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盾葉薯蕷轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫構(gòu)建及薯蕷皂苷合成相關(guān)基因挖掘

發(fā)布時(shí)間:2022-01-05 06:28
  薯蕷皂苷為甾體皂苷類化合物中的一種,具有抗腫瘤、消炎止痛等活性。同時(shí),薯蕷皂素作為薯蕷皂苷合成途徑的上游物質(zhì),在藥物工業(yè)生產(chǎn)中,薯蕷皂素是合成300多種甾醇類激素的前體物質(zhì),藥品制造產(chǎn)業(yè)每年對它的消耗量都很大,因此薯蕷皂素具有“藥用黃金”的稱號。然而,薯蕷皂苷合成途徑至今未被完全解析,其合成路徑中的相關(guān)基因很多都未被分離。盾葉薯蕷為我國特有種,其是目前薯蕷皂苷元含量最高的植物。本研究以其為研究材料,構(gòu)建了同一時(shí)期不同組織或同一組織不同時(shí)期的轉(zhuǎn)錄組文庫,經(jīng)過對轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫的分析,我們挖掘到了一些與薯蕷皂苷(元)合成途徑的候選基因密切相關(guān)的功能基因。主要研究成果如下:(1)通過對三個(gè)盾葉薯蕷的樣本(AugR、AugL、NovR)的cDNA文庫進(jìn)行測序,分別得到45367360、55798190、42564054條RawReads,對RawReads過濾后,又分別得到43234636、40686226、53330426條Clean Reads。Clean Read拼接后共得到176406條Transcripts,143245條... 

【文章來源】:中國科學(xué)院大學(xué)(中國科學(xué)院武漢植物園)湖北省

【文章頁數(shù)】:65 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

盾葉薯蕷轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫構(gòu)建及薯蕷皂苷合成相關(guān)基因挖掘


幾種三萜皂苷物質(zhì)的結(jié)構(gòu)圖

盾葉薯蕷,主要化學(xué)成分,植物名稱,薯蕷屬植物


圖 1.4 盾葉薯蕷主要化學(xué)成分組成及含量Figure 1.4 The main chemical composition and content of D. zingiberensis表 1.1 部分薯蕷屬植物中薯蕷皂苷元含量Table 1.1 The content of diosgenin in some plants Dioscorea植物名稱 薯蕷皂苷元含量(%)D. zingiberensis 1.05~16.15D. parviflora 3.40~3.90D. niponica 2%~2.4%D. niponica.subsp.rostthornii 0.30~2.55D. gracillima 0.44~2.90D. collettii 0.50~2.70

薯蕷皂苷,薯蕷皂苷元,盾葉薯蕷


圖 3.1 盾葉薯蕷及其薯蕷皂苷元和薯蕷皂苷含量圖igure3.1 The content of diosgenin and diosgenin in D.zingibereniberensis in November; B. D.zingiberensis in August; C, The conteiosgenin in D.zingiberensist letters on the bar indicate a significant difference at p < 0.05 basedr models with Bonferroni multicomparison tests. 年 5 月采集的盾葉薯蕷葉片材料標(biāo)記為 Aug_L(圖 3. Aug_R(圖 3.1B),2015 年 11 月采集的盾葉薯蕷根狀8 A)。高效液相色譜法(HPLC)檢測植物材料的薯蕷,發(fā)現(xiàn) Aug_R 薯蕷皂苷元及薯蕷皂苷含量都是最高的:


本文編號:3569916

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