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焦磷酸測序技術對腸促胰素作用相關基因的SNP位點分型

發(fā)布時間:2021-12-23 07:37
  目的探討腸促胰素作用相關基因的5個單核苷酸多態(tài)性位點rs7903146、rs12617656、rs4664443、rs3765467、rs10423928與二肽基肽酶(DPP)-4抑制劑療效的相關性。方法收集35例2型糖尿。═2DM)患者的外周血樣本,自行設計聚合酶鏈式反應(PCR)擴增引物和測序引物,優(yōu)化擴增條件,應用焦磷酸測序儀進行測序和基因型分析。并使用Sanger測序法對臨床樣本進行二次驗證,確保焦磷酸測序法的準確性。結果建立的PCR結合焦磷酸測序方法經(jīng)Sanger測序驗證,35例臨床樣本5個位點的基因分型結果完全一致。結論建立的PCR結合焦磷酸測序方法快速、準確、成本低,適用于后序研究中對腸促胰素作用相關基因的單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點分型。 

【文章來源】:中國老年學雜志. 2020,40(16)北大核心

【文章頁數(shù)】:5 頁

【部分圖文】:

焦磷酸測序技術對腸促胰素作用相關基因的SNP位點分型


2例患者5個SNP位點PCR產(chǎn)物凝膠電泳結果

多態(tài),測序,位點


對35例患者5個SNP位點的基因多態(tài)性進行了焦磷酸測序,檢測信噪比高,非特異峰的比例均在 10%以內,多態(tài)位點基因型可清晰判斷,檢測成功率100%。為了驗證方法的準確性,同時采用Sanger測序技術對上述患者的 5個 SNP位點進行測序,測序結果見圖2~6,分型結果見表2。兩種方法的基因分型結果完全一致,35例患者5個SNP位點的突變比例與已報道的文獻結果相接近[5,8-10]。圖3 rs10423928多態(tài)性典型測序

多態(tài),測序


rs10423928多態(tài)性典型測序

【參考文獻】:
期刊論文
[1]達格列凈聯(lián)合Dpp4抑制劑治療2型糖尿病的臨床療效[J]. 李新巖,馮曉玲,張潔,王思瑤.  藥物生物技術. 2019(04)
[2]二肽基肽酶4抑制劑對2型糖尿病患者骨代謝影響的研究進展[J]. 汝子萱,叢麗.  中國糖尿病雜志. 2019(07)
[3]高分辨率熔解曲線法在GLP1R基因多態(tài)性位點rs3765467檢測中的應用[J]. 張遠,何霞,鐘磊,串俊蘭,龍恩武.  中國藥房. 2017(17)
[4]應用焦磷酸測序技術快速檢測豬流感病毒金剛烷胺耐藥性的分子標簽[J]. 劉華雷,呂艷,黃偉堅,鄢明華,張維,李明義,王清華,李金明,鄭東霞,趙云玲,孫承英,王志亮.  微生物學報. 2010(03)
[5]堿基序列標記法結合焦磷酸測序測定不同來源基因表達量[J]. 張曉丹,武海萍,陳之遙,周國華.  分析化學. 2009(08)

碩士論文
[1]TCF7L2基因rs7903146 C/T、rs12255372 G/T多態(tài)性與妊娠期糖尿病發(fā)病關系研究[D]. 李云.福建醫(yī)科大學 2016
[2]DPP-4基因多態(tài)性在中國2型糖尿病人群中的分布及其與血脂關系的研究[D]. 邢曉敏.山東大學 2015



本文編號:3548074

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