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豬體細(xì)胞核移植早期胚胎的合子基因激活及表觀遺傳修飾的研究

發(fā)布時(shí)間:2022-01-09 09:41
  在哺乳動(dòng)物胚胎發(fā)育過程中,合子基因激活作為一個(gè)里程碑式的事件,對(duì)于早期胚胎發(fā)育具有十分重要的意義。體細(xì)胞核移植(Somatic cell nuclear transfer,SCNT)胚胎中通常存在著異常的合子基因激活現(xiàn)象,異常的表觀遺傳修飾可能是造成合子基因激活障礙的重要因素之一。本研究以豬SCNT胚胎和體內(nèi)受精(In vivo fertilization,IVV)胚胎為研究對(duì)象,通過單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和基因芯片(PCR array)檢測(cè)技術(shù)研究了它們?cè)缙谂咛グl(fā)育過程中的合子基因激活情況以及84種表觀遺傳修飾酶的表達(dá)模式。結(jié)果顯示:(1)豬早期IVV胚胎的轉(zhuǎn)錄組呈現(xiàn)動(dòng)態(tài)的變化模式,4細(xì)胞之前以母源因子調(diào)控為主,在4細(xì)胞階段合子基因啟動(dòng)激活轉(zhuǎn)錄。對(duì)4種哺乳動(dòng)物早期胚胎的轉(zhuǎn)錄組/表達(dá)譜合并分析表明,合子激活是胚胎發(fā)育過程中一個(gè)物種保守的生物學(xué)事件,豬、人、小鼠和牛早期胚胎都具有其特有的合子基因激活時(shí)間和基因表達(dá)模式。四種哺乳動(dòng)物合子激活時(shí)期的差異表達(dá)基因在基因功能和通路上的富集大部分具有共通性,同時(shí)也有各自特異性,其中豬與牛最為相似;(2)比較豬IVV和SCNT早期胚胎的轉(zhuǎn)錄組圖譜發(fā)現(xiàn),豬早... 

【文章來源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:128 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【部分圖文】:

豬體細(xì)胞核移植早期胚胎的合子基因激活及表觀遺傳修飾的研究


RNA測(cè)序流程圖

原理圖,文庫(kù)構(gòu)建,原理圖,測(cè)序


圖 1.2 文庫(kù)構(gòu)建原理圖Fig 1.2 The schematic diagram of library constructio測(cè)序后,將不同文庫(kù)按照有效濃度及目標(biāo)下機(jī)數(shù)據(jù)量的 HiSeq/MiSeq 測(cè)序。信息學(xué)分析流程流程如圖 1.3:

流程圖,轉(zhuǎn)錄組,主成分分析,胚胎


圖 1.3 生物信息學(xué)分析流程圖Fig 1.3 The flow diagram of bioinformatic analysis結(jié)果母細(xì)胞及早期胚胎發(fā)育各階段轉(zhuǎn)錄組圖譜的建立取了發(fā)育各階段(MII 期卵母細(xì)胞、2 細(xì)胞、4 細(xì)胞、8 細(xì)胞及 IVV 胚胎進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,并對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行基因表 R 平臺(tái)下的 Deseq2 軟件包)。主成分分析結(jié)果表明,各實(shí)復(fù)性良好,證明了數(shù)據(jù)的可靠性(圖 1.4)。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]小鼠2細(xì)胞胚胎基因表達(dá)譜分析[J]. 呂志一,孫健紅,徐薇,蘇峰,權(quán)富生,華松,張涌.  西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2010(06)
[2]哺乳動(dòng)物胚胎基因組表達(dá)起始的調(diào)控[J]. 陳雯,陳杰,劉紅林.  畜牧與獸醫(yī). 2003(11)



本文編號(hào):3578460

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