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超突變結直腸癌預后預測基因模型的建立

發(fā)布時間:2022-01-07 13:49
  目的:結直腸癌作為發(fā)病率穩(wěn)居前列的癌種,根據(jù)基因組突變負荷高低可分為超突變和非超突變兩類。文獻報道發(fā)生超突變的患者比例可達15-17%,故此類患者的總人數(shù)不容小覷。越來越多的研究和臨床實踐發(fā)現(xiàn),發(fā)生超突變的結直腸癌患者與未發(fā)生超突變的患者在臨床病理特征、生存預后及治療方式上均存在明顯差異,尤其在傳統(tǒng)化療中,發(fā)生超突變的結直腸癌患者獲益有限,但其有較大可能從免疫治療中獲益。方法:收集浙江大學醫(yī)學院附屬第二醫(yī)院腫瘤研究所(ZJU)中隨訪超過24個月的患者術后的結直腸癌標本進行二代測序,選出其中超突變的患者,將該部分患者作為訓練集,運用R語言(3.6.0)及Python(3.4.0)進行加權運算,建立一個預測患者預后的模型,將超突變結直腸癌患者分為高危組和低危組。最后,從癌癥基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)庫中獲取匹配的人群作為獨立的驗證集,驗證得到基因預測模型,并合并所有患者展示最終的結果。結果:研究最終入組45例來自本中心(ZJU)的患者及24例來自TCGA數(shù)據(jù)庫的患者,建立一個包含四個基因(ACVR2A、APC、DOCK2和POLE)的用于預測超突變結直腸癌患者預后的模型。高危組患者的術后總... 

【文章來源】:浙江大學浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:56 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

超突變結直腸癌預后預測基因模型的建立


DNA測序流程圖

排列組合


浙江大學碩士學位論文?正文結果??亞組中可以區(qū)分患者危險度,且高危組患者與較差的預后明顯相關(HR?==丨2.57??95%CI:?1.57-100.69,尸=?0.002;圖?3.3C)。??表3.2運用多因素COX回歸模型校正四基因模型??HR?(95%?CI)?尸值??四基因模型?9.85?(2.07-46.81)?0.004??年齡?1.02?(0.98-1.06)?0.442??性別?2.49?(0.82-7.56)?0.108??TNM?分期?0.65?(0.28-1.49)?0.307??Distribution?of?10000?permutation?results??(TCGA?hypermutated?cohort)??

患者


Overall?Survival?(months)??No.?at?risk:??Htgh?risk?22?19?13?12?7?2?1??Low?risk?28?27?27?16?8?3?3??


本文編號:3574662

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