目的篩選酒精性肝病差異表達(dá)基因,并進(jìn)行功能分析,為酒精性肝病發(fā)病機(jī)制相關(guān)的分子標(biāo)志物及藥物靶點(diǎn)提供理論基礎(chǔ)。方法從高通量基因表達(dá)（GEO）數(shù)據(jù)庫中選取GSE28619,利用GEO2R進(jìn)行生物信息學(xué)分析,篩選差異表達(dá)基因,并利用DAVID數(shù)據(jù)庫對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行基因本體（GO）分析、京都基因與基因組百科全書（KEGG）通路富集分析;通過STRING數(shù)據(jù)庫和Cytoscape軟件構(gòu)建差異表達(dá)基因?qū)?yīng)的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)（PPI）,利用MCC算法,篩選出具有高度連接性的核心基因。結(jié)果通過對(duì)酒精性肝病組與正常肝臟組差異表達(dá)基因篩選,共獲得357個(gè)差異表達(dá)基因,其中上調(diào)基因190個(gè)、下調(diào)基因167個(gè)。差異表達(dá)基因主要涉及細(xì)胞外基質(zhì)-受體相互作用、黏著斑及p53等信號(hào)通路,通過PPI和Cytoscape軟件篩選出10個(gè)具有高度連接性的核心基因。結(jié)論通過對(duì)酒精性肝病基因芯片數(shù)據(jù)進(jìn)行挖掘,從基因水平探討酒精性肝病發(fā)生發(fā)展的分子生物學(xué)過程,為酒精性肝病發(fā)生的機(jī)制研究、標(biāo)志物的篩選提供參考。 

【文章來源】：現(xiàn)代實(shí)用醫(yī)學(xué). 2020,32(06)

【文章頁數(shù)】：4 頁

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]黏著斑激酶在酒精性肝病中作用的研究進(jìn)展[J]. 劉怡,沈哲,陳李華,虞朝輝,厲有名.  中華肝臟病雜志. 2013 (12)

博士論文
[1]酒精性肝病發(fā)生發(fā)展的基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 周寧.浙江大學(xué) 2013



本文編號(hào)：3591927