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NSCLC的基因表達譜分析及miR210HG在NSCLC發(fā)病機制中的作用

發(fā)布時間:2022-01-06 18:16
  目的:通過NSCLC靜脈血基因測序及細胞實驗為NSCLC尋找診斷及治療的潛在靶點,探討LncRNA-miR210HG在NSCLC中的潛在作用。方法:該實驗采用單盲法,收集2019年就診于新疆醫(yī)科大學(xué)腫瘤醫(yī)院的NSCLC患者及門診體檢的健康人抽取外周靜脈血,通過RNA提取及對lncRNA及miRNA測序?qū)ふ绎@著差異基因,進行GO及KEGG分析。同時對體外NSCLC細胞通過沉默LncRNA-miR210HG對比前后miR210、HIF-1α、VEGF的表達水平差異。結(jié)果:通過對NSCLC患者及健康人外周靜脈血lncRNA及miRNA測序發(fā)現(xiàn),804個lncRNAs和2298個mRNAs差異表達(倍數(shù)變化LncRNA 2.0,P<0.0 5)。NSCLC外周血中425個lncRNAs和1013個miRNAs表達上調(diào),379個lncRNAs和1285個mRNAs表達下調(diào)。lncRNAs顯著上調(diào)的有MIAT、LINC02193、LINC02446等,顯著下調(diào)的有LINC01503、LINC00667、LINC01336等,涉及通路包括癌癥中的類屬轉(zhuǎn)錄、基因表達、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、cAMP信號通路、... 

【文章來源】:新疆醫(yī)科大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū)

【文章頁數(shù)】:55 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

NSCLC的基因表達譜分析及miR210HG在NSCLC發(fā)病機制中的作用


(A)NSCLC組與健康對照組靜脈血差異的lncRNAs分布聚類圖;(B)NSCLC組與健康對照組患者靜脈血差異的lncRNAs火山圖(C)NSCLC組與健康對照組患者靜脈血差異的mRNAs分布聚類圖;(D)NSCLC組與健康對照組患者靜脈血差異的mRNAs火山圖;

靶基因,本體,富集,基因


結(jié)合或ATP水解酶活性等;生物學(xué)途徑,指分子功能的有序組合,達成更廣的生物功能,如有絲分裂或嘌呤代謝等。GO分析表明,1028個預(yù)測的靶基因之間存在大量的功能重疊,其中包括800個上調(diào)mRNA和228個下調(diào)mRNA。生物過程、分子功能和細胞成分此外,它們還富含生物過程,包括細胞成分組織或生物遺傳、代謝過程、細胞增長、刺激反應(yīng)、細胞殺傷等;在細胞成分中包括細胞內(nèi)、細胞間、細胞質(zhì)、細胞器部分、細胞功能、病毒核心、分子復(fù)合物、細胞外基質(zhì)等;在分子功能中包括蛋白組合轉(zhuǎn)錄因子活性、化學(xué)引物活動和整合等,(P<0.01)(圖2)。圖2基因本體(GO)富集分析長非編碼RNA(LncRNAs)靶基因(mRNAs)。x軸代表GO術(shù)語,包括生物過程(藍色)、細胞成分(綠色)和分子功能(紅色),而y軸包括三個部分,左邊表示基因

醫(yī)科大,碩士學(xué)位,支鏈,論文


新疆醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文22C圖4:nc為空白對照組,(A):加入miR210mimic、inhibitor后miR210表達量;(B):加入miR210inhibitor后HIF、VEGF、miR210HG的表達量;(C)miR210mimic后HIF-1α、VEGF、miR210HG的表達量。(5)在NSCLCH1650細胞中,加入miR210HG抑制物使(miR210HGinhibitor)miR210HG表達抑制后,HIF與VEGF的表達明顯降低,miR210的表達明顯增加(圖6)。圖6:nc為空白對照組,2243代表miR210HG支鏈。

【參考文獻】:
期刊論文
[1]長鏈非編碼RNA-H19特異性吸附微RNA-760調(diào)控nanog基因表達促進非小細胞肺癌細胞增殖和遷移[J]. 李莎,朱怡卿,石薈,戈霞暉,許靖,商艷,王芳,白沖.  第二軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報. 2019(08)
[2]長鏈非編碼RNA PVT1對非小細胞肺癌細胞增殖和遷移能力的影響及其機制研究[J]. 張雙美,王斌,陳怡,張小火,施雪霏.  中華全科醫(yī)學(xué). 2019(06)
[3]長鏈非編碼RNA DLX6-AS1在非小細胞肺癌中的表達及其作用研究[J]. 朱多杰,王成,李斌,蔣鵬,楊建寶,宋鐵牛,魏小平,孟于琪.  重慶醫(yī)學(xué). 2019(03)



本文編號:3572937

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