西瓜（Citrullus lanatus）是世界范圍內(nèi)廣泛種植的重要園藝作物,在早春露地栽培以及反季節(jié)設(shè)施栽培中常常遭遇低溫脅迫。研究西瓜在低溫脅迫下的基因表達(dá)模式,鑒定差異表達(dá)基因的功能,有助于進(jìn)一步了解西瓜低溫響應(yīng)及調(diào)控機制,為西瓜耐低溫遺傳改良提供理論支撐和基因資源。WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族成員數(shù)量多且具有重要功能,不僅影響植物生長發(fā)育過程,還能夠?qū)χ参锩媾R的各種脅迫產(chǎn)生響應(yīng)并發(fā)揮調(diào)控作用。低溫脅迫下的西瓜轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析結(jié)果顯示,多個WRKY家族基因的表達(dá)模式發(fā)生了顯著改變,表明WRKY能夠響應(yīng)低溫脅迫,但這些基因是否具有調(diào)控西瓜耐低溫的功能,目前尚不清楚。針對這一問題,本研究在分析西瓜WRKY基因家族特征的基礎(chǔ)上,鑒定了2個受低溫脅迫誘導(dǎo)顯著上調(diào)表達(dá)的WRKY基因Cla018059和Cla021170的功能,獲得了以下研究結(jié)果:1.西瓜WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族鑒定和特征分析。利用隱馬爾可夫模型,在西瓜基因組上鑒定出57個WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族成員,根據(jù)家族成員在染色體上的位置,依次命名為ClWRKY1^ClWRKY57。蛋白序列比對及系統(tǒng)發(fā)生分析表明,57個ClWRK... 

【文章來源】：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：73 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

西瓜ClWRKY轉(zhuǎn)錄因子各族WRKY保守結(jié)構(gòu)域序列特征

圖 3 擬南芥 AtWRKY 與西瓜 ClWRKY 蛋白的系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.3 Phylogenetic tree of arabidopsis AtWRKY and Watermelon ClWRKY proteins.1.3 西瓜 ClWRKY 轉(zhuǎn)錄因子家族基因結(jié)構(gòu)分析用GSDS 2.0工具繪制了西瓜ClWRKY 轉(zhuǎn)錄因子家族的基因結(jié)構(gòu)圖，結(jié)果見圖基因序列全長來看，57 個 ClWRKY 家族成員的全長序列在 0.7 kb~7 kb 之間。顯子數(shù)量上來看，西瓜 ClWRKY 轉(zhuǎn)錄因子家族基因的外顯子數(shù)量在 2~6 個之間中以外顯子數(shù)量為 3 個的 ClWRKY 家族成員最多，有 27 個；外顯子數(shù)量為 4 個lWRKY 家族成員數(shù)量次之，有 10 個；外顯子數(shù)量為 2 個的 ClWRKY 家族成員有；外顯子數(shù)量為 5 個的 ClWRKY 家族成員有 7 個；外顯子數(shù)量為 6 個的 ClWR族成員最少，僅有 3 個。從亞族上來看，I 族、IIa 族和 IIb 族的外顯子數(shù)量 4，其中以含 4 個外顯子的成員最多；其它亞族成員外顯子數(shù)量 2~3 個，含 3 個

Fig.3 Phylogenetic tree of arabidopsis AtWRKY and Watermelon ClWRKY proteins3.1.3 西瓜 ClWRKY 轉(zhuǎn)錄因子家族基因結(jié)構(gòu)分析用GSDS 2.0工具繪制了西瓜ClWRKY 轉(zhuǎn)錄因子家族的基因結(jié)構(gòu)圖，結(jié)果見圖4。從基因序列全長來看，57 個 ClWRKY 家族成員的全長序列在 0.7 kb~7 kb 之間。從外顯子數(shù)量上來看，西瓜 ClWRKY 轉(zhuǎn)錄因子家族基因的外顯子數(shù)量在 2~6 個之間，其中以外顯子數(shù)量為 3 個的 ClWRKY 家族成員最多，有 27 個；外顯子數(shù)量為 4 個的ClWRKY 家族成員數(shù)量次之，有 10 個；外顯子數(shù)量為 2 個的 ClWRKY 家族成員有 8個；外顯子數(shù)量為 5 個的 ClWRKY 家族成員有 7 個；外顯子數(shù)量為 6 個的 ClWRKY家族成員最少，僅有 3 個。從亞族上來看，I 族、IIa 族和 IIb 族的外顯子數(shù)量 4~6個

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]植物活性氧的產(chǎn)生及其作用和危害[J]. 張夢如,楊玉梅,成蘊秀,周滔,段曉艷,龔明,鄒竹榮.  西北植物學(xué)報. 2014(09)
[2]超氧化物歧化酶（SOD）的應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 董亮,何永志,王遠(yuǎn)亮,董志揚.  中國農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報. 2013(05)
[3]植物在低溫脅迫下的過氧化氫代謝及信號轉(zhuǎn)導(dǎo)[J]. 劉零怡,趙丹瑩,鄭楊,申琳,生吉萍.  園藝學(xué)報. 2009(11)
[4]植物超氧化物歧化酶（SOD）的研究進(jìn)展[J]. 馬旭俊,朱大海.  遺傳. 2003(02)
[5]植物過氧化物酶研究進(jìn)展[J]. 田國忠,李懷方,裘維蕃.  武漢植物學(xué)研究. 2001(04)
[6]西瓜幼苗耐低溫研究初報[J]. 許勇,王永健,張峰,張麗蓉.  華北農(nóng)學(xué)報. 1997(02)

碩士論文
[1]西瓜對低溫、弱光及其雙重脅迫的響應(yīng)分析[D]. 韓蘭蘭.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]不同烤煙品種抗寒性及相關(guān)生理生化指標(biāo)的研究[D]. 陳衛(wèi)國.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007



本文編號：3573194