應(yīng)用基因芯片技術(shù)篩選曲古菌素A誘導(dǎo)肺腺癌耐藥細胞株A549/CDDP差異表達的凋亡基因
發(fā)布時間:2024-06-29 14:16
目的應(yīng)用基因芯片技術(shù)篩選曲古菌素A(TSA)處理順鉑耐藥肺癌細胞株A549/CDDP后的凋亡相關(guān)基因的表達變化,篩選TSA治療順鉑耐藥肺癌的靶分子。方法 TSA處理A549/CDDP細胞24h,以未經(jīng)TSA處理的A549/CDDP細胞作為對照組,提取兩組細胞總RNA并反轉(zhuǎn)錄為c DNA,采用Nimble Gen全基因組表達芯片檢測基因表達情況,以Nimble Scan 2.5軟件結(jié)合GO分析比較TSA處理組與對照組基因表達譜的變化,從差異表達基因中篩選出與凋亡和增殖相關(guān)的基因。結(jié)果與對照組相比,共篩選到TSA上調(diào)的凋亡相關(guān)基因85個以及下調(diào)的細胞增殖和生長相關(guān)基因43個。GO分析發(fā)現(xiàn),這些基因的分子功能主要是調(diào)節(jié)細胞凋亡和細胞對化學刺激的抵抗作用,以及參與細胞生長、增殖、細胞生物質(zhì)量維持等生物過程。TSA不僅激活了線粒體凋亡通路,而且激活了死亡受體相關(guān)凋亡通路,下調(diào)了與細胞耐藥相關(guān)的基因BAG3和ABCC2。結(jié)論 TSA改變了A549/CDDP細胞中凋亡和增殖基因的表達,這些基因可能在TSA治療順鉑耐藥肺癌中發(fā)揮了重要作用。
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料和試劑
1.2 方法
1.2.1 細胞培養(yǎng)與處理
1.2.2 總RNA的提取和反轉(zhuǎn)錄
1.2.3 基因芯片雜交
1.2.4 實時定量PCR驗證
1.3 統(tǒng)計學處理
2 結(jié)果
2.1 熒光染色檢測TSA誘導(dǎo)凋亡結(jié)果
2.2 總RNA抽提結(jié)果
2.3芯片檢測結(jié)果
2.4 實時定量PCR驗證
2.5 GO富集分析結(jié)果
3 討論
本文編號:3997678
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1 材料與方法
1.1 材料和試劑
1.2 方法
1.2.1 細胞培養(yǎng)與處理
1.2.2 總RNA的提取和反轉(zhuǎn)錄
1.2.3 基因芯片雜交
1.2.4 實時定量PCR驗證
1.3 統(tǒng)計學處理
2 結(jié)果
2.1 熒光染色檢測TSA誘導(dǎo)凋亡結(jié)果
2.2 總RNA抽提結(jié)果
2.3芯片檢測結(jié)果
2.4 實時定量PCR驗證
2.5 GO富集分析結(jié)果
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