NSCLC的基因表達(dá)譜分析及miR210HG在NSCLC發(fā)病機(jī)制中的作用
發(fā)布時(shí)間:2022-01-06 18:16
目的:通過(guò)NSCLC靜脈血基因測(cè)序及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)為NSCLC尋找診斷及治療的潛在靶點(diǎn),探討LncRNA-miR210HG在NSCLC中的潛在作用。方法:該實(shí)驗(yàn)采用單盲法,收集2019年就診于新疆醫(yī)科大學(xué)腫瘤醫(yī)院的NSCLC患者及門診體檢的健康人抽取外周靜脈血,通過(guò)RNA提取及對(duì)lncRNA及miRNA測(cè)序?qū)ふ绎@著差異基因,進(jìn)行GO及KEGG分析。同時(shí)對(duì)體外NSCLC細(xì)胞通過(guò)沉默LncRNA-miR210HG對(duì)比前后miR210、HIF-1α、VEGF的表達(dá)水平差異。結(jié)果:通過(guò)對(duì)NSCLC患者及健康人外周靜脈血lncRNA及miRNA測(cè)序發(fā)現(xiàn),804個(gè)lncRNAs和2298個(gè)mRNAs差異表達(dá)(倍數(shù)變化LncRNA 2.0,P<0.0 5)。NSCLC外周血中425個(gè)lncRNAs和1013個(gè)miRNAs表達(dá)上調(diào),379個(gè)lncRNAs和1285個(gè)mRNAs表達(dá)下調(diào)。lncRNAs顯著上調(diào)的有MIAT、LINC02193、LINC02446等,顯著下調(diào)的有LINC01503、LINC00667、LINC01336等,涉及通路包括癌癥中的類屬轉(zhuǎn)錄、基因表達(dá)、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、cAMP信號(hào)通路、...
【文章來(lái)源】:新疆醫(yī)科大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū)
【文章頁(yè)數(shù)】:55 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
(A)NSCLC組與健康對(duì)照組靜脈血差異的lncRNAs分布聚類圖;(B)NSCLC組與健康對(duì)照組患者靜脈血差異的lncRNAs火山圖(C)NSCLC組與健康對(duì)照組患者靜脈血差異的mRNAs分布聚類圖;(D)NSCLC組與健康對(duì)照組患者靜脈血差異的mRNAs火山圖;
結(jié)合或ATP水解酶活性等;生物學(xué)途徑,指分子功能的有序組合,達(dá)成更廣的生物功能,如有絲分裂或嘌呤代謝等。GO分析表明,1028個(gè)預(yù)測(cè)的靶基因之間存在大量的功能重疊,其中包括800個(gè)上調(diào)mRNA和228個(gè)下調(diào)mRNA。生物過(guò)程、分子功能和細(xì)胞成分此外,它們還富含生物過(guò)程,包括細(xì)胞成分組織或生物遺傳、代謝過(guò)程、細(xì)胞增長(zhǎng)、刺激反應(yīng)、細(xì)胞殺傷等;在細(xì)胞成分中包括細(xì)胞內(nèi)、細(xì)胞間、細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞器部分、細(xì)胞功能、病毒核心、分子復(fù)合物、細(xì)胞外基質(zhì)等;在分子功能中包括蛋白組合轉(zhuǎn)錄因子活性、化學(xué)引物活動(dòng)和整合等,(P<0.01)(圖2)。圖2基因本體(GO)富集分析長(zhǎng)非編碼RNA(LncRNAs)靶基因(mRNAs)。x軸代表GO術(shù)語(yǔ),包括生物過(guò)程(藍(lán)色)、細(xì)胞成分(綠色)和分子功能(紅色),而y軸包括三個(gè)部分,左邊表示基因
新疆醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文22C圖4:nc為空白對(duì)照組,(A):加入miR210mimic、inhibitor后miR210表達(dá)量;(B):加入miR210inhibitor后HIF、VEGF、miR210HG的表達(dá)量;(C)miR210mimic后HIF-1α、VEGF、miR210HG的表達(dá)量。(5)在NSCLCH1650細(xì)胞中,加入miR210HG抑制物使(miR210HGinhibitor)miR210HG表達(dá)抑制后,HIF與VEGF的表達(dá)明顯降低,miR210的表達(dá)明顯增加(圖6)。圖6:nc為空白對(duì)照組,2243代表miR210HG支鏈。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]長(zhǎng)鏈非編碼RNA-H19特異性吸附微RNA-760調(diào)控nanog基因表達(dá)促進(jìn)非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞增殖和遷移[J]. 李莎,朱怡卿,石薈,戈霞暉,許靖,商艷,王芳,白沖. 第二軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(08)
