焦磷酸測序技術(shù)對腸促胰素作用相關(guān)基因的SNP位點(diǎn)分型
發(fā)布時(shí)間:2021-12-23 07:37
目的探討腸促胰素作用相關(guān)基因的5個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)rs7903146、rs12617656、rs4664443、rs3765467、rs10423928與二肽基肽酶(DPP)-4抑制劑療效的相關(guān)性。方法收集35例2型糖尿。═2DM)患者的外周血樣本,自行設(shè)計(jì)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)擴(kuò)增引物和測序引物,優(yōu)化擴(kuò)增條件,應(yīng)用焦磷酸測序儀進(jìn)行測序和基因型分析。并使用Sanger測序法對臨床樣本進(jìn)行二次驗(yàn)證,確保焦磷酸測序法的準(zhǔn)確性。結(jié)果建立的PCR結(jié)合焦磷酸測序方法經(jīng)Sanger測序驗(yàn)證,35例臨床樣本5個(gè)位點(diǎn)的基因分型結(jié)果完全一致。結(jié)論建立的PCR結(jié)合焦磷酸測序方法快速、準(zhǔn)確、成本低,適用于后序研究中對腸促胰素作用相關(guān)基因的單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點(diǎn)分型。
【文章來源】:中國老年學(xué)雜志. 2020,40(16)北大核心
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
2例患者5個(gè)SNP位點(diǎn)PCR產(chǎn)物凝膠電泳結(jié)果
對35例患者5個(gè)SNP位點(diǎn)的基因多態(tài)性進(jìn)行了焦磷酸測序,檢測信噪比高,非特異峰的比例均在 10%以內(nèi),多態(tài)位點(diǎn)基因型可清晰判斷,檢測成功率100%。為了驗(yàn)證方法的準(zhǔn)確性,同時(shí)采用Sanger測序技術(shù)對上述患者的 5個(gè) SNP位點(diǎn)進(jìn)行測序,測序結(jié)果見圖2~6,分型結(jié)果見表2。兩種方法的基因分型結(jié)果完全一致,35例患者5個(gè)SNP位點(diǎn)的突變比例與已報(bào)道的文獻(xiàn)結(jié)果相接近[5,8-10]。圖3 rs10423928多態(tài)性典型測序
rs10423928多態(tài)性典型測序
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]達(dá)格列凈聯(lián)合Dpp4抑制劑治療2型糖尿病的臨床療效[J]. 李新巖,馮曉玲,張潔,王思瑤. 藥物生物技術(shù). 2019(04)
[2]二肽基肽酶4抑制劑對2型糖尿病患者骨代謝影響的研究進(jìn)展[J]. 汝子萱,叢麗. 中國糖尿病雜志. 2019(07)
[3]高分辨率熔解曲線法在GLP1R基因多態(tài)性位點(diǎn)rs3765467檢測中的應(yīng)用[J]. 張遠(yuǎn),何霞,鐘磊,串俊蘭,龍恩武. 中國藥房. 2017(17)
[4]應(yīng)用焦磷酸測序技術(shù)快速檢測豬流感病毒金剛烷胺耐藥性的分子標(biāo)簽[J]. 劉華雷,呂艷,黃偉堅(jiān),鄢明華,張維,李明義,王清華,李金明,鄭東霞,趙云玲,孫承英,王志亮. 微生物學(xué)報(bào). 2010(03)
[5]堿基序列標(biāo)記法結(jié)合焦磷酸測序測定不同來源基因表達(dá)量[J]. 張曉丹,武海萍,陳之遙,周國華. 分析化學(xué). 2009(08)
碩士論文
[1]TCF7L2基因rs7903146 C/T、rs12255372 G/T多態(tài)性與妊娠期糖尿病發(fā)病關(guān)系研究[D]. 李云.福建醫(yī)科大學(xué) 2016
[2]DPP-4基因多態(tài)性在中國2型糖尿病人群中的分布及其與血脂關(guān)系的研究[D]. 邢曉敏.山東大學(xué) 2015
本文編號(hào):3548074
【文章來源】:中國老年學(xué)雜志. 2020,40(16)北大核心
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
2例患者5個(gè)SNP位點(diǎn)PCR產(chǎn)物凝膠電泳結(jié)果
對35例患者5個(gè)SNP位點(diǎn)的基因多態(tài)性進(jìn)行了焦磷酸測序,檢測信噪比高,非特異峰的比例均在 10%以內(nèi),多態(tài)位點(diǎn)基因型可清晰判斷,檢測成功率100%。為了驗(yàn)證方法的準(zhǔn)確性,同時(shí)采用Sanger測序技術(shù)對上述患者的 5個(gè) SNP位點(diǎn)進(jìn)行測序,測序結(jié)果見圖2~6,分型結(jié)果見表2。兩種方法的基因分型結(jié)果完全一致,35例患者5個(gè)SNP位點(diǎn)的突變比例與已報(bào)道的文獻(xiàn)結(jié)果相接近[5,8-10]。圖3 rs10423928多態(tài)性典型測序
rs10423928多態(tài)性典型測序
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]達(dá)格列凈聯(lián)合Dpp4抑制劑治療2型糖尿病的臨床療效[J]. 李新巖,馮曉玲,張潔,王思瑤. 藥物生物技術(shù). 2019(04)
[2]二肽基肽酶4抑制劑對2型糖尿病患者骨代謝影響的研究進(jìn)展[J]. 汝子萱,叢麗. 中國糖尿病雜志. 2019(07)
[3]高分辨率熔解曲線法在GLP1R基因多態(tài)性位點(diǎn)rs3765467檢測中的應(yīng)用[J]. 張遠(yuǎn),何霞,鐘磊,串俊蘭,龍恩武. 中國藥房. 2017(17)
[4]應(yīng)用焦磷酸測序技術(shù)快速檢測豬流感病毒金剛烷胺耐藥性的分子標(biāo)簽[J]. 劉華雷,呂艷,黃偉堅(jiān),鄢明華,張維,李明義,王清華,李金明,鄭東霞,趙云玲,孫承英,王志亮. 微生物學(xué)報(bào). 2010(03)
[5]堿基序列標(biāo)記法結(jié)合焦磷酸測序測定不同來源基因表達(dá)量[J]. 張曉丹,武海萍,陳之遙,周國華. 分析化學(xué). 2009(08)
碩士論文
[1]TCF7L2基因rs7903146 C/T、rs12255372 G/T多態(tài)性與妊娠期糖尿病發(fā)病關(guān)系研究[D]. 李云.福建醫(yī)科大學(xué) 2016
[2]DPP-4基因多態(tài)性在中國2型糖尿病人群中的分布及其與血脂關(guān)系的研究[D]. 邢曉敏.山東大學(xué) 2015
本文編號(hào):3548074
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