淑春,王志奎,宋希云. 菌物學報. 2018(02)
[8]生防菌R-4的鑒定及其對玉米南方銹病的防效[J]. 趙晨晨,焦鑄錦,龐發(fā)虎,王坦,王潞,李森,陶愛麗,黃思良. 玉米科學. 2017(02)
[9]皖北玉米南方銹病的發(fā)生及防治[J]. 謝守田. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2016(15)
[10]玉米南方銹病菌的超微結(jié)構(gòu)研究[J]. 邢國珍,李晶晶,肖繼斌,焦志鑫,劉娜,韓青梅,鄭文明. 中國農(nóng)學通報. 2016(18)
碩士論文
[1]中國玉米南方銹菌的分子遺傳多樣性和超微結(jié)構(gòu)研究[D]. 邢國珍.河南農(nóng)業(yè)大學 2011
本文編號:3601304
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/3601304.html
最近更新
教材專著