[2]長(zhǎng)鏈非編碼RNA PVT1對(duì)非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞增殖和遷移能力的影響及其機(jī)制研究[J]. 張雙美,王斌,陳怡,張小火,施雪霏. 中華全科醫(yī)學(xué). 2019(06)
[3]長(zhǎng)鏈非編碼RNA DLX6-AS1在非小細(xì)胞肺癌中的表達(dá)及其作用研究[J]. 朱多杰,王成,李斌,蔣鵬,楊建寶,宋鐵牛,魏小平,孟于琪. 重慶醫(yī)學(xué). 2019(03)
本文編號(hào):3572937
【文章來(lái)源】:新疆醫(yī)科大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū)
【文章頁(yè)數(shù)】:55 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
(A)NSCLC組與健康對(duì)照組靜脈血差異的lncRNAs分布聚類圖;(B)NSCLC組與健康對(duì)照組患者靜脈血差異的lncRNAs火山圖(C)NSCLC組與健康對(duì)照組患者靜脈血差異的mRNAs分布聚類圖;(D)NSCLC組與健康對(duì)照組患者靜脈血差異的mRNAs火山圖;
結(jié)合或ATP水解酶活性等;生物學(xué)途徑,指分子功能的有序組合,達(dá)成更廣的生物功能,如有絲分裂或嘌呤代謝等。GO分析表明,1028個(gè)預(yù)測(cè)的靶基因之間存在大量的功能重疊,其中包括800個(gè)上調(diào)mRNA和228個(gè)下調(diào)mRNA。生物過(guò)程、分子功能和細(xì)胞成分此外,它們還富含生物過(guò)程,包括細(xì)胞成分組織或生物遺傳、代謝過(guò)程、細(xì)胞增長(zhǎng)、刺激反應(yīng)、細(xì)胞殺傷等;在細(xì)胞成分中包括細(xì)胞內(nèi)、細(xì)胞間、細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞器部分、細(xì)胞功能、病毒核心、分子復(fù)合物、細(xì)胞外基質(zhì)等;在分子功能中包括蛋白組合轉(zhuǎn)錄因子活性、化學(xué)引物活動(dòng)和整合等,(P<0.01)(圖2)。圖2基因本體(GO)富集分析長(zhǎng)非編碼RNA(LncRNAs)靶基因(mRNAs)。x軸代表GO術(shù)語(yǔ),包括生物過(guò)程(藍(lán)色)、細(xì)胞成分(綠色)和分子功能(紅色),而y軸包括三個(gè)部分,左邊表示基因
新疆醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文22C圖4:nc為空白對(duì)照組,(A):加入miR210mimic、inhibitor后miR210表達(dá)量;(B):加入miR210inhibitor后HIF、VEGF、miR210HG的表達(dá)量;(C)miR210mimic后HIF-1α、VEGF、miR210HG的表達(dá)量。(5)在NSCLCH1650細(xì)胞中,加入miR210HG抑制物使(miR210HGinhibitor)miR210HG表達(dá)抑制后,HIF與VEGF的表達(dá)明顯降低,miR210的表達(dá)明顯增加(圖6)。圖6:nc為空白對(duì)照組,2243代表miR210HG支鏈。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]長(zhǎng)鏈非編碼RNA-H19特異性吸附微RNA-760調(diào)控nanog基因表達(dá)促進(jìn)非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞增殖和遷移[J]. 李莎,朱怡卿,石薈,戈霞暉,許靖,商艷,王芳,白沖. 第二軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(08)
[2]長(zhǎng)鏈非編碼RNA PVT1對(duì)非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞增殖和遷移能力的影響及其機(jī)制研究[J]. 張雙美,王斌,陳怡,張小火,施雪霏. 中華全科醫(yī)學(xué). 2019(06)
[3]長(zhǎng)鏈非編碼RNA DLX6-AS1在非小細(xì)胞肺癌中的表達(dá)及其作用研究[J]. 朱多杰,王成,李斌,蔣鵬,楊建寶,宋鐵牛,魏小平,孟于琪. 重慶醫(yī)學(xué). 2019(03)
本文編號(hào):3572937
